More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0514 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  82.18 
 
 		 404 aa  680    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  100 
 
 		 404 aa  822    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  83.17 
 
 		 404 aa  687    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  74.75 
 
 		 404 aa  629  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  62.34 
 
 		 406 aa  515  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  62 
 
 		 407 aa  510  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  61.1 
 
 		 407 aa  510  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  62.34 
 
 		 407 aa  507  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  63.16 
 
 		 408 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  63.16 
 
 		 408 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  62.91 
 
 		 408 aa  504  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  60.85 
 
 		 406 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  60.85 
 
 		 406 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  60.85 
 
 		 406 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  60.85 
 
 		 406 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  62.34 
 
 		 407 aa  503  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  60.85 
 
 		 406 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  60.1 
 
 		 406 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  60.1 
 
 		 406 aa  498  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  60.1 
 
 		 406 aa  498  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  60.1 
 
 		 406 aa  498  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  60.1 
 
 		 406 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  60.1 
 
 		 406 aa  498  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  60.1 
 
 		 406 aa  498  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  60.1 
 
 		 406 aa  498  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  60.1 
 
 		 406 aa  498  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  61.08 
 
 		 406 aa  489  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 405 aa  372  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  45.79 
 
 		 405 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  45.3 
 
 		 434 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  44.75 
 
 		 416 aa  362  1e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  45.2 
 
 		 408 aa  353  2.9999999999999997e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1780  transcriptional regulator Mic  39.65 
 
 		 406 aa  306  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  39.4 
 
 		 406 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0485397 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  39.4 
 
 		 406 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  39.4 
 
 		 406 aa  306  6e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01563  DNA-binding transcriptional repressor  39.4 
 
 		 406 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2049  ROK familiy protein  39.4 
 
 		 406 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.688141  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01553  hypothetical protein  39.4 
 
 		 406 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  39.4 
 
 		 406 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  38.65 
 
 		 407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1668  transcriptional regulator Mic  39.4 
 
 		 406 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  38.15 
 
 		 405 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2283  ROK family protein  38.65 
 
 		 405 aa  301  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.060664 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  38.65 
 
 		 406 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  37.35 
 
 		 405 aa  297  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  38.4 
 
 		 406 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  37.62 
 
 		 405 aa  296  4e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  38.4 
 
 		 406 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  38.4 
 
 		 406 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  38.4 
 
 		 406 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1981  ROK family protein  38.37 
 
 		 405 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1869  Mlc protein  38.37 
 
 		 405 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472832  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  36.14 
 
 		 405 aa  292  8e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  32 
 
 		 396 aa  192  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  28.32 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  29.49 
 
 		 408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  28.57 
 
 		 410 aa  182  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  28.33 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.74 
 
 		 391 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  29.08 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  29.46 
 
 		 410 aa  170  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  27.18 
 
 		 388 aa  169  7e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  28.38 
 
 		 383 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  28.61 
 
 		 385 aa  168  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  28.23 
 
 		 396 aa  168  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  30.37 
 
 		 390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  26.81 
 
 		 407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  29.2 
 
 		 397 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  26.93 
 
 		 378 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  28.43 
 
 		 398 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  26.89 
 
 		 401 aa  160  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  29.14 
 
 		 418 aa  159  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  28.91 
 
 		 389 aa  159  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  28.43 
 
 		 399 aa  159  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  30.27 
 
 		 315 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  30.27 
 
 		 315 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  28.42 
 
 		 409 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  28.21 
 
 		 408 aa  157  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  29.34 
 
 		 386 aa  154  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  29.12 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  27.78 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  27.42 
 
 		 404 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  29.32 
 
 		 403 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  28.18 
 
 		 401 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  30.42 
 
 		 408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  25.87 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  28.49 
 
 		 364 aa  147  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  27.58 
 
 		 402 aa  146  5e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  27.42 
 
 		 400 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  29.48 
 
 		 425 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  29.13 
 
 		 402 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  25.84 
 
 		 393 aa  143  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  28.83 
 
 		 395 aa  143  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  28.72 
 
 		 402 aa  142  8e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0206  NagC family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 404 aa  142  9e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.520067  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  26.55 
 
 		 420 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  29.09 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  25.13 
 
 		 388 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  28.77 
 
 		 389 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>