More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0405 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0405  ABC transporter related  100 
 
 
270 aa  539  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2356  ABC transporter related  85.98 
 
 
269 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0860054  normal  0.372011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0028  ABC transporter related  79.78 
 
 
272 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3838  ABC transporter related  76.03 
 
 
276 aa  421  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.173965  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4066  ABC transporter related  78.28 
 
 
272 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.982341  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2428  ABC transporter related  66.42 
 
 
263 aa  342  4e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000399  ABC transporter substrate-binding protein  61.71 
 
 
273 aa  336  2.9999999999999997e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0627  ABC transporter related  64.29 
 
 
266 aa  336  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0541  ABC transporter related  64.66 
 
 
266 aa  331  7.000000000000001e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1593  ABC transporter related protein  61.74 
 
 
263 aa  331  8e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3132  ABC transporter-related protein  59.48 
 
 
272 aa  330  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318916  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1865  ABC transporter related  62.31 
 
 
299 aa  327  9e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4003  ABC transporter related  61.57 
 
 
276 aa  327  1.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1836  ABC transporter related  59.41 
 
 
273 aa  322  6e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0163403  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0120  ABC transporter related  59.7 
 
 
278 aa  321  7e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2286  ABC transporter related  61.36 
 
 
265 aa  320  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2606  ABC transporter-related protein  60.98 
 
 
272 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3505  ABC transporter component  60.89 
 
 
281 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4180  ABC transporter related  60.82 
 
 
279 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1555  ABC transporter related  60.08 
 
 
279 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1565  ABC transporter related  60.46 
 
 
279 aa  315  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.770039  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0053  ABC transporter related  58.05 
 
 
274 aa  315  5e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0381  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livF  59.18 
 
 
274 aa  314  9.999999999999999e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246654  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4576  ABC transporter related  59.33 
 
 
280 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3412  putative branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.94 
 
 
260 aa  312  4.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5719  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  59.4 
 
 
279 aa  311  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211944  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2222  ABC transporter related  58.15 
 
 
276 aa  308  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0254  ABC transporter related  55.56 
 
 
291 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.59163  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1154  ABC transporter related  55.39 
 
 
281 aa  305  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0941  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.51 
 
 
263 aa  305  6e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.678413  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_812  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  54.75 
 
 
263 aa  305  6e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0265  ABC transporter related  55.93 
 
 
271 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3360  ABC transporter related  56.77 
 
 
271 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0825  ABC transporter related  55.51 
 
 
263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  57.09 
 
 
276 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0949  ABC transporter related  57.09 
 
 
276 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0599  ABC transporter related  55.19 
 
 
269 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5290  ABC transporter related  56.06 
 
 
283 aa  299  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0301  ABC transporter related  58.21 
 
 
278 aa  298  5e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140254  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3537  ABC transporter related  54.44 
 
 
269 aa  298  6e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164335  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2304  ABC transporter related  58.21 
 
 
279 aa  298  7e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3612  ABC transporter related  54.07 
 
 
269 aa  298  7e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.513749 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5011  ABC transporter related  54.98 
 
 
270 aa  298  8e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0456  ABC transporter related  53.7 
 
 
269 aa  297  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.201413  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0219  ABC transporter-related protein  54.44 
 
 
271 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2720  ABC transporter related  56.02 
 
 
267 aa  296  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0782  ABC transporter-related protein  56.13 
 
 
274 aa  296  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0465  ABC transporter related  53.33 
 
 
269 aa  294  9e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.225794 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5034  ABC transporter related  56.25 
 
 
277 aa  294  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3439  ABC transporter-related protein  53.85 
 
 
270 aa  292  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0295626 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0564  ABC transporter ATP-binding protein  55.06 
 
 
267 aa  288  7e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202499  normal  0.0280468 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0140  ABC transporter-like protein  58.87 
 
 
272 aa  286  2.9999999999999996e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0377793  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1547  ABC transporter related protein  58.33 
 
 
276 aa  280  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0555  ABC transporter related  54.92 
 
 
253 aa  266  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.917289  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3000  ABC transporter related  51.63 
 
 
258 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0662104  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2753  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51 
 
 
257 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145163  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  49.05 
 
 
258 aa  247  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43710  ABC transporter, LivF family  52.89 
 
 
258 aa  245  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.236667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2986  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.89 
 
 
258 aa  244  8e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39811  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1426  ABC transporter related  51.19 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5150  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  49.79 
 
 
257 aa  241  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.915192  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2548  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  51.02 
 
 
264 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0518977  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  47.17 
 
 
257 aa  238  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  52.05 
 
 
235 aa  237  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  53.33 
 
 
235 aa  236  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  53.63 
 
 
240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  53.63 
 
 
240 aa  235  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4098  ABC transporter related  48.47 
 
 
286 aa  235  7e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  46.99 
 
 
265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  47.72 
 
 
236 aa  233  3e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  52.48 
 
 
259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  51.25 
 
 
234 aa  232  5e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4294  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 
258 aa  232  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637324  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  53.23 
 
 
240 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.75 
 
 
235 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3803  ABC transporter related  49.39 
 
 
253 aa  229  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00979813  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  50 
 
 
235 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  51.43 
 
 
237 aa  229  5e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  48.77 
 
 
239 aa  229  5e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7161  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  49.18 
 
 
266 aa  228  9e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  48.36 
 
 
239 aa  227  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1466  ABC transporter-like protein  51.44 
 
 
271 aa  227  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  53.14 
 
 
237 aa  227  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3495  ABC transporter related  49.17 
 
 
253 aa  226  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  45.23 
 
 
237 aa  226  4e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  52.42 
 
 
240 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.67 
 
 
234 aa  225  6e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  51.22 
 
 
239 aa  225  7e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3162  ABC transporter related protein  49.06 
 
 
265 aa  225  7e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0334428  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  49.59 
 
 
242 aa  224  8e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  50.41 
 
 
237 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3877  ABC transporter related  49.17 
 
 
254 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.221149 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  50.42 
 
 
235 aa  223  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1434  ABC transporter related  50.61 
 
 
265 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  hitchhiker  0.00000367864 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  47.95 
 
 
235 aa  223  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.75 
 
 
234 aa  223  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  53.75 
 
 
242 aa  223  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  50.2 
 
 
256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  51.85 
 
 
237 aa  222  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  50.61 
 
 
234 aa  221  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>