More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1120 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  53.72 
 
 		 710 aa  713    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 701 aa  1417    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  44.41 
 
 		 722 aa  598  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  44.46 
 
 		 757 aa  579  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  44.57 
 
 		 712 aa  567  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  44.52 
 
 		 722 aa  565  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  41.07 
 
 		 701 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  41.07 
 
 		 701 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  41.33 
 
 		 701 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  41.07 
 
 		 701 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  40.92 
 
 		 701 aa  505  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  40.49 
 
 		 701 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  41.03 
 
 		 703 aa  487  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  38.38 
 
 		 708 aa  488  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  38.59 
 
 		 711 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  41 
 
 		 689 aa  476  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  38.84 
 
 		 708 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  38.76 
 
 		 703 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  38.76 
 
 		 708 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  38.14 
 
 		 709 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  37.27 
 
 		 711 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  35.72 
 
 		 709 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  38.18 
 
 		 710 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  38.09 
 
 		 710 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  37.15 
 
 		 701 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  37.37 
 
 		 696 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  35.3 
 
 		 703 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  38.05 
 
 		 713 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  37.52 
 
 		 696 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  35.28 
 
 		 703 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  37.39 
 
 		 692 aa  416  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  36.01 
 
 		 720 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  36.01 
 
 		 720 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  36.07 
 
 		 702 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  36.07 
 
 		 702 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  35.57 
 
 		 720 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  34.57 
 
 		 720 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  36.04 
 
 		 715 aa  403  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  36.14 
 
 		 734 aa  405  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  35.44 
 
 		 714 aa  404  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  36.24 
 
 		 724 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  36.24 
 
 		 724 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  36.09 
 
 		 723 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  36.15 
 
 		 736 aa  397  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  35.44 
 
 		 720 aa  399  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  37.16 
 
 		 741 aa  393  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  35.37 
 
 		 732 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  35.23 
 
 		 714 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  35.78 
 
 		 722 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  37 
 
 		 715 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 707 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  34.9 
 
 		 689 aa  375  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  35.06 
 
 		 738 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  37.2 
 
 		 730 aa  372  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  33.75 
 
 		 699 aa  360  5e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  35.23 
 
 		 689 aa  357  5e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 720 aa  341  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  34.35 
 
 		 843 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  34.34 
 
 		 850 aa  335  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  32.4 
 
 		 862 aa  325  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  32.99 
 
 		 837 aa  312  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  34.28 
 
 		 817 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  32.92 
 
 		 815 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  33.62 
 
 		 809 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  32.45 
 
 		 721 aa  301  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  32.17 
 
 		 825 aa  300  7e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  32.9 
 
 		 796 aa  300  8e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  32.08 
 
 		 825 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  33.09 
 
 		 860 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  32.6 
 
 		 796 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  32.76 
 
 		 796 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  32.74 
 
 		 810 aa  295  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  34.28 
 
 		 795 aa  293  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  34.42 
 
 		 795 aa  293  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  31.05 
 
 		 864 aa  291  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  32.18 
 
 		 796 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  32.16 
 
 		 707 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  34.03 
 
 		 719 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  31.58 
 
 		 714 aa  287  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  31.58 
 
 		 714 aa  287  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  32.79 
 
 		 724 aa  286  8e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  31.58 
 
 		 677 aa  286  8e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  33.11 
 
 		 708 aa  286  9e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  30.78 
 
 		 705 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.24 
 
 		 706 aa  281  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 		 827 aa  279  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  33.91 
 
 		 742 aa  276  6e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  31.5 
 
 		 726 aa  274  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  33.72 
 
 		 881 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  33.72 
 
 		 881 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  33.72 
 
 		 882 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  33.58 
 
 		 921 aa  270  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  33.58 
 
 		 921 aa  270  8e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  33.58 
 
 		 881 aa  270  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 679 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  31.9 
 
 		 859 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  31.21 
 
 		 726 aa  268  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  32.22 
 
 		 709 aa  266  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  30.66 
 
 		 730 aa  260  6e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  31.86 
 
 		 766 aa  260  8e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>