127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2192 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2192  precorrin-3B synthase  100 
 
 		 351 aa  674    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3106  precorrin-3B synthase  47.27 
 
 		 372 aa  269  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3429  precorrin-3B synthase  44.81 
 
 		 372 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal  0.446466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12100  cobalamin biosynthesis protein cobG  48.47 
 
 		 363 aa  249  7e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00940846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2489  precorrin-3B synthase  47.78 
 
 		 373 aa  245  6e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.333591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2534  precorrin-3B synthase  47.78 
 
 		 373 aa  245  6e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.35067  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2526  precorrin-3B synthase  47.78 
 
 		 373 aa  245  6e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2481  precorrin-3B synthase  45.11 
 
 		 378 aa  223  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0547656  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2494  nitrite/sulfite reductase hemoprotein subnit beta ferrodoxin domain-containing protein  47.21 
 
 		 367 aa  217  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.149164 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  37.01 
 
 		 439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0151  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta- component ferrodoxin domain protein  40.74 
 
 		 408 aa  188  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0576  precorrin-3B synthase  43.01 
 
 		 389 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.244524  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5592  Sulfite reductase beta subunit (hemoprotein)- like protein  43.15 
 
 		 473 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1519  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  38.12 
 
 		 481 aa  155  9e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0825166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1783  hypothetical protein  37.54 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17650  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  38.67 
 
 		 292 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220438  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  33.15 
 
 		 424 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  31.71 
 
 		 430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2211  precorrin-3B synthase  32.3 
 
 		 386 aa  107  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1626  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  41.67 
 
 		 335 aa  106  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.470677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  31.91 
 
 		 469 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  31.43 
 
 		 483 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  31.5 
 
 		 476 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.98 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5851  precorrin-3B synthase  32.79 
 
 		 434 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2894  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  48.59 
 
 		 282 aa  95.9  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.804468  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  30.53 
 
 		 443 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  33.59 
 
 		 464 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  29.95 
 
 		 431 aa  87  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  29.85 
 
 		 465 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  32.28 
 
 		 447 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  30 
 
 		 438 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  27.08 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  29.87 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  29.35 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  30.59 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  28.8 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  34.07 
 
 		 732 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1647  precorrin-3B synthase  34.06 
 
 		 482 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690908  normal  0.296785 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4824  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta subunit  33.33 
 
 		 478 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  34.62 
 
 		 454 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1194  precorrin-3B synthase  33.33 
 
 		 482 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0317253  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1674  precorrin-3B synthase  33.33 
 
 		 516 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242876  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1574  precorrin-3B synthase  33.85 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1245  putative oxidoreductase  44.6 
 
 		 510 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347263  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  29.82 
 
 		 570 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0341  precorrin-3B synthase  28.85 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  29.29 
 
 		 494 aa  63.9  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2439  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  33.52 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341511  normal  0.0829631 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  40 
 
 		 487 aa  62.8  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  24.74 
 
 		 604 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  25.87 
 
 		 590 aa  61.2  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5369  precorrin-3B synthase  33.33 
 
 		 507 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062725  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2150  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  37.76 
 
 		 478 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0291416  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  26.88 
 
 		 586 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3267  precorrin-3B synthase  30.19 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0180034 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  24.5 
 
 		 615 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  20.49 
 
 		 542 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  26.01 
 
 		 595 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3411  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  48.05 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  26.72 
 
 		 569 aa  57  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  26.97 
 
 		 569 aa  57  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  33.33 
 
 		 608 aa  56.2  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  25.07 
 
 		 639 aa  55.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2533  precorrin-3B synthase  38.82 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  32.54 
 
 		 456 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  27.88 
 
 		 571 aa  55.8  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  28.28 
 
 		 567 aa  55.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  38.27 
 
 		 536 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  24.74 
 
 		 510 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  29.34 
 
 		 560 aa  52.8  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  27.47 
 
 		 569 aa  52.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  27 
 
 		 581 aa  52.8  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1967  precorrin-3B synthase  40.23 
 
 		 482 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0190248  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  40.74 
 
 		 521 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1161  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  42.99 
 
 		 482 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326083  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2113  precorrin-3B synthase  42.99 
 
 		 482 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.46756  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1602  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  42.99 
 
 		 482 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.036421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0264  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  42.99 
 
 		 482 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540499  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1950  precorrin-3B synthase  42.99 
 
 		 482 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0588771  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0896  precorrin-3B synthase  42.99 
 
 		 482 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1438  precorrin-3B synthase  44 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  25.52 
 
 		 605 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  31.25 
 
 		 796 aa  50.1  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  36.14 
 
 		 513 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  37.04 
 
 		 516 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  36.14 
 
 		 513 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1188  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  38.67 
 
 		 289 aa  50.1  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445325  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7174  precorrin-3B synthase  41.79 
 
 		 460 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  38.1 
 
 		 479 aa  49.7  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  31.58 
 
 		 599 aa  49.3  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  32.23 
 
 		 586 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  32.54 
 
 		 486 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  26.5 
 
 		 581 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2541  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.48 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000365571  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  23.57 
 
 		 621 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.98 
 
 		 573 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  27.62 
 
 		 648 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  34.21 
 
 		 567 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1969  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  37.08 
 
 		 299 aa  46.6  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000637611  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>