205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1530 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  100 
 
 		 227 aa  444  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  78.67 
 
 		 225 aa  348  3e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  66.08 
 
 		 229 aa  293  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.93 
 
 		 228 aa  291  6e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  63.11 
 
 		 229 aa  261  6e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  58.59 
 
 		 713 aa  251  6e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  51.97 
 
 		 713 aa  229  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  53.07 
 
 		 717 aa  227  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  49.78 
 
 		 738 aa  223  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  49.32 
 
 		 717 aa  223  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  52.83 
 
 		 716 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  50.47 
 
 		 231 aa  218  5e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  52.75 
 
 		 722 aa  218  6e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  55.56 
 
 		 722 aa  216  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  50 
 
 		 233 aa  215  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.83 
 
 		 722 aa  214  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  50.24 
 
 		 716 aa  208  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  50 
 
 		 712 aa  206  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  49.78 
 
 		 236 aa  204  8e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  48.2 
 
 		 717 aa  203  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  42.99 
 
 		 704 aa  196  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  43.12 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  48.17 
 
 		 720 aa  186  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  45.5 
 
 		 746 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  49.13 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  42.79 
 
 		 239 aa  174  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.29 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  40.98 
 
 		 258 aa  162  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  43.75 
 
 		 224 aa  159  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  42.41 
 
 		 224 aa  154  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  43.6 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  40.44 
 
 		 226 aa  149  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  48.65 
 
 		 705 aa  149  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  42.86 
 
 		 224 aa  141  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0929  SNARE associated Golgi protein  42.53 
 
 		 246 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000396402 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  34.06 
 
 		 714 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  33.65 
 
 		 714 aa  111  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  34.11 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  30.63 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  33.68 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1919  hypothetical protein  34.83 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  34.89 
 
 		 246 aa  95.5  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  43.65 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  36.36 
 
 		 231 aa  91.7  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  32.78 
 
 		 264 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  40.14 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0644  hypothetical protein  30.51 
 
 		 244 aa  85.9  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.21783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  32.48 
 
 		 242 aa  85.5  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  32.98 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  32.56 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  34.15 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  32.9 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  30.73 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  34.62 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0336  SNARE associated Golgi protein  33.82 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100106  normal  0.720347 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  34.04 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  34.04 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  36.8 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  29.95 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1788  SNARE associated Golgi protein  29.52 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.249086 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  35.06 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  30.04 
 
 		 623 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  29.63 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  29.63 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  32.02 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  35.04 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  27.22 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  27.32 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  34.71 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  27.32 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  37.78 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  36.65 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  38.26 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  32.33 
 
 		 174 aa  72  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  33.83 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  26.7 
 
 		 724 aa  69.7  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  34.92 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  33.57 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  25.39 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0314  hypothetical protein  31.03 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  34.13 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6600  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.34 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  31.28 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  23.46 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  34.29 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  30.37 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0071  ribosomal protein S16  30.46 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.43 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  31.62 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  28.43 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  31.62 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0646  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.33 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  29.41 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4848  SNARE associated Golgi protein  34.29 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  27.54 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  27.97 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  32.19 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3864  SNARE associated Golgi protein  29.79 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  27.97 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>