More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1714 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1714  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydC  100 
 
 		 569 aa  1092    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0041  ABC transporter, transmembrane region, type 1  35.96 
 
 		 594 aa  270  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0194  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydC  36.65 
 
 		 567 aa  245  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.505034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1962  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  35.25 
 
 		 1201 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3442  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.64 
 
 		 1179 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.507362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4285  ABC transporter related  36.81 
 
 		 1179 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4081  ABC transporter, transmembrane region, type 1  36.81 
 
 		 1179 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  32.84 
 
 		 579 aa  243  9e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3493  ABC transporter related  35.6 
 
 		 1179 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2098  ABC transporter related  34.26 
 
 		 609 aa  238  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2558  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.19 
 
 		 552 aa  234  4.0000000000000004e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0216  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.39 
 
 		 562 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0635  ABC transporter, ATP-binding protein  36.72 
 
 		 593 aa  233  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.119324  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0217  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.45 
 
 		 562 aa  231  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1721  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydC  34.71 
 
 		 993 aa  231  3e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.489544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0189  ABC transporter related  31.02 
 
 		 576 aa  230  6e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.087717  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0273  ABC transporter related  27.31 
 
 		 566 aa  218  2e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1110  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  33.07 
 
 		 585 aa  218  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1390  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  33.07 
 
 		 585 aa  218  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.66 
 
 		 555 aa  218  2.9999999999999998e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10350  cysteine export CydDC family ABC transporter permease subunit/ATP-binding protein CydC  30.37 
 
 		 1205 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.247589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  32.88 
 
 		 577 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1313  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  31.25 
 
 		 573 aa  212  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888271  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  30.99 
 
 		 577 aa  211  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0661  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  31.14 
 
 		 573 aa  208  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.177717  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0472  ATPase  33.04 
 
 		 578 aa  207  3e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  31.86 
 
 		 567 aa  207  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  30.35 
 
 		 577 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  32.38 
 
 		 610 aa  207  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  31.86 
 
 		 567 aa  207  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.7 
 
 		 580 aa  207  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  31.86 
 
 		 566 aa  206  7e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  31.05 
 
 		 598 aa  206  9e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0341  ABC transporter related  28.98 
 
 		 592 aa  204  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1274  ABC transporter related protein  29.42 
 
 		 572 aa  203  8e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02052  ABC multidrug transporter (Eurofung)  27.82 
 
 		 782 aa  203  9e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  30.88 
 
 		 581 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2303  ABC transporter related protein  25.38 
 
 		 552 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.347808  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  29.15 
 
 		 584 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2208  ABC transporter related  43.59 
 
 		 589 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1787  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  29.65 
 
 		 582 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  31.38 
 
 		 624 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  32.39 
 
 		 582 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  32.39 
 
 		 582 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  30.8 
 
 		 572 aa  201  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09820  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.8 
 
 		 626 aa  201  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.23172  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  30.02 
 
 		 620 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  33.11 
 
 		 577 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  27.15 
 
 		 556 aa  199  9e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  34.11 
 
 		 1284 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0697  ABC transporter, transmembrane region, type 1  29.88 
 
 		 574 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  33.33 
 
 		 619 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0821  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  29.45 
 
 		 574 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.17374  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  30.37 
 
 		 568 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  35.4 
 
 		 582 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0717  ATPase  29.62 
 
 		 583 aa  198  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000641338  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  29.4 
 
 		 636 aa  197  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.62 
 
 		 1257 aa  197  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1456  ABC transporter related  28 
 
 		 624 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  26.49 
 
 		 583 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1642  ABC transporter, transmembrane region, type 1  28.06 
 
 		 573 aa  196  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0520  ABC transporter related  31.63 
 
 		 652 aa  196  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00806721  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0831  ABC transporter related  31.88 
 
 		 629 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188495 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1636  Beta tubulin, autoregulation binding site  36.45 
 
 		 584 aa  196  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  30.02 
 
 		 585 aa  195  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  28.15 
 
 		 579 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.12 
 
 		 632 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.56 
 
 		 614 aa  195  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  30.44 
 
 		 612 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0786  ABC transporter related  32.06 
 
 		 577 aa  194  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757117  hitchhiker  0.00608544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2515  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.2 
 
 		 587 aa  194  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.296095 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0196  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  33.4 
 
 		 588 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1440  ABC transporter related protein  35.38 
 
 		 596 aa  194  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.531129 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.57 
 
 		 614 aa  194  4e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  31.92 
 
 		 777 aa  194  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  30.29 
 
 		 596 aa  193  9e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  29.72 
 
 		 623 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.43 
 
 		 582 aa  192  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0028  ABC transporter related  28.54 
 
 		 615 aa  192  1e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0832  ATPase  31.89 
 
 		 552 aa  192  2e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.423533  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  31.65 
 
 		 611 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4668  ABC transporter related  32.86 
 
 		 593 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206506  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  30.55 
 
 		 593 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0508  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.21 
 
 		 581 aa  191  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.29 
 
 		 567 aa  191  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1880  cysteine ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.44 
 
 		 599 aa  191  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  29.33 
 
 		 579 aa  191  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  31.59 
 
 		 611 aa  191  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  30.41 
 
 		 619 aa  191  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  34.29 
 
 		 635 aa  190  5e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1554  ABC transporter related  30.61 
 
 		 612 aa  190  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138935  hitchhiker  0.00285078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  27.9 
 
 		 588 aa  190  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2076  ABC transporter related  35.96 
 
 		 578 aa  191  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.17 
 
 		 627 aa  190  5.999999999999999e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  31.18 
 
 		 594 aa  190  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  28.24 
 
 		 550 aa  189  8e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1666  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  29.32 
 
 		 576 aa  190  8e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000461828  normal  0.671696 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1293  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  29.73 
 
 		 562 aa  190  8e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.408226  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2235  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  32.14 
 
 		 573 aa  189  9e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.228638  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  26.72 
 
 		 571 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>