259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0318 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  100 
 
 		 439 aa  879    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0151  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta- component ferrodoxin domain protein  43.86 
 
 		 408 aa  278  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12100  cobalamin biosynthesis protein cobG  40.94 
 
 		 363 aa  231  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00940846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3106  precorrin-3B synthase  39.37 
 
 		 372 aa  229  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3429  precorrin-3B synthase  40.16 
 
 		 372 aa  226  6e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal  0.446466 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2526  precorrin-3B synthase  40.21 
 
 		 373 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2489  precorrin-3B synthase  40.21 
 
 		 373 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.333591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2534  precorrin-3B synthase  40.21 
 
 		 373 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.35067  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2481  precorrin-3B synthase  36.43 
 
 		 378 aa  192  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0547656  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2494  nitrite/sulfite reductase hemoprotein subnit beta ferrodoxin domain-containing protein  38.77 
 
 		 367 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.149164 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17650  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  48.37 
 
 		 292 aa  184  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220438  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2894  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  38.85 
 
 		 282 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.804468  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1626  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  44.66 
 
 		 335 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.470677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5592  Sulfite reductase beta subunit (hemoprotein)- like protein  39.31 
 
 		 473 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2192  precorrin-3B synthase  36.22 
 
 		 351 aa  169  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0576  precorrin-3B synthase  52.26 
 
 		 389 aa  149  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.244524  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1519  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  54.49 
 
 		 481 aa  149  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0825166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  29.38 
 
 		 430 aa  136  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1783  hypothetical protein  30.19 
 
 		 345 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  30.86 
 
 		 476 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  29.06 
 
 		 447 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  28.85 
 
 		 483 aa  123  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  29.67 
 
 		 464 aa  121  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  25 
 
 		 494 aa  120  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.46 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  28.68 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  28.12 
 
 		 454 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  28.29 
 
 		 443 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1194  precorrin-3B synthase  26.9 
 
 		 482 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0317253  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1674  precorrin-3B synthase  26.9 
 
 		 516 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242876  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  28.29 
 
 		 438 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1574  precorrin-3B synthase  27.38 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3267  precorrin-3B synthase  27.91 
 
 		 423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0180034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  26.03 
 
 		 732 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  29.56 
 
 		 424 aa  109  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  27.74 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  28.61 
 
 		 439 aa  108  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  28.78 
 
 		 443 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4824  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta subunit  27.68 
 
 		 478 aa  107  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3411  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  34.11 
 
 		 207 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1647  precorrin-3B synthase  27.56 
 
 		 482 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690908  normal  0.296785 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5369  precorrin-3B synthase  26.65 
 
 		 507 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062725  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  26.95 
 
 		 456 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  27.8 
 
 		 479 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  28.79 
 
 		 431 aa  103  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1967  precorrin-3B synthase  28.44 
 
 		 482 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0190248  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  25.55 
 
 		 465 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  25.06 
 
 		 487 aa  99.4  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2113  precorrin-3B synthase  28.21 
 
 		 482 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.46756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1950  precorrin-3B synthase  28.21 
 
 		 482 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0588771  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  26.44 
 
 		 608 aa  97.1  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  28.23 
 
 		 380 aa  97.4  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  25.94 
 
 		 486 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1161  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  27.98 
 
 		 482 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326083  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0896  precorrin-3B synthase  27.98 
 
 		 482 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0264  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  27.98 
 
 		 482 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540499  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  28.35 
 
 		 409 aa  95.1  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1602  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  27.98 
 
 		 482 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.036421  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2211  precorrin-3B synthase  25 
 
 		 386 aa  90.9  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  24.27 
 
 		 521 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  25.31 
 
 		 599 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  22.9 
 
 		 519 aa  80.5  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  23.44 
 
 		 513 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  23.44 
 
 		 513 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  22.7 
 
 		 590 aa  79  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  23.96 
 
 		 595 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  21.65 
 
 		 586 aa  77  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  23.95 
 
 		 615 aa  76.6  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1245  putative oxidoreductase  38.32 
 
 		 510 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347263  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  23.92 
 
 		 567 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  25.78 
 
 		 521 aa  75.5  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  23.15 
 
 		 596 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  22.58 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5851  precorrin-3B synthase  28.82 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  23.57 
 
 		 596 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  25.62 
 
 		 621 aa  73.2  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0341  precorrin-3B synthase  24.59 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  23.48 
 
 		 553 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  24.3 
 
 		 512 aa  72  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  23.96 
 
 		 601 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  23.97 
 
 		 560 aa  71.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  21.79 
 
 		 516 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  23.23 
 
 		 553 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  25.76 
 
 		 569 aa  69.7  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  25.76 
 
 		 569 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  21.57 
 
 		 604 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  23.3 
 
 		 536 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.02 
 
 		 556 aa  67.4  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2229  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.29 
 
 		 553 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  23.97 
 
 		 513 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  21.67 
 
 		 480 aa  66.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.11 
 
 		 793 aa  66.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2689  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.29 
 
 		 553 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.671477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1435  precorrin-3B synthase  25.38 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.592884  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1713  precorrin-3B synthase  25.26 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00909167 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  21.75 
 
 		 545 aa  65.1  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.135047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  22.85 
 
 		 592 aa  64.3  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.17 
 
 		 570 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.24 
 
 		 567 aa  64.3  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  28.37 
 
 		 796 aa  63.9  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>