105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2336 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2336  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  863    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0452  type III effector Hrp-dependent outers  56.18 
 
 		 455 aa  464  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.869243  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2454  type III effector Hrp-dependent outers  53.08 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3263  type III effector Hrp-dependent outers  37.83 
 
 		 454 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.197433  normal  0.0349209 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  31.11 
 
 		 423 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  30.41 
 
 		 423 aa  136  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  30.41 
 
 		 423 aa  136  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  30.65 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  33.09 
 
 		 262 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  29.81 
 
 		 427 aa  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  28.14 
 
 		 422 aa  106  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  27.39 
 
 		 430 aa  100  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0648  type III effector Hrp-dependent outers  28.77 
 
 		 428 aa  99.8  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1535  type III effector Hrp-dependent outers  28.8 
 
 		 425 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6294  type III effector Hrp-dependent outers  28.8 
 
 		 425 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830951  normal  0.498392 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0986  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  26.29 
 
 		 572 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0750  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  25.9 
 
 		 572 aa  98.2  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6953  hypothetical protein  28.96 
 
 		 425 aa  96.3  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  28.97 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3707  type III effector Hrp-dependent outers  28.31 
 
 		 439 aa  94.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000100596  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3536  type III effector Hrp-dependent outers  28.57 
 
 		 442 aa  91.3  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2989  hypothetical protein  40.26 
 
 		 390 aa  86.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.832553  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2422  type III effector Hrp-dependent outers  34.6 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.242091  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2153  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  26.91 
 
 		 572 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.819052  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0564  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  28.99 
 
 		 770 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.432239 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6106  hypothetical protein  35.32 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0923  hypothetical protein  25.06 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0306118  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0918  hypothetical protein  21.87 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2589  type III effector Hrp-dependent protein  32.73 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4427  hypothetical protein  32.23 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4643  hypothetical protein  27.1 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0336698  normal  0.133111 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8221  type III effector Hrp-dependent outers  28.37 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3566  hypothetical protein  35.86 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00898441  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1143  hypothetical protein  29.98 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5836  hypothetical protein  30.45 
 
 		 419 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.244996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  22.79 
 
 		 417 aa  67  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8126  type III effector Hrp-dependent outers  27.23 
 
 		 368 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302902  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5964  type III effector Hrp-dependent outers  27.96 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4366  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  28.94 
 
 		 721 aa  64.7  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  24.88 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  26.59 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  24.76 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1455  type III effector Hrp-dependent outers  35.29 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2429  type III effector Hrp-dependent outer protein  26.37 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  24.4 
 
 		 423 aa  57  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  27.29 
 
 		 422 aa  57  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  28.31 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1466  type III effector Hrp-dependent outers  26.11 
 
 		 366 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3980  hypothetical protein  31.54 
 
 		 353 aa  55.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0524  hypothetical protein  25 
 
 		 388 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000260703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  28.3 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2899  hypothetical protein  25.99 
 
 		 396 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328998  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1132  type III effector Hrp-dependent outers  26.94 
 
 		 424 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  27.12 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  25.28 
 
 		 420 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0654  hypothetical protein  36.36 
 
 		 411 aa  50.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603947  normal  0.367778 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  21.41 
 
 		 413 aa  50.1  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25801  hypothetical protein  32.19 
 
 		 480 aa  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  25.28 
 
 		 420 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  25.58 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  25.58 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  27.64 
 
 		 432 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  27.19 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  26.81 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3383  type III effector Hrp-dependent outers  30.99 
 
 		 419 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1025  type III effector Hrp-dependent outers  28.98 
 
 		 426 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3021  type III effector Hrp-dependent outers  29.93 
 
 		 438 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2151  hypothetical protein  33.72 
 
 		 356 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  23.77 
 
 		 420 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  23.77 
 
 		 420 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  23.77 
 
 		 420 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6266  hypothetical protein  32.06 
 
 		 354 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  27.37 
 
 		 427 aa  47.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  23.77 
 
 		 420 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  24.77 
 
 		 420 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  24.57 
 
 		 390 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0188  hypothetical protein  40 
 
 		 448 aa  47.4  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.46953  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  28.43 
 
 		 426 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  24.32 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  25.37 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1171  hypothetical protein  22.08 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0158  hypothetical protein  34.78 
 
 		 448 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  23.34 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2486  type III effector Hrp-dependent outers  29.21 
 
 		 511 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6443  hypothetical protein  27.78 
 
 		 353 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235172 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0504  hypothetical protein  38.61 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.257323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3730  type III effector Hrp-dependent outers  29.7 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  27.59 
 
 		 455 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  26.56 
 
 		 426 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  27.89 
 
 		 422 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  28.57 
 
 		 432 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4319  type III effector Hrp-dependent outers  26.22 
 
 		 426 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.369903  normal  0.109983 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  25.99 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1111  hypothetical protein  23.84 
 
 		 419 aa  43.9  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5074  type III effector Hrp-dependent outers  28.57 
 
 		 432 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0272  hypothetical protein  34.02 
 
 		 502 aa  43.5  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1035  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  24.14 
 
 		 792 aa  43.5  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17841  hypothetical protein  19.67 
 
 		 450 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  27.59 
 
 		 455 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1858  hypothetical protein  27.59 
 
 		 463 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>