85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002434 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0899  hypothetical protein  78.69 
 
 		 431 aa  727    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03626  hypothetical protein  82.9 
 
 		 427 aa  760    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002434  deacetylase DA1  100 
 
 		 427 aa  889    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0564  polysaccharide deacetylase  67.14 
 
 		 424 aa  600  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1438  polysaccharide deacetylase  47.17 
 
 		 375 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2943  polysaccharide deacetylase  47.17 
 
 		 375 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1411  polysaccharide deacetylase  47.17 
 
 		 375 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1402  polysaccharide deacetylase  47.17 
 
 		 375 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  36 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  35.87 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2175  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  44 
 
 		 221 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0810  polysaccharide deacetylase family protein  35.06 
 
 		 305 aa  54.3  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00210366  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0538  polysaccharide deacetylase  33.72 
 
 		 323 aa  53.5  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0863369  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  32.08 
 
 		 479 aa  53.1  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4727  polysaccharide deacetylase  34.94 
 
 		 357 aa  53.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000111297  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1488  polysaccharide deacetylase  39.71 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.373553  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1863  polysaccharide deacetylase family protein  36.76 
 
 		 324 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00543619  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1758  polysaccharide deacetylase family protein  38.24 
 
 		 320 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00010235  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0823  polysaccharide deacetylase family protein  35.06 
 
 		 305 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000472378  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1521  polysaccharide deacetylase family protein  39.71 
 
 		 332 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0654867  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1802  polysaccharide deacetylase family protein  39.71 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.12203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1582  polysaccharide deacetylase family protein  35.29 
 
 		 324 aa  50.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00773707  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2063  polysaccharide deacetylase  27.07 
 
 		 283 aa  50.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 		 300 aa  50.1  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  43.48 
 
 		 484 aa  50.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  28.46 
 
 		 479 aa  49.7  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 275 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  31.25 
 
 		 275 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 275 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 275 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 275 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  40.74 
 
 		 258 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  35.53 
 
 		 372 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  25.49 
 
 		 344 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 275 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 275 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 276 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  35.62 
 
 		 261 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  30.77 
 
 		 481 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2237  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 215 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 		 233 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  27.75 
 
 		 573 aa  47.8  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 275 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  54.05 
 
 		 652 aa  47.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00270  deacetylase, putative  31.3 
 
 		 253 aa  47.8  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  31.39 
 
 		 387 aa  47  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  30.49 
 
 		 522 aa  47  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1573  polysaccharide deacetylase  32.08 
 
 		 197 aa  47  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0080  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  34.78 
 
 		 162 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  35.62 
 
 		 353 aa  46.6  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  37.14 
 
 		 211 aa  46.6  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  38.16 
 
 		 234 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 275 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  36.23 
 
 		 279 aa  46.2  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2908  polysaccharide deacetylase  32.88 
 
 		 280 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.850515  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  38.16 
 
 		 234 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  30.08 
 
 		 373 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0405  polysaccharide deacetylase  32.1 
 
 		 234 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0408  peptidoglycan GlcNAc deacetylase  37.84 
 
 		 240 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  48.78 
 
 		 271 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3196  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase A  32.35 
 
 		 280 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.220844  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  36.76 
 
 		 247 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl558  putative chitin deacetylase  38.03 
 
 		 247 aa  45.1  0.003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  34.29 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 		 242 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  33.78 
 
 		 321 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  36.11 
 
 		 234 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  35.53 
 
 		 234 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  35.62 
 
 		 267 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1625  polysaccharide deacetylase  30.3 
 
 		 212 aa  44.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 		 234 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  36.99 
 
 		 1120 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  36.84 
 
 		 234 aa  43.9  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  32.18 
 
 		 243 aa  43.9  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  34.25 
 
 		 260 aa  43.9  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 		 354 aa  43.9  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1834  polysaccharide deacetylase  33.78 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2571  polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 		 235 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  32.05 
 
 		 305 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3342  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 		 430 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1185  polysaccharide deacetylase  36.73 
 
 		 279 aa  43.5  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.471915 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1074  polysaccharide deacetylase  34.25 
 
 		 320 aa  43.1  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0121745  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  35.21 
 
 		 273 aa  43.1  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  35 
 
 		 871 aa  43.1  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  35.53 
 
 		 234 aa  43.1  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>