More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3738 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  100 
 
 
455 aa  922    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  69.27 
 
 
445 aa  615  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  67.28 
 
 
437 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  63.45 
 
 
543 aa  551  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  61.01 
 
 
451 aa  542  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  57.59 
 
 
499 aa  525  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  60.32 
 
 
574 aa  525  1e-148  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  58.2 
 
 
448 aa  525  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  57.53 
 
 
448 aa  523  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  56.49 
 
 
440 aa  499  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  54.82 
 
 
436 aa  491  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  53.29 
 
 
448 aa  479  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  56.88 
 
 
445 aa  474  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  50.8 
 
 
443 aa  463  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  50.68 
 
 
438 aa  441  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  50.91 
 
 
438 aa  437  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  47.73 
 
 
447 aa  429  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  48.85 
 
 
447 aa  426  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  48.18 
 
 
445 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  48.64 
 
 
445 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  47.74 
 
 
445 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  47.51 
 
 
445 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  47.51 
 
 
445 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  33.03 
 
 
462 aa  219  7.999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  32.27 
 
 
473 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  31.85 
 
 
476 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  34.56 
 
 
466 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  33.33 
 
 
469 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  36.93 
 
 
432 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  33.25 
 
 
767 aa  171  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  32.81 
 
 
454 aa  169  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  32.44 
 
 
434 aa  168  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  31.91 
 
 
451 aa  166  8e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  31.91 
 
 
451 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  38.95 
 
 
470 aa  166  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  30.21 
 
 
477 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  32.57 
 
 
481 aa  164  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  34.77 
 
 
461 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  35.31 
 
 
454 aa  162  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  35.91 
 
 
452 aa  160  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  31.43 
 
 
454 aa  160  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  31.07 
 
 
464 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  34.23 
 
 
454 aa  158  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  32.46 
 
 
629 aa  158  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  32.61 
 
 
457 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  26.88 
 
 
438 aa  157  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  34.23 
 
 
457 aa  156  6e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  31.11 
 
 
450 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  32.7 
 
 
440 aa  154  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  35.26 
 
 
446 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  32.36 
 
 
432 aa  153  8e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  34.58 
 
 
452 aa  152  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  33.11 
 
 
440 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  30.34 
 
 
433 aa  149  8e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  34.8 
 
 
455 aa  149  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  35.6 
 
 
470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  30.79 
 
 
441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  31.05 
 
 
433 aa  147  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  33.88 
 
 
453 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  33.66 
 
 
473 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  33.12 
 
 
440 aa  145  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  26.62 
 
 
440 aa  144  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  34.75 
 
 
455 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  35.29 
 
 
565 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  28.87 
 
 
563 aa  141  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  30.65 
 
 
440 aa  140  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35328  predicted protein  28.34 
 
 
640 aa  139  8.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.678268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 
453 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  30.7 
 
 
440 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.92 
 
 
559 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  33.71 
 
 
475 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04036  ABC-1 protein  29.24 
 
 
455 aa  138  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.26 
 
 
559 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  33.79 
 
 
483 aa  137  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49684  predicted protein  32.79 
 
 
788 aa  137  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  36.29 
 
 
456 aa  137  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3125  hypothetical protein  32.29 
 
 
441 aa  137  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.44 
 
 
554 aa  136  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  27.48 
 
 
433 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80246  mitochondrial chaperone  28.92 
 
 
560 aa  134  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.763396  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  35.89 
 
 
456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  31.91 
 
 
562 aa  134  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2235  hypothetical protein  28.71 
 
 
666 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00408279  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  35.89 
 
 
456 aa  134  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  33.33 
 
 
557 aa  134  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  34.77 
 
 
485 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.21 
 
 
558 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  35.08 
 
 
453 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  26.13 
 
 
564 aa  133  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  32.27 
 
 
549 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13150  predicted protein  28.05 
 
 
517 aa  132  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.561954  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  30.57 
 
 
458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  32.36 
 
 
558 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  27.09 
 
 
434 aa  131  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  30.71 
 
 
619 aa  131  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  31.91 
 
 
549 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  28.08 
 
 
558 aa  130  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  34.92 
 
 
456 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  34.63 
 
 
549 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.26 
 
 
559 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>