More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4668 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4668  ABC transporter related  100 
 
 		 593 aa  1162    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206506  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  37.33 
 
 		 623 aa  296  7e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  33.71 
 
 		 566 aa  296  9e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  34.6 
 
 		 607 aa  295  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  36.53 
 
 		 578 aa  294  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  30.27 
 
 		 578 aa  292  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  30.27 
 
 		 578 aa  292  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  28.99 
 
 		 597 aa  290  4e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  32.67 
 
 		 556 aa  288  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  33.08 
 
 		 586 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  34.13 
 
 		 601 aa  287  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0028  ABC transporter related  31.81 
 
 		 615 aa  286  9e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.16 
 
 		 578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.67 
 
 		 634 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  34.9 
 
 		 575 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  31.69 
 
 		 608 aa  285  1.0000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  37.53 
 
 		 598 aa  285  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  35.59 
 
 		 582 aa  284  3.0000000000000004e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  37.65 
 
 		 594 aa  284  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  39.4 
 
 		 619 aa  283  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  33.33 
 
 		 578 aa  283  7.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  31.05 
 
 		 612 aa  282  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.14 
 
 		 628 aa  282  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.54 
 
 		 608 aa  282  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  31.31 
 
 		 598 aa  281  3e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  36.58 
 
 		 606 aa  280  7e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.36 
 
 		 586 aa  280  8e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.99 
 
 		 580 aa  280  8e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  31.61 
 
 		 609 aa  278  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.22 
 
 		 586 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  33.67 
 
 		 650 aa  278  2e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  30.35 
 
 		 579 aa  278  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2096  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.02 
 
 		 616 aa  278  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.163444  hitchhiker  0.0014118 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  31.83 
 
 		 580 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.16 
 
 		 616 aa  278  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  35.71 
 
 		 650 aa  278  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.97 
 
 		 586 aa  277  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  33.02 
 
 		 625 aa  277  4e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.97 
 
 		 586 aa  277  4e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.97 
 
 		 586 aa  276  6e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1262  ABC transporter-related protein  35.82 
 
 		 601 aa  276  6e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140001 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.16 
 
 		 586 aa  276  7e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  30.17 
 
 		 594 aa  276  7e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  30.77 
 
 		 586 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.77 
 
 		 586 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  31.16 
 
 		 586 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  32.62 
 
 		 598 aa  275  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1512  ABC transporter related  36.4 
 
 		 611 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00861332  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  36.35 
 
 		 611 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.39 
 
 		 597 aa  276  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.95 
 
 		 641 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.02 
 
 		 639 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.16 
 
 		 586 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  31 
 
 		 584 aa  274  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  34.62 
 
 		 579 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.69 
 
 		 627 aa  273  6e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  38.43 
 
 		 601 aa  273  7e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  34.24 
 
 		 546 aa  272  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  35.1 
 
 		 613 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  34.52 
 
 		 603 aa  271  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  35.47 
 
 		 600 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  31.31 
 
 		 613 aa  271  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  33.47 
 
 		 620 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  37.28 
 
 		 632 aa  270  4e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.18 
 
 		 637 aa  270  5e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  36.4 
 
 		 634 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.45 
 
 		 632 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.75 
 
 		 598 aa  269  8.999999999999999e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  28.57 
 
 		 636 aa  269  1e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4431  ABC transporter related  39.96 
 
 		 581 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2356  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.02 
 
 		 618 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2635  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  38.82 
 
 		 618 aa  268  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.239281 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  34.93 
 
 		 567 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2313  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  35.96 
 
 		 622 aa  268  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0680321 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  31.73 
 
 		 584 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04517  ABC heavy metal ion transporter (Eurofung)  34.83 
 
 		 920 aa  267  2.9999999999999995e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  32.1 
 
 		 610 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  34.93 
 
 		 567 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.05 
 
 		 629 aa  267  4e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  35.66 
 
 		 600 aa  267  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  38.34 
 
 		 603 aa  266  5e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  38.9 
 
 		 607 aa  266  7e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.64 
 
 		 567 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  33.93 
 
 		 609 aa  265  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.87 
 
 		 618 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  32.72 
 
 		 676 aa  266  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.77 
 
 		 637 aa  265  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.48 
 
 		 619 aa  265  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  34.04 
 
 		 636 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  32.16 
 
 		 596 aa  265  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  36.12 
 
 		 612 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  36.07 
 
 		 639 aa  265  3e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  32.76 
 
 		 616 aa  264  3e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  32.71 
 
 		 601 aa  264  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3189  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.16 
 
 		 601 aa  264  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  29.87 
 
 		 618 aa  265  3e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.94 
 
 		 614 aa  264  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  34.65 
 
 		 687 aa  264  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.51 
 
 		 603 aa  264  4e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  37.5 
 
 		 600 aa  264  4e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>