More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001852 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02855  hypothetical protein  60.17 
 
 		 615 aa  766    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001852  ABC-type dipeptide transport system component  100 
 
 		 608 aa  1256    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003025  ABC-type dipeptide transport system component  57.83 
 
 		 612 aa  747    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.561815  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0869  extracellular solute-binding protein  61.74 
 
 		 626 aa  780    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00641  ABC oligopeptide transporter periplasmic component  92.12 
 
 		 609 aa  1176    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0942  extracellular solute-binding protein  41.91 
 
 		 621 aa  477  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0985  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  34.52 
 
 		 645 aa  312  1e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00011806  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1853  extracellular solute-binding protein family 5  32.24 
 
 		 734 aa  302  9e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0988  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, peptide-binding protein  30.69 
 
 		 647 aa  251  3e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.356739  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1685  extracellular solute-binding protein family 5  28.48 
 
 		 668 aa  250  5e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0732988  normal  0.758738 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 633 aa  135  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1538  extracellular solute-binding protein  23.69 
 
 		 609 aa  129  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  24.42 
 
 		 615 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2182  extracellular solute-binding protein  22.43 
 
 		 610 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 551 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3719  extracellular solute-binding protein  23 
 
 		 611 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0280101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  24.96 
 
 		 615 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2153  extracellular solute-binding protein  21.89 
 
 		 597 aa  115  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1718  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 		 611 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  24.82 
 
 		 622 aa  114  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4147  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  22.8 
 
 		 611 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  23.53 
 
 		 534 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2274  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 600 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  26.28 
 
 		 619 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3472  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 		 611 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3716  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.64 
 
 		 609 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0180  extracellular solute-binding protein family 5  23.03 
 
 		 607 aa  110  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0115715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  23.61 
 
 		 533 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3485  putative solute-binding protein  21.9 
 
 		 626 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  22.79 
 
 		 546 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2060  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 615 aa  107  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163136  normal  0.391933 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2061  extracellular solute-binding protein  22.2 
 
 		 616 aa  107  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409615  normal  0.170665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1759  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 		 609 aa  107  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.62 
 
 		 588 aa  106  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0535  putative peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.66 
 
 		 611 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2181  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 613 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41110  putative solute-binding protein  22.09 
 
 		 609 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.39 
 
 		 538 aa  105  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0289  ABC transporter extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 		 606 aa  105  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.44 
 
 		 524 aa  104  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1758  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 		 618 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0015  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 622 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  25.22 
 
 		 540 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 		 565 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0542  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.65 
 
 		 616 aa  101  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.22 
 
 		 622 aa  100  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.427067  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3717  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.42 
 
 		 618 aa  100  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0845  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 		 638 aa  100  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0910462 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0378  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 659 aa  100  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296975  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29650  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  23.06 
 
 		 613 aa  100  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000703906  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.83 
 
 		 615 aa  99.8  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3093  extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 		 640 aa  99.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3120  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 617 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  22.02 
 
 		 540 aa  99.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0010  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.32 
 
 		 610 aa  97.8  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3471  extracellular solute-binding protein  22.27 
 
 		 609 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.640162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 		 538 aa  96.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  23.57 
 
 		 576 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29640  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  20.98 
 
 		 609 aa  95.9  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113024  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3867  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 621 aa  95.9  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3073  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 622 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0249  extracellular solute-binding protein  20.87 
 
 		 670 aa  94.7  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1719  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 		 646 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2552  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 		 616 aa  94.4  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.437338  normal  0.0565568 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 510 aa  94.7  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 559 aa  94.7  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4146  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  21.93 
 
 		 609 aa  94  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1173  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  22.81 
 
 		 625 aa  94  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000592479  normal  0.415148 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1214  extracellular solute-binding protein  22.11 
 
 		 627 aa  94  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.454357 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37880  putative binding protein component of ABC transporter  22.73 
 
 		 602 aa  94  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00173754  normal  0.230207 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1108  extracellular solute-binding protein family 5  22.13 
 
 		 628 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.762365 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 604 aa  93.6  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  21.76 
 
 		 539 aa  92.8  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7054  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.72 
 
 		 614 aa  92  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.334122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5371  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  22.42 
 
 		 623 aa  91.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4214  extracellular solute-binding protein family 5  23.33 
 
 		 631 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2094  extracellular solute-binding protein  22.11 
 
 		 627 aa  91.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0469  extracellular solute-binding protein family 5  24.67 
 
 		 554 aa  91.7  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.208856 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  22.1 
 
 		 540 aa  91.3  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1964  extracellular solute-binding protein  22.11 
 
 		 627 aa  91.3  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 618 aa  91.3  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3718  extracellular solute-binding protein  22.44 
 
 		 590 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1014  extracellular solute-binding protein family 5  21.96 
 
 		 628 aa  90.9  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.517437  normal  0.0342428 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 604 aa  90.9  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2370  ABC transporter substrate binding protein (peptide)  21.56 
 
 		 615 aa  89.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3729  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 605 aa  90.1  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 		 544 aa  89.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 508 aa  89.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2129  extracellular solute-binding protein  22.06 
 
 		 627 aa  89.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.641802  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1104  extracellular solute-binding protein family 5  23.36 
 
 		 622 aa  89  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1645  extracellular solute-binding protein family 5  20.56 
 
 		 602 aa  89.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.819399  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0448  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.86 
 
 		 628 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189227  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7055  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  21.61 
 
 		 614 aa  89.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0391894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.13 
 
 		 531 aa  89.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3534  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 626 aa  89.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.173833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3166  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 615 aa  88.6  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0244  ABC transporter substrate binding protein (peptide)  23.61 
 
 		 631 aa  88.6  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1636  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  22.42 
 
 		 654 aa  88.2  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106746  normal  0.365226 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  25.43 
 
 		 575 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0379  extracellular solute-binding protein  23.09 
 
 		 628 aa  87.8  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>