More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000978 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  98.1 
 
 		 422 aa  841    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  100 
 
 		 422 aa  858    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  66.82 
 
 		 419 aa  591  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2438  hypothetical protein  43.78 
 
 		 406 aa  339  5e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2530  hypothetical protein  37.26 
 
 		 407 aa  242  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0995274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1098  hypothetical protein  32.33 
 
 		 429 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0142755  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7413  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.77 
 
 		 405 aa  187  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  29.08 
 
 		 441 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2394  hypothetical protein  30.19 
 
 		 406 aa  167  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48898  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5639  hypothetical protein  32.88 
 
 		 387 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6004  hypothetical protein  32.61 
 
 		 405 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1621  protein of unknown function DUF214  30.48 
 
 		 404 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6148  hypothetical protein  32.66 
 
 		 405 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.315368 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  30.63 
 
 		 416 aa  157  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1622  protein of unknown function DUF214  32.85 
 
 		 413 aa  155  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0369  hypothetical protein  30.27 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6495  hypothetical protein  32.61 
 
 		 405 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96926 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  27.93 
 
 		 436 aa  150  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19660  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  31.33 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0370  hypothetical protein  30.73 
 
 		 409 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2395  hypothetical protein  28.75 
 
 		 404 aa  146  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.111806  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  27.38 
 
 		 412 aa  123  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  29.41 
 
 		 415 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2374  ABC-type transport system, permease component  29.41 
 
 		 409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000200206  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.76 
 
 		 419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2089  protein of unknown function DUF214  24.76 
 
 		 405 aa  110  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00149352  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2020  protein of unknown function DUF214  27 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000619382  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.75 
 
 		 419 aa  106  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  29.19 
 
 		 406 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  28.53 
 
 		 830 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  25.12 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23240  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  23.54 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  23.15 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1691  protein of unknown function DUF214  32.82 
 
 		 295 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05402  hypothetical protein  24.04 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  27.37 
 
 		 425 aa  91.3  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2901  hypothetical protein  28 
 
 		 411 aa  87.4  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0934048 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.26 
 
 		 416 aa  86.7  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3143  efflux ABC transporter, permease protein  28.51 
 
 		 475 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183035  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6689  hypothetical protein  24.07 
 
 		 465 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874754  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2344  ABC transporter, permease protein, putative  28.11 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3257  efflux ABC transporter, permease protein  28.51 
 
 		 475 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.289143  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2085  putative ABC transporter, permease protein  28.51 
 
 		 475 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01072  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2376  efflux ABC transporter, permease protein  28.51 
 
 		 475 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1391  efflux ABC transporter, permease protein  28.51 
 
 		 475 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2535  protein of unknown function DUF214  25.75 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1112  efflux ABC transporter, permease protein  28.51 
 
 		 475 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1472  putative permease  28.4 
 
 		 716 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  27.99 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3743  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.7 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3231  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.73 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113164  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5136  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.73 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5146  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.44 
 
 		 417 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.83 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1446  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.21 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05401  hypothetical protein  25.14 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  25.56 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3700  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.97 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8164 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2498  hypothetical protein  24.08 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00553555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.54 
 
 		 421 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3383  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.86 
 
 		 409 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  24.33 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0507  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.15 
 
 		 427 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1566  ABC lipoprotein efflux pump, inner membrane subunit  25.71 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.764315  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2567  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.71 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.0571791 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23270  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.87 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2660  hypothetical protein  28.12 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  23.56 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3197  hypothetical protein  26.37 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2659  hypothetical protein  24.85 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1949  hypothetical protein  22.46 
 
 		 475 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519015  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  27.19 
 
 		 420 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.48 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.24 
 
 		 411 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2669  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.94 
 
 		 415 aa  76.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.61 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1056  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.89 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.530836  normal  0.504254 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.72 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5401  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.57 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1761  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.71 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.81 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0435  hypothetical protein  24.29 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.131989  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2509  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418191  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2497  hypothetical protein  23.73 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1430  hypothetical protein  24.31 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1468  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.79 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.94 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  24.41 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0960  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  27.82 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.0249332 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1076  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.84 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0609031  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1199  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.85 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.132324 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  26.3 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.3 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0890  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  50 
 
 		 502 aa  73.9  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001464  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  24.22 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  26.82 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0856  protein of unknown function DUF214  23.75 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0205588  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2233  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.19 
 
 		 409 aa  72.8  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1429  hypothetical protein  27.2 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2903  hypothetical protein  25.23 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.110934 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>