More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1075 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
271 aa  553  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  79.28 
 
 
253 aa  421  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  74.41 
 
 
255 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  69.84 
 
 
253 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  72.51 
 
 
254 aa  372  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  72.73 
 
 
279 aa  370  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  69.02 
 
 
259 aa  360  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  65.5 
 
 
257 aa  350  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  66.01 
 
 
256 aa  341  5.999999999999999e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  66.01 
 
 
253 aa  338  5e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.96 
 
 
258 aa  338  7e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  66.4 
 
 
257 aa  337  1.9999999999999998e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  67.61 
 
 
253 aa  332  5e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  64.82 
 
 
256 aa  332  6e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  65.22 
 
 
259 aa  328  4e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  62.8 
 
 
259 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  60.47 
 
 
256 aa  315  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  62.75 
 
 
253 aa  314  9.999999999999999e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  61.75 
 
 
259 aa  312  3.9999999999999997e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  61.54 
 
 
251 aa  312  3.9999999999999997e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  61.02 
 
 
257 aa  311  4.999999999999999e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  60.56 
 
 
262 aa  309  2.9999999999999997e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  60.08 
 
 
255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  61.26 
 
 
281 aa  295  5e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  59.27 
 
 
257 aa  290  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.47 
 
 
253 aa  290  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  56.64 
 
 
258 aa  286  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  55.12 
 
 
262 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  53.73 
 
 
265 aa  278  7e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  52.94 
 
 
263 aa  276  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  53.57 
 
 
260 aa  275  4e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.97 
 
 
259 aa  266  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.63 
 
 
252 aa  265  8e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  49.22 
 
 
278 aa  257  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  47.49 
 
 
280 aa  256  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.25 
 
 
263 aa  255  6e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4368  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.25 
 
 
263 aa  254  9e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15983  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.01 
 
 
276 aa  253  3e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4137  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.5 
 
 
246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285969  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  49.21 
 
 
283 aa  241  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  41.86 
 
 
258 aa  233  3e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  43.31 
 
 
263 aa  230  2e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.48 
 
 
264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  40.08 
 
 
264 aa  216  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  43.63 
 
 
263 aa  216  4e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  40.87 
 
 
264 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  38.89 
 
 
264 aa  209  5e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  45.98 
 
 
268 aa  208  8e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.6 
 
 
249 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3752  Di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  44.08 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.43 
 
 
253 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.43 
 
 
253 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.21 
 
 
249 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.22 
 
 
259 aa  186  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  40.24 
 
 
264 aa  186  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.88 
 
 
233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.59 
 
 
233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.25 
 
 
259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.49 
 
 
258 aa  182  6e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  38.91 
 
 
245 aa  182  7e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.07 
 
 
267 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0518  undecaprenyl diphosphate synthase  40.34 
 
 
280 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  37.8 
 
 
266 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  40.85 
 
 
241 aa  179  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.93 
 
 
251 aa  178  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  38.4 
 
 
248 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.34 
 
 
258 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.34 
 
 
258 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.3 
 
 
250 aa  177  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.34 
 
 
258 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.34 
 
 
258 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.34 
 
 
258 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.34 
 
 
258 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.34 
 
 
258 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.06 
 
 
247 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.77 
 
 
258 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.77 
 
 
257 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  38.62 
 
 
263 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  38.53 
 
 
225 aa  176  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.2 
 
 
258 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  36.63 
 
 
246 aa  176  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.15 
 
 
256 aa  176  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  36.32 
 
 
276 aa  176  4e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.15 
 
 
256 aa  176  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  38.43 
 
 
249 aa  176  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2113  undecaprenyl diphosphate synthase  40.16 
 
 
247 aa  176  5e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  37.71 
 
 
239 aa  175  6e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.76 
 
 
260 aa  175  7e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10910  undecaprenyl diphosphate synthase  37.1 
 
 
289 aa  175  8e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.183526  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  37.61 
 
 
232 aa  175  8e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  38.82 
 
 
234 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  38.03 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.67 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  39.76 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.03 
 
 
238 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.68 
 
 
249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.18 
 
 
267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  36.1 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.57 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  37.93 
 
 
240 aa  173  2.9999999999999996e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>