83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1445 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 239 aa  480  1e-135  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  66.95 
 
 		 239 aa  332  4e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  59.66 
 
 		 248 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1008  transcriptional regulator, TrmB  62.61 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0665446  hitchhiker  0.0000160236 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  32.63 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2233  transcriptional regulator, TrmB  28.69 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000408105 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1399  transcriptional regulator, TrmB  26.16 
 
 		 243 aa  98.6  8e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.913675  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  24.9 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  30.68 
 
 		 354 aa  68.6  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  34.25 
 
 		 233 aa  67  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  28.67 
 
 		 350 aa  65.1  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  29.79 
 
 		 354 aa  62.4  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  29.38 
 
 		 267 aa  62  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  29.08 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  26.12 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  28.08 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  26.14 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  26.39 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  27.08 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  38.71 
 
 		 352 aa  57  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  27.08 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  27.08 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  27.08 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  27.08 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  27.08 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  25.69 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  27.08 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  27.81 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  25.69 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3578  hypothetical protein  30.69 
 
 		 275 aa  55.1  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0712382 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  28.87 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  31.3 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  26.14 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  38.46 
 
 		 275 aa  53.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1148  transcriptional regulator, TrmB  24.31 
 
 		 363 aa  52.8  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  30.15 
 
 		 276 aa  52.8  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0705  transcriptional regulator TrmB  25.95 
 
 		 283 aa  52.4  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0131  transcriptional regulator, TrmB  28.97 
 
 		 356 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  35.64 
 
 		 264 aa  51.2  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  29.85 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  29.85 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  43.75 
 
 		 272 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  27.47 
 
 		 357 aa  48.9  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  28.78 
 
 		 260 aa  48.9  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2039  helix-turn-helix family DUF118  27.97 
 
 		 288 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  34.41 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  39.73 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  23.15 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4098  transcriptional regulator, TrmB  23.23 
 
 		 351 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  26.19 
 
 		 279 aa  46.6  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  41.79 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  24.79 
 
 		 262 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  38.16 
 
 		 262 aa  45.8  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1551  transcriptional regulator, TrmB  34.72 
 
 		 342 aa  45.8  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  36 
 
 		 271 aa  45.4  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 174 aa  45.4  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  29.86 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  22.7 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  25.54 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0691  transcriptional regulator, TrmB  34.25 
 
 		 143 aa  43.9  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  22.17 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1091  transcriptional regulator TrmB  21.77 
 
 		 386 aa  44.3  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  23.24 
 
 		 352 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1280  transcriptional regulator, TrmB  26.19 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.755111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  28.97 
 
 		 273 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  24.16 
 
 		 373 aa  43.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  42.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  33.73 
 
 		 344 aa  42.7  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1499  transcriptional regulator, TrmB  41.51 
 
 		 132 aa  42.4  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.148307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  27.61 
 
 		 324 aa  42.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  22.63 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  30.86 
 
 		 263 aa  42.4  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  22.63 
 
 		 261 aa  42  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  27.03 
 
 		 261 aa  42  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  21.64 
 
 		 261 aa  42  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1188  transcriptional regulator, TrmB  22.47 
 
 		 353 aa  42  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0102771  hitchhiker  0.00221829 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0762  transcriptional regulator-like protein  28.87 
 
 		 256 aa  42  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.239824 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  22.63 
 
 		 261 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  22.63 
 
 		 261 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  32.14 
 
 		 263 aa  42  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2175  transcriptional regulator TrmB  33.33 
 
 		 203 aa  42  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168136  normal  0.574645 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  23.62 
 
 		 257 aa  41.6  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>