More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1197 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1197  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 247 aa  488  1e-137  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  26.7 
 
 		 547 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  24.62 
 
 		 549 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  26.38 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  24.62 
 
 		 549 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  24.62 
 
 		 549 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  27.94 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  24.61 
 
 		 550 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  27.75 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  26.79 
 
 		 544 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  24.76 
 
 		 551 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  24.76 
 
 		 551 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  26.64 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  24.79 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  27.67 
 
 		 538 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6057  MscS Mechanosensitive ion channel  24.71 
 
 		 779 aa  69.7  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4903  MscS mechanosensitive ion channel  26.73 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  23.63 
 
 		 540 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1220  MscS mechanosensitive ion channel  30.14 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  24.37 
 
 		 547 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  26.24 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1867  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.04 
 
 		 480 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0456814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  25.14 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  31.76 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  23.81 
 
 		 533 aa  64.7  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2389  MscS mechanosensitive ion channel  24.5 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  23.98 
 
 		 534 aa  63.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  29.14 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2427  MscS mechanosensitive ion channel  26.7 
 
 		 550 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1189  MscS Mechanosensitive ion channel  26.94 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1640  mechanosensitive ion channel  29.14 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0204845  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  30.41 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0330  hypothetical protein  25.94 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  25.37 
 
 		 421 aa  62.8  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1280  MscS Mechanosensitive ion channel  24.14 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138834  normal  0.117258 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  26.46 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  24.08 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0314  potassium transport membrane protein  30.59 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  28.07 
 
 		 532 aa  62  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  31.33 
 
 		 351 aa  62  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  28.16 
 
 		 891 aa  62  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  24.26 
 
 		 563 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  24.34 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.59 
 
 		 479 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  28.16 
 
 		 785 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  25.29 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  30.64 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  26.1 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1534  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  24.12 
 
 		 501 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231252  normal  0.283254 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0444  MscS Mechanosensitive ion channel  24.36 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3271  putative small conductance mechanosensitive ion channel  23.76 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  20.51 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  23.88 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  23.56 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  23.27 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  23.46 
 
 		 561 aa  59.3  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  23.32 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  21.54 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0293  MscS mechanosensitive ion channel  24.71 
 
 		 447 aa  59.3  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  25.36 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  21.84 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  23.11 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3676  MscS Mechanosensitive ion channel  26.59 
 
 		 524 aa  58.9  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1298  MscS Mechanosensitive ion channel  22.49 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.861763  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0743  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 460 aa  58.9  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  26.88 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  26 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  35.85 
 
 		 268 aa  58.5  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  23.08 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0987  MscS Mechanosensitive ion channel  27.61 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  23.27 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  23.53 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  22.43 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1074  MscS mechanosensitive ion channel  27.33 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0868741  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  24.06 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  22.63 
 
 		 685 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1050  MscS mechanosensitive ion channel  27.98 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0883  potassium transport membrane protein, conjectural  27.88 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.301746  normal  0.339451 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  22.47 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2527  MscS mechanosensitive ion channel  23.28 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  25.84 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1853  MscS mechanosensitive ion channel  24.18 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02189  hypothetical protein  29.92 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  22.63 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4255  mechanosensitive (MS) ion channel protein  24.45 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4144  MscS mechanosensitive ion channel  24.45 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.789982 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  22.75 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2528  MscS mechanosensitive ion channel  28.31 
 
 		 817 aa  56.2  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290655  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1723  mechanosensitive ion channel family protein  25.61 
 
 		 545 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  23.56 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  32.58 
 
 		 373 aa  55.8  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  24.87 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  25.64 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  22.92 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0442  MscS Mechanosensitive ion channel  30.47 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  28.7 
 
 		 531 aa  55.5  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4436  MscS mechanosensitive ion channel  23.21 
 
 		 432 aa  55.5  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506103  normal  0.992693 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  19.58 
 
 		 794 aa  55.5  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13183  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  23.48 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>