More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I3047 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  100 
 
 		 1284 aa  2654    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  35.3 
 
 		 1437 aa  486  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 		 1403 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  42.86 
 
 		 1362 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  36.33 
 
 		 1354 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  44.08 
 
 		 1386 aa  456  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  42.31 
 
 		 1357 aa  448  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  37.97 
 
 		 1449 aa  421  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  37.88 
 
 		 1381 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  32.35 
 
 		 988 aa  396  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  31.74 
 
 		 1025 aa  396  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  41.4 
 
 		 1084 aa  386  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  41.4 
 
 		 1084 aa  386  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  36.52 
 
 		 1125 aa  381  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  42.02 
 
 		 1102 aa  370  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.9 
 
 		 1082 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  45.45 
 
 		 985 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.53 
 
 		 1112 aa  365  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  44.3 
 
 		 896 aa  365  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  34.59 
 
 		 977 aa  364  8e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  42.95 
 
 		 1080 aa  364  8e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  37.44 
 
 		 1086 aa  363  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  41.13 
 
 		 1082 aa  362  2e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  43.79 
 
 		 876 aa  360  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  44.54 
 
 		 914 aa  360  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  44.76 
 
 		 918 aa  359  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  44.03 
 
 		 1108 aa  358  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.71 
 
 		 982 aa  358  3.9999999999999996e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  43.52 
 
 		 1073 aa  355  2e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  40.08 
 
 		 1055 aa  356  2e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  43.99 
 
 		 1070 aa  355  2.9999999999999997e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.51 
 
 		 1139 aa  355  4e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  44.01 
 
 		 1209 aa  354  5e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  42.58 
 
 		 777 aa  355  5e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  43.1 
 
 		 1073 aa  354  5.9999999999999994e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  35.21 
 
 		 964 aa  354  7e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  43.52 
 
 		 1073 aa  354  7e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  43.67 
 
 		 1100 aa  353  8.999999999999999e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  43.52 
 
 		 1073 aa  353  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  42.57 
 
 		 1031 aa  353  1e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  32.65 
 
 		 1068 aa  353  1e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  42.98 
 
 		 1088 aa  353  2e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.49 
 
 		 1073 aa  352  3e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  37.62 
 
 		 1127 aa  352  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.99 
 
 		 1068 aa  351  5e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  37.14 
 
 		 1077 aa  351  5e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  41.04 
 
 		 1069 aa  350  1e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  44.01 
 
 		 666 aa  349  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  43.76 
 
 		 1120 aa  348  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  42.95 
 
 		 1130 aa  348  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  34.55 
 
 		 1068 aa  348  4e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  41.32 
 
 		 1069 aa  348  4e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  44.01 
 
 		 1105 aa  347  7e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  44.01 
 
 		 1105 aa  347  8e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  33.94 
 
 		 1068 aa  346  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  38.36 
 
 		 773 aa  345  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  43.05 
 
 		 1091 aa  346  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1091 aa  346  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  32.76 
 
 		 1021 aa  345  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  42.98 
 
 		 872 aa  345  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  44.3 
 
 		 663 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  42.48 
 
 		 1088 aa  343  1e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  42.48 
 
 		 1088 aa  342  2e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.89 
 
 		 1104 aa  342  2e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.41 
 
 		 1069 aa  342  2e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  35.12 
 
 		 1071 aa  342  2e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.4 
 
 		 1261 aa  343  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  41.83 
 
 		 1084 aa  342  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  31.5 
 
 		 1087 aa  341  5e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  42.73 
 
 		 1082 aa  340  7e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  37.65 
 
 		 1112 aa  340  9.999999999999999e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  37.63 
 
 		 1062 aa  340  9.999999999999999e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  41.87 
 
 		 1070 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  41.78 
 
 		 991 aa  338  3.9999999999999995e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.76 
 
 		 1129 aa  337  5.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.48 
 
 		 1089 aa  337  5.999999999999999e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  42.48 
 
 		 1082 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  41.23 
 
 		 1086 aa  337  7.999999999999999e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  39.4 
 
 		 1161 aa  337  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  42.48 
 
 		 1082 aa  336  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.04 
 
 		 1113 aa  335  3e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  34.63 
 
 		 1003 aa  335  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  40.04 
 
 		 1113 aa  335  3e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  37.59 
 
 		 1066 aa  335  4e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  41.05 
 
 		 903 aa  335  5e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  34.92 
 
 		 918 aa  334  8e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.64 
 
 		 1171 aa  333  1e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  34.75 
 
 		 918 aa  333  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  34.75 
 
 		 918 aa  333  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  34.75 
 
 		 918 aa  333  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  34.75 
 
 		 918 aa  333  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  42.83 
 
 		 1141 aa  332  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  41.89 
 
 		 1178 aa  333  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  34.98 
 
 		 918 aa  332  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  34.59 
 
 		 918 aa  331  5.0000000000000004e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  34.7 
 
 		 918 aa  331  6e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.8 
 
 		 1118 aa  331  7e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  34.87 
 
 		 918 aa  330  8e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  40.34 
 
 		 1134 aa  330  8e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  34.8 
 
 		 918 aa  330  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>