More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1865 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  63.02 
 
 		 693 aa  828    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  63.02 
 
 		 690 aa  829    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1441  translation initiation factor IF-2  69.64 
 
 		 685 aa  967    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.155659  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1865  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 692 aa  1374    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00943635  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0255  translation initiation factor IF-2  55.36 
 
 		 700 aa  740    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.405261  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  46.83 
 
 		 686 aa  623  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  46.58 
 
 		 692 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 732 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  46.87 
 
 		 903 aa  577  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  44.08 
 
 		 689 aa  570  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  44.41 
 
 		 686 aa  567  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  46.91 
 
 		 658 aa  568  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  44.56 
 
 		 686 aa  568  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  44.56 
 
 		 686 aa  568  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  44.41 
 
 		 686 aa  567  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  44.14 
 
 		 686 aa  567  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  49.32 
 
 		 739 aa  566  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  44.13 
 
 		 686 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  44.13 
 
 		 686 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  43.59 
 
 		 688 aa  558  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  42.61 
 
 		 688 aa  560  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  43.96 
 
 		 673 aa  561  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  47.09 
 
 		 822 aa  558  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  46.49 
 
 		 884 aa  546  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  42.73 
 
 		 679 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  42.24 
 
 		 679 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  46.67 
 
 		 883 aa  537  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  45.1 
 
 		 882 aa  536  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  45.08 
 
 		 921 aa  537  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0993  translation initiation factor IF-2  51.56 
 
 		 668 aa  533  1e-150  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000676499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  46.54 
 
 		 971 aa  534  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  46.74 
 
 		 845 aa  535  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  46.5 
 
 		 947 aa  530  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  46.86 
 
 		 924 aa  531  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  50.7 
 
 		 985 aa  529  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  47.01 
 
 		 1029 aa  531  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  46.27 
 
 		 922 aa  526  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  45.09 
 
 		 860 aa  526  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  45.13 
 
 		 882 aa  527  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  45.5 
 
 		 986 aa  525  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  46.75 
 
 		 920 aa  528  1e-148  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  41.38 
 
 		 689 aa  526  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  47.86 
 
 		 911 aa  521  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  45 
 
 		 980 aa  520  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  46.66 
 
 		 915 aa  521  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  45.84 
 
 		 968 aa  519  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  45.85 
 
 		 898 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  46.27 
 
 		 964 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  46.3 
 
 		 879 aa  515  1.0000000000000001e-145  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  45.36 
 
 		 876 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 888 aa  518  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  50.1 
 
 		 964 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  49.9 
 
 		 964 aa  515  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  44.67 
 
 		 907 aa  515  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  46.31 
 
 		 936 aa  513  1e-144  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0770  translation initiation factor IF-2  47.47 
 
 		 894 aa  512  1e-144  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  45.13 
 
 		 904 aa  509  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0300  translation initiation factor IF-2  46.48 
 
 		 952 aa  511  1e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0137727  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  46.34 
 
 		 854 aa  511  1e-143  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  44.96 
 
 		 882 aa  510  1e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  46.13 
 
 		 752 aa  507  9.999999999999999e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  49.9 
 
 		 975 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  46.87 
 
 		 927 aa  507  9.999999999999999e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  46.04 
 
 		 959 aa  507  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  43.97 
 
 		 894 aa  508  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  49.9 
 
 		 975 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  49.9 
 
 		 975 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  49.9 
 
 		 975 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  47.26 
 
 		 1022 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  45.7 
 
 		 964 aa  508  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  45.25 
 
 		 943 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  49.9 
 
 		 975 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  49.9 
 
 		 975 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  44.97 
 
 		 843 aa  506  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  49.9 
 
 		 975 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  45.56 
 
 		 1161 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  44.73 
 
 		 945 aa  507  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42820  translation initiation factor IF-2  46.34 
 
 		 836 aa  505  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914178  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1132  translation initiation factor IF-2  44.89 
 
 		 738 aa  504  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00703147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  49.5 
 
 		 976 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  44.65 
 
 		 989 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  45.55 
 
 		 885 aa  504  1e-141  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0398  translation initiation factor IF-2  46.25 
 
 		 986 aa  503  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0010836  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  44.5 
 
 		 979 aa  504  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  45.59 
 
 		 969 aa  504  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  45.08 
 
 		 943 aa  504  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2316  translation initiation factor IF-2  45.05 
 
 		 1116 aa  505  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.100815  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  44.01 
 
 		 949 aa  504  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  46.04 
 
 		 990 aa  504  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  46.14 
 
 		 991 aa  504  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  44.72 
 
 		 949 aa  504  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  44.05 
 
 		 882 aa  504  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_002936  DET0983  translation initiation factor IF-2  45.71 
 
 		 593 aa  499  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  49.12 
 
 		 868 aa  500  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1701  translation initiation factor IF-2  44.75 
 
 		 991 aa  499  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  44.84 
 
 		 966 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  42.81 
 
 		 891 aa  499  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  45.25 
 
 		 971 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3751  translation initiation factor IF-2  44.56 
 
 		 729 aa  501  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00372327  unclonable  0.0000243777 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  45.25 
 
 		 972 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>