More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0979 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0979  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  100 
 
 
460 aa  938    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1591  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  47.14 
 
 
454 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.558771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2580  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  46.48 
 
 
454 aa  425  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3160  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  46.17 
 
 
456 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2792  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.45 
 
 
488 aa  386  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000540709  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2172  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  43.25 
 
 
471 aa  385  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000128077  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1267  Fmu (Sun) domain protein  42.86 
 
 
460 aa  382  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1219  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  43.3 
 
 
455 aa  364  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1328  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  41.4 
 
 
457 aa  353  5e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13819  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1306  RNA methylase NOL1/NOP2/sun family  39.61 
 
 
457 aa  349  7e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.085217 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0993  NOL1/NOP2/sun family protein  40.4 
 
 
436 aa  339  5.9999999999999996e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0692  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  39.04 
 
 
470 aa  337  3.9999999999999995e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.010029  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0901  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.13 
 
 
455 aa  335  9e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1104  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  38.51 
 
 
458 aa  331  2e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1005  rRNA methyltransferase, putative  40.98 
 
 
436 aa  324  2e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00439767  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3218  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.48 
 
 
470 aa  319  6e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2064  Fmu (Sun) domain protein  37.5 
 
 
479 aa  283  6.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003425  ribosomal RNA small subunit methyltransferase F  32.5 
 
 
478 aa  236  7e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.837447  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2609  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  33.82 
 
 
474 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1665  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.78 
 
 
509 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1770  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.92 
 
 
510 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.475142  normal  0.596617 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1740  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.92 
 
 
510 aa  232  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2405  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.43 
 
 
480 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02352  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.52 
 
 
501 aa  229  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1110  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.71 
 
 
503 aa  227  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.153136  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2210  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.64 
 
 
505 aa  226  7e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2236  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.47 
 
 
484 aa  224  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2103  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.99 
 
 
481 aa  223  4e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235271  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2136  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.55 
 
 
484 aa  223  7e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1797  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.78 
 
 
481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.396046  normal  0.0585336 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1926  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.78 
 
 
481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.79578  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01806  predicted methyltransferase  31.78 
 
 
479 aa  221  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.88495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01794  hypothetical protein  31.78 
 
 
479 aa  221  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2064  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.78 
 
 
481 aa  221  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.2344  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1840  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.92 
 
 
482 aa  219  6e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2046  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  29.74 
 
 
505 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.362171  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2568  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.36 
 
 
479 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1352  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.57 
 
 
481 aa  219  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  normal  0.0948873 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1848  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.26 
 
 
484 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1538  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.77 
 
 
473 aa  218  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.317347  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5890  Fmu (Sun) domain protein  32.47 
 
 
453 aa  217  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133324  hitchhiker  0.00389453 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1807  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  31.14 
 
 
481 aa  217  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0366277  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1865  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  32.99 
 
 
468 aa  217  4e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.92386  decreased coverage  0.000437678 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1896  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.26 
 
 
505 aa  216  8e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2448  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.06 
 
 
505 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1986  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  33.12 
 
 
478 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0149307 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2568  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.06 
 
 
505 aa  213  7e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378579  normal  0.101279 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2455  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.4 
 
 
505 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6488  Fmu (Sun) domain protein  31.13 
 
 
464 aa  212  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.799417 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2079  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.95 
 
 
481 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1993  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.53 
 
 
513 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2224  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.13 
 
 
481 aa  210  5e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1989  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.53 
 
 
513 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458134 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2051  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.53 
 
 
513 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1465  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.53 
 
 
479 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.331125  normal  0.160256 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1281  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.53 
 
 
479 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0638049  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1583  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.09 
 
 
486 aa  207  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.855297  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2644  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  29.94 
 
 
478 aa  202  8e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0597695 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2113  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.13 
 
 
503 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2039  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.15 
 
 
467 aa  199  7e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.137623  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0432  NOL1/NOP2/sun family protein  30.72 
 
 
468 aa  193  6e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.218549 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1927  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.83 
 
 
488 aa  193  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0056  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.36 
 
 
485 aa  189  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0341  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  38.67 
 
 
302 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0282  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  36.72 
 
 
302 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1228  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  33.56 
 
 
339 aa  179  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1936  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  28.24 
 
 
481 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00306451  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  35.12 
 
 
446 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  33.66 
 
 
464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2033  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  34.63 
 
 
302 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0620  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.34 
 
 
474 aa  167  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  31.19 
 
 
443 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  34.31 
 
 
444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0007  ribosomal RNA methyltransferase NOP2  34.75 
 
 
336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.138281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  34.58 
 
 
443 aa  166  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  35.44 
 
 
453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1485  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  35.35 
 
 
314 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0666  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  35.05 
 
 
302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2695  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  35.33 
 
 
325 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  33.44 
 
 
446 aa  163  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1108  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  37.62 
 
 
301 aa  162  9e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000188231  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  33.78 
 
 
451 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0526  tRNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.76 
 
 
499 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  34.01 
 
 
448 aa  160  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  33.78 
 
 
451 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  33.33 
 
 
448 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2830  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  33.33 
 
 
305 aa  159  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82296  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  36.46 
 
 
447 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  31.4 
 
 
451 aa  158  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  33.22 
 
 
449 aa  157  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  33.33 
 
 
448 aa  157  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  37.2 
 
 
451 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  33.11 
 
 
448 aa  156  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  33.45 
 
 
444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  33.11 
 
 
452 aa  154  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  35.74 
 
 
452 aa  154  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25394  predicted protein  30.33 
 
 
528 aa  152  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  35.23 
 
 
437 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  32.44 
 
 
452 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1513  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  32.79 
 
 
448 aa  151  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>