70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0853 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0853  regulatory protein TetR  100 
 
 		 223 aa  427  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137644  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3333  transcriptional regulator, TetR family  51.52 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5811  TetR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2790  transcriptional regulator, TetR family  51.36 
 
 		 221 aa  192  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.765768  normal  0.318997 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0033  TetR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 221 aa  187  9e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3572  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 221 aa  171  6.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2557  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4274  transcriptional regulator, TetR family  35.02 
 
 		 220 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5659  regulatory protein TetR  33.94 
 
 		 221 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10458  transcriptional regulator  35.2 
 
 		 253 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3153  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2324  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18430  transcriptional regulator, tetR family  27.51 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0040  transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 248 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  26.06 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0346  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 196 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1527  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal  0.0248923 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  40.68 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1003  putative HTH-type transcriptional regulator  23.53 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 191 aa  46.2  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 424 aa  45.4  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 209 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 189 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  31.25 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0147  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0460  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466873  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  31.48 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 182 aa  43.1  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  27.56 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0620  nucleoid occlusion protein  29.91 
 
 		 197 aa  43.5  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000140669 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 197 aa  42.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1913  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000580043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1121  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 221 aa  42.4  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0059  nucleoid occlusion protein  21.24 
 
 		 200 aa  42  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0445493  normal  0.11202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3407  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 422 aa  42  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.282297 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 235 aa  42  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 221 aa  42  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4635  regulatory protein, TetR  30.61 
 
 		 226 aa  42  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 191 aa  42  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13075  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 226 aa  41.6  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.576817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 205 aa  41.6  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 208 aa  41.6  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 203 aa  41.6  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>