283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0841 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  100 
 
 
317 aa  644    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  43.67 
 
 
316 aa  259  6e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  43.4 
 
 
318 aa  237  2e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  36.91 
 
 
319 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  36.39 
 
 
318 aa  202  9e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  35.83 
 
 
317 aa  188  9e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  30.31 
 
 
326 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  34.94 
 
 
325 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  34.52 
 
 
316 aa  159  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  35.12 
 
 
325 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  35.12 
 
 
325 aa  159  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  35.12 
 
 
325 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  35.12 
 
 
325 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  35.12 
 
 
325 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  32.52 
 
 
325 aa  155  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 
325 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  35.88 
 
 
325 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  32.09 
 
 
324 aa  152  5e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  33.78 
 
 
325 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  30.65 
 
 
326 aa  147  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  32.61 
 
 
332 aa  145  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0191  ornithine cyclodeaminase  31.86 
 
 
312 aa  144  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0529745 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  34.17 
 
 
323 aa  142  6e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  29.75 
 
 
324 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  33.75 
 
 
323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  30.4 
 
 
329 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3083  ornithine cyclodeaminase  31.75 
 
 
344 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  27.91 
 
 
327 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  36.09 
 
 
326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  31.76 
 
 
338 aa  135  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  32.02 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  32.84 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  31.37 
 
 
324 aa  132  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  33.02 
 
 
319 aa  132  6e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  37.3 
 
 
302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  31.09 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  30.95 
 
 
328 aa  129  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  35.74 
 
 
326 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  34.98 
 
 
342 aa  129  7.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  32.42 
 
 
329 aa  129  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4650  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.9 
 
 
304 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4227  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.2 
 
 
304 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  31.71 
 
 
310 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  31.29 
 
 
328 aa  127  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  32.93 
 
 
330 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4262  ornithine cyclodeaminase  32.17 
 
 
335 aa  123  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3617  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.49 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.12 
 
 
332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3634  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.34 
 
 
325 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  31.29 
 
 
320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1829  ornithine cyclodeaminase  28.76 
 
 
320 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  32.43 
 
 
313 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  30.13 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  34.72 
 
 
328 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  28.79 
 
 
317 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  31.48 
 
 
336 aa  116  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0976  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.85 
 
 
318 aa  116  6e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.888301  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.95 
 
 
303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  31.69 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  31.69 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1395  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33 
 
 
325 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  26.64 
 
 
333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  34.82 
 
 
320 aa  113  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2245  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.7 
 
 
310 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.425748  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  27.76 
 
 
316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.67 
 
 
306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2556  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.69 
 
 
306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.370427  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  26.75 
 
 
329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2415  ornithine cyclodeaminase  34.6 
 
 
322 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151404  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  28.43 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  28.79 
 
 
323 aa  110  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  32.48 
 
 
318 aa  109  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  28.79 
 
 
319 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.24 
 
 
351 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  27.97 
 
 
321 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  27.03 
 
 
333 aa  107  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.8 
 
 
305 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  31.09 
 
 
359 aa  106  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  29.85 
 
 
338 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  25.89 
 
 
314 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1386  ornithine cyclodeaminase  26.89 
 
 
320 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  26.23 
 
 
321 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  27.59 
 
 
345 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  28.66 
 
 
330 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  26.14 
 
 
331 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  26.23 
 
 
331 aa  102  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.8 
 
 
310 aa  102  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  31.67 
 
 
313 aa  102  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  33.17 
 
 
319 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  31.12 
 
 
345 aa  101  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  28.08 
 
 
311 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  30.23 
 
 
329 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.56 
 
 
346 aa  100  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32 
 
 
348 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  32.24 
 
 
332 aa  99.8  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  26.52 
 
 
318 aa  99.4  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6348  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31 
 
 
301 aa  99.4  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  33.66 
 
 
330 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  32.08 
 
 
314 aa  99  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  27.25 
 
 
321 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0455278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>