85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2482 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  100 
 
 		 976 aa  1973    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  28.44 
 
 		 336 aa  94.4  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2616  hypothetical protein  23.95 
 
 		 756 aa  91.7  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0412  hypothetical protein  23.06 
 
 		 817 aa  84  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  39.18 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3922  hypothetical protein  31.3 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  33.33 
 
 		 450 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  23.1 
 
 		 709 aa  66.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  37.84 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  29.69 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  25.95 
 
 		 588 aa  63.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  36.19 
 
 		 423 aa  63.5  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  27.83 
 
 		 530 aa  62.8  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1513  hypothetical protein  42.86 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  31.03 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0853  ATPase  32.65 
 
 		 445 aa  60.1  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  22.92 
 
 		 418 aa  60.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  21.91 
 
 		 556 aa  58.9  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1645  ATPase  34.48 
 
 		 451 aa  58.2  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  24.07 
 
 		 533 aa  58.2  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0945  ATPase  37.5 
 
 		 448 aa  57  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0181  ATPase  36.59 
 
 		 457 aa  56.2  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.269249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  35.21 
 
 		 457 aa  55.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  30.11 
 
 		 443 aa  54.7  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  36.46 
 
 		 203 aa  53.9  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4944  AAA ATPase  32.24 
 
 		 540 aa  53.9  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.051172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0196  hypothetical protein  30 
 
 		 654 aa  53.9  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  21.32 
 
 		 395 aa  54.3  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  31.53 
 
 		 452 aa  54.3  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7321  AAA ATPase  34.25 
 
 		 455 aa  54.3  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  40 
 
 		 251 aa  53.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  21.84 
 
 		 769 aa  53.5  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  35.37 
 
 		 176 aa  52.8  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  24.56 
 
 		 736 aa  52.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  26.74 
 
 		 421 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  40.54 
 
 		 228 aa  52  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  22.34 
 
 		 420 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3405  ATP-binding protein  34.25 
 
 		 454 aa  52  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00177365  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  29.25 
 
 		 708 aa  51.2  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  23.36 
 
 		 414 aa  50.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.98 
 
 		 616 aa  50.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  27.78 
 
 		 442 aa  50.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  26.92 
 
 		 455 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5923  hypothetical protein  31.68 
 
 		 461 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6344  AAA ATPase  23.26 
 
 		 537 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  27.82 
 
 		 619 aa  49.3  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  34.86 
 
 		 416 aa  49.3  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  24.74 
 
 		 452 aa  49.3  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0901  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.39 
 
 		 672 aa  49.3  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  27.27 
 
 		 666 aa  49.3  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  22.94 
 
 		 410 aa  48.9  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  31.51 
 
 		 257 aa  48.9  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  24.18 
 
 		 495 aa  48.5  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  37.74 
 
 		 360 aa  48.1  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3632  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  27.87 
 
 		 691 aa  48.1  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208084  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  31.91 
 
 		 464 aa  48.1  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  19.67 
 
 		 390 aa  47.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  26.28 
 
 		 461 aa  47.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  21.74 
 
 		 388 aa  47.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  21.74 
 
 		 388 aa  47.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  19.67 
 
 		 390 aa  47.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  38.46 
 
 		 258 aa  47  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.35 
 
 		 429 aa  47.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  30.97 
 
 		 382 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  31.52 
 
 		 562 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  30.43 
 
 		 482 aa  46.6  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  22.54 
 
 		 497 aa  47  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  30.97 
 
 		 382 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  22.78 
 
 		 369 aa  45.8  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1859  hypothetical protein  41.27 
 
 		 464 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  22.9 
 
 		 387 aa  45.8  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  32.97 
 
 		 448 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  32.97 
 
 		 448 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  30 
 
 		 454 aa  45.8  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  30.56 
 
 		 1224 aa  45.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  22.67 
 
 		 623 aa  45.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0007  AAA ATPase  34.18 
 
 		 380 aa  45.4  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0031  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.1 
 
 		 379 aa  45.1  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.20195 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1432  ABC transporter related  36.99 
 
 		 260 aa  45.1  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  22.67 
 
 		 415 aa  44.7  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0391  hypothetical protein  25.78 
 
 		 571 aa  44.7  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000199178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  28.57 
 
 		 422 aa  44.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  36 
 
 		 532 aa  44.7  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3577  hypothetical protein  27.17 
 
 		 458 aa  44.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.292222 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  24.14 
 
 		 392 aa  44.3  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>