More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3949 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  100 
 
 		 338 aa  679    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  50.84 
 
 		 330 aa  298  7e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  50 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  50.71 
 
 		 333 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  42.62 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  44.48 
 
 		 314 aa  255  7e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  44.48 
 
 		 314 aa  255  7e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  39.59 
 
 		 306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  39.27 
 
 		 313 aa  232  6e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  39.26 
 
 		 315 aa  231  2e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  39.87 
 
 		 310 aa  225  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  39.07 
 
 		 311 aa  225  9e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  39.53 
 
 		 310 aa  223  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  41.39 
 
 		 311 aa  223  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  41.78 
 
 		 313 aa  222  7e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  42.05 
 
 		 313 aa  222  9e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  43.79 
 
 		 311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  38.49 
 
 		 317 aa  220  3e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  38.87 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  39.19 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  40.28 
 
 		 312 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  40.28 
 
 		 326 aa  216  5e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  38.49 
 
 		 313 aa  216  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  41.36 
 
 		 327 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  38.69 
 
 		 320 aa  215  8e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  41.67 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  41.87 
 
 		 327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  40.34 
 
 		 327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  40.14 
 
 		 327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  43.56 
 
 		 318 aa  212  7.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  38.89 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  39.59 
 
 		 326 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  36.09 
 
 		 318 aa  209  4e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  40.97 
 
 		 311 aa  209  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  36.21 
 
 		 317 aa  209  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  41.39 
 
 		 322 aa  207  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  35.9 
 
 		 322 aa  205  8e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  37.29 
 
 		 320 aa  205  8e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  36.75 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  37.7 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  38.41 
 
 		 321 aa  203  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  34.78 
 
 		 317 aa  202  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  37.99 
 
 		 324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  36.42 
 
 		 319 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  34.11 
 
 		 312 aa  198  9e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  39.13 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  36.96 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  33.55 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  34.11 
 
 		 312 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  37.87 
 
 		 315 aa  195  9e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  34.11 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  38.28 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  40 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  38.66 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  37.54 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  41.53 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  39.31 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  40.26 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  40.07 
 
 		 314 aa  194  3e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  33.78 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  35.49 
 
 		 305 aa  193  4e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  39.2 
 
 		 314 aa  192  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  39.41 
 
 		 314 aa  192  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  40.4 
 
 		 332 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  41 
 
 		 311 aa  189  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  38.41 
 
 		 321 aa  189  8e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3397  Transketolase central region  35.9 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1018  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  37.83 
 
 		 637 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2235  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  38.03 
 
 		 622 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77755  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0883  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  37.38 
 
 		 635 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000207097 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  36 
 
 		 319 aa  186  5e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  37.37 
 
 		 320 aa  186  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3362  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  37.7 
 
 		 635 aa  186  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  35.76 
 
 		 318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  40.8 
 
 		 592 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1418  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  33.84 
 
 		 646 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793105  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2842  transketolase subunit B  36.09 
 
 		 317 aa  180  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.837175  normal  0.299247 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0718  transketolase, central region  37.29 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  36.6 
 
 		 312 aa  180  4e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1764  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  37.7 
 
 		 626 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0479282  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1717  Transketolase central region  37.42 
 
 		 347 aa  179  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  36.75 
 
 		 310 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  37.62 
 
 		 340 aa  179  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2822  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  35.86 
 
 		 635 aa  178  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.553695  normal  0.10664 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1667  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  37.5 
 
 		 634 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000640226  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1146  Transketolase domain protein  33.22 
 
 		 319 aa  176  4e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  37.14 
 
 		 335 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  34.43 
 
 		 320 aa  175  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1934  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  36.47 
 
 		 625 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2744  transketolase central region  37.95 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0728122  normal  0.0592981 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2182  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  34.42 
 
 		 625 aa  172  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0455646  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1398  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  36.39 
 
 		 629 aa  171  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  35.29 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  37.21 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  35.29 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3364  Transketolase domain protein  32.67 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  36 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3003  transketolase central region  36.18 
 
 		 340 aa  170  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2526  transketolase domain protein  35.1 
 
 		 317 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4383  Transketolase central region  38.49 
 
 		 342 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>