More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2569 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2569  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 
241 aa  493  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977102  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0243  riboflavin synthase subunit alpha  56.38 
 
 
230 aa  274  8e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13114 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1220  riboflavin synthase subunit alpha  53.5 
 
 
229 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1250  riboflavin synthase subunit alpha  53.5 
 
 
229 aa  251  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4388  riboflavin synthase, alpha subunit  54.1 
 
 
222 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  53.31 
 
 
219 aa  238  4e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2762  riboflavin synthase subunit alpha  53.09 
 
 
225 aa  234  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1416  riboflavin synthase subunit alpha  54.73 
 
 
219 aa  231  9e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682137  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0441  riboflavin synthase subunit alpha  41.98 
 
 
217 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0861062  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04971  riboflavin synthase subunit alpha  41.32 
 
 
217 aa  171  9e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.372947  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04661  riboflavin synthase subunit alpha  40.33 
 
 
217 aa  168  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  43.9 
 
 
216 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05041  riboflavin synthase subunit alpha  40.08 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0423095  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0604  riboflavin synthase subunit alpha  43.27 
 
 
222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.128519  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  38.02 
 
 
220 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06371  riboflavin synthase subunit alpha  41.74 
 
 
220 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0855264 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  44.39 
 
 
239 aa  159  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1758  riboflavin synthase subunit alpha  41.39 
 
 
218 aa  159  4e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04391  riboflavin synthase subunit alpha  38.93 
 
 
221 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  40.25 
 
 
217 aa  158  8e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  40.91 
 
 
217 aa  155  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  41.46 
 
 
216 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  39.42 
 
 
205 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  39.42 
 
 
205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1773  riboflavin synthase subunit alpha  38.68 
 
 
217 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0488322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  36.78 
 
 
214 aa  152  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  40.16 
 
 
213 aa  152  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  38.02 
 
 
215 aa  151  8e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  37.34 
 
 
218 aa  150  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04961  riboflavin synthase subunit alpha  38.27 
 
 
217 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.184408 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  40.66 
 
 
216 aa  150  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  36.36 
 
 
214 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  43.41 
 
 
216 aa  149  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  42.65 
 
 
216 aa  149  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  36.99 
 
 
221 aa  149  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  35.12 
 
 
214 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08540  riboflavin synthase, alpha subunit  38.84 
 
 
222 aa  149  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  36.78 
 
 
219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  41.71 
 
 
216 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  40.74 
 
 
207 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  39.09 
 
 
221 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  39.02 
 
 
200 aa  146  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  37.7 
 
 
223 aa  146  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  38.46 
 
 
223 aa  146  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  38.27 
 
 
217 aa  145  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  38.02 
 
 
213 aa  145  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  38.06 
 
 
214 aa  144  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  39.52 
 
 
201 aa  144  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  35.92 
 
 
214 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  38.05 
 
 
215 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  37.19 
 
 
226 aa  143  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  38.73 
 
 
209 aa  143  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  36.49 
 
 
218 aa  142  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  36.99 
 
 
219 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  38.24 
 
 
199 aa  143  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  36.89 
 
 
218 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  36.89 
 
 
218 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  36.89 
 
 
218 aa  142  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  36.59 
 
 
219 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  41.55 
 
 
200 aa  142  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  36.78 
 
 
220 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  38.17 
 
 
205 aa  141  7e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  36.78 
 
 
214 aa  141  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  37.7 
 
 
220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  31.82 
 
 
220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0879  riboflavin synthase subunit alpha  39.34 
 
 
200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000888006  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  38.37 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  39.27 
 
 
210 aa  139  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  35.95 
 
 
221 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  38.37 
 
 
217 aa  139  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  33.47 
 
 
219 aa  139  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  35.95 
 
 
221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  36.36 
 
 
214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  36.36 
 
 
214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  36.36 
 
 
214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  36.36 
 
 
214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  38.52 
 
 
218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  35.95 
 
 
221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  36.36 
 
 
214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  34.55 
 
 
219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  35.95 
 
 
221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  40.78 
 
 
220 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  40.78 
 
 
202 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  31.43 
 
 
221 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  41.26 
 
 
227 aa  139  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  35.66 
 
 
220 aa  139  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  39.29 
 
 
221 aa  138  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  37.74 
 
 
217 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  38.43 
 
 
212 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  35.54 
 
 
214 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  36.36 
 
 
220 aa  137  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  35.54 
 
 
214 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  32.64 
 
 
217 aa  137  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  32.92 
 
 
218 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  40.38 
 
 
199 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  32.23 
 
 
218 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  35.27 
 
 
221 aa  136  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  38.65 
 
 
215 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  39.9 
 
 
201 aa  136  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  32.92 
 
 
218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>