More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4659 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  100 
 
 
241 aa  471  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  68.33 
 
 
248 aa  285  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  62.45 
 
 
252 aa  283  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  68.75 
 
 
277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  62.71 
 
 
266 aa  282  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  61.51 
 
 
243 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  59.24 
 
 
245 aa  270  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  63.29 
 
 
249 aa  270  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  57.98 
 
 
256 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  58.4 
 
 
252 aa  269  4e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  58.05 
 
 
255 aa  267  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  57.81 
 
 
253 aa  266  2e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  58.8 
 
 
256 aa  266  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  61.18 
 
 
279 aa  265  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  59.65 
 
 
253 aa  265  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  59.07 
 
 
247 aa  263  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  58.16 
 
 
243 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  57.58 
 
 
455 aa  263  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  64.04 
 
 
257 aa  263  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  57.98 
 
 
269 aa  261  8.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  58.59 
 
 
445 aa  260  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  55.84 
 
 
264 aa  260  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  57.14 
 
 
264 aa  260  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  53.97 
 
 
291 aa  257  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  56.36 
 
 
244 aa  257  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  57.58 
 
 
255 aa  255  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  56.2 
 
 
258 aa  255  5e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  56.65 
 
 
258 aa  254  8e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  56.54 
 
 
253 aa  254  9e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  57.14 
 
 
255 aa  254  9e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  56.47 
 
 
255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  62.01 
 
 
258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  53.81 
 
 
277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  60.53 
 
 
256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  55.65 
 
 
247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  53.68 
 
 
259 aa  251  5.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  60.08 
 
 
271 aa  251  6e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  52.34 
 
 
279 aa  250  1e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  54.36 
 
 
262 aa  250  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  56.12 
 
 
250 aa  250  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  58.62 
 
 
277 aa  249  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  53.28 
 
 
263 aa  250  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  58.44 
 
 
312 aa  248  5e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  55.93 
 
 
280 aa  248  6e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  58.26 
 
 
272 aa  247  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  53.59 
 
 
266 aa  247  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  57.94 
 
 
268 aa  246  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  54.82 
 
 
261 aa  245  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  54.31 
 
 
258 aa  244  8e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  55.65 
 
 
288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  57.14 
 
 
255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  57.6 
 
 
245 aa  242  5e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  64.56 
 
 
249 aa  239  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  54.36 
 
 
279 aa  239  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  55.56 
 
 
244 aa  239  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  56.9 
 
 
258 aa  238  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  54.71 
 
 
271 aa  238  5e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.94 
 
 
274 aa  236  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  57.69 
 
 
255 aa  236  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  59.91 
 
 
250 aa  234  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  57.4 
 
 
302 aa  232  5e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  50.44 
 
 
252 aa  227  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  56.49 
 
 
249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  56.3 
 
 
247 aa  224  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  51.9 
 
 
255 aa  224  7e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  54.19 
 
 
293 aa  223  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  53.91 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  60 
 
 
224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  55.23 
 
 
269 aa  217  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  45.98 
 
 
235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  44.55 
 
 
228 aa  215  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  58.8 
 
 
247 aa  210  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  43.64 
 
 
240 aa  210  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  51.11 
 
 
240 aa  209  3e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  43.5 
 
 
235 aa  208  6e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  44.34 
 
 
230 aa  207  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0186  ABC transporter related  51.58 
 
 
244 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.475038 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  42.86 
 
 
226 aa  207  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3418  ABC transporter-related protein  43.1 
 
 
266 aa  207  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0483067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 
248 aa  207  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0841  ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 
255 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.598404  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  45.54 
 
 
234 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  40.41 
 
 
255 aa  206  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  45.07 
 
 
223 aa  204  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  45.15 
 
 
247 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  46.96 
 
 
231 aa  204  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  45.95 
 
 
225 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  44.55 
 
 
225 aa  203  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  44.5 
 
 
230 aa  203  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  42.2 
 
 
293 aa  203  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  45.54 
 
 
234 aa  203  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  47.83 
 
 
230 aa  202  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  45.09 
 
 
234 aa  203  3e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2023  ABC transporter, ATP-binding protein  42.39 
 
 
253 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  45.95 
 
 
239 aa  202  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  45.21 
 
 
225 aa  202  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  42.79 
 
 
227 aa  202  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  45.41 
 
 
252 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0119  ABC transporter  39.41 
 
 
256 aa  202  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.393598  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  46.78 
 
 
251 aa  202  5e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>