258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1192 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1192  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 
289 aa  580  1e-164  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1900  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  81.66 
 
 
289 aa  503  1e-141  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1433  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  75.43 
 
 
289 aa  433  1e-120  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0971138  hitchhiker  0.00877932 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0300  ornithine cyclodeaminase  74.39 
 
 
288 aa  423  1e-117  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  39.43 
 
 
302 aa  125  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1799  ornithine cyclodeaminase  34.48 
 
 
298 aa  122  6e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0244  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.87 
 
 
304 aa  122  7e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0626622  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  35.86 
 
 
333 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  31.69 
 
 
328 aa  106  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  31.67 
 
 
326 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  30 
 
 
319 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  31.54 
 
 
338 aa  97.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  29.55 
 
 
319 aa  96.7  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  36.46 
 
 
303 aa  95.5  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  36.46 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  32.16 
 
 
313 aa  95.1  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  27.33 
 
 
326 aa  94.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.17 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3121  ornithine cyclodeaminase  35.91 
 
 
303 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135549 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  30.04 
 
 
326 aa  92.8  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.9 
 
 
309 aa  90.1  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  32.03 
 
 
317 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  30.22 
 
 
327 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  26.52 
 
 
326 aa  87  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  29.49 
 
 
320 aa  87  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.73 
 
 
296 aa  87  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  28.76 
 
 
324 aa  87  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  27.12 
 
 
318 aa  85.9  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.7 
 
 
323 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  28.29 
 
 
311 aa  85.5  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  32.62 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34775  predicted protein  29.08 
 
 
346 aa  85.1  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  27.46 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  27.44 
 
 
325 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  33.62 
 
 
323 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  33.52 
 
 
305 aa  82.4  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 
325 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  28.2 
 
 
325 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  33.46 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  26.46 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  28.18 
 
 
308 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  27.72 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  29.02 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  28.84 
 
 
325 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  27.17 
 
 
325 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  28.84 
 
 
325 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  27.44 
 
 
325 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.05 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.06 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  28.3 
 
 
325 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  29.94 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  32.4 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  28.14 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3998  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.02 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.37 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798228  normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  22.33 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3343  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.66 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0515229 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  27.9 
 
 
331 aa  75.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5043  Ornithine cyclodeaminase  30.46 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0731505  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  26.85 
 
 
329 aa  75.5  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  29.28 
 
 
345 aa  75.5  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  22.01 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  28.79 
 
 
359 aa  75.1  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.61 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.32 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1457  ornithine cyclodeaminase  36.42 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  28.01 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  32.11 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.24 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.31 
 
 
348 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  32.95 
 
 
316 aa  72  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  31.77 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4263  ornithine cyclodeaminase  31.17 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  28.46 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  25 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  29.87 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0191  ornithine cyclodeaminase  29.49 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0529745 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  26.51 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  27.19 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  26.67 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  27.62 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  31.38 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1386  ornithine cyclodeaminase  27.98 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  26.86 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  25.09 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  27.88 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.27 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1290  ornithine cyclodeaminase  35.62 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  26.23 
 
 
329 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30 
 
 
303 aa  67  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0266  ornithine cyclodeaminase  35.62 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0536  ornithine cyclodeaminase  35.62 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.29 
 
 
351 aa  67  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  28.92 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1031  ornithine cyclodeaminase  35.62 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1291  ornithine cyclodeaminase  34.57 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  25.44 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1371  ornithine cyclodeaminase  34.57 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  31.54 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>