More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0556 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0556  amidohydrolase  100 
 
 		 442 aa  857    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3698  amidohydrolase  53.22 
 
 		 437 aa  363  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2568  amidohydrolase  54.25 
 
 		 426 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3968  peptidase M20D, amidohydrolase  46.21 
 
 		 424 aa  348  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4199  amidohydrolase  52.23 
 
 		 419 aa  345  6e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0853  peptidase M20D, amidohydrolase  45.65 
 
 		 431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3364  amidohydrolase  48.68 
 
 		 420 aa  342  9e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447857  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2148  amidohydrolase  45.41 
 
 		 422 aa  342  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2416  amidohydrolase  53.18 
 
 		 426 aa  339  5e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.451042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3172  peptidase M20D, amidohydrolase  48.07 
 
 		 420 aa  336  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2437  peptidase M20D, amidohydrolase  46.14 
 
 		 653 aa  331  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0288  amidohydrolase  45.58 
 
 		 575 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1355  amidohydrolase  47.81 
 
 		 422 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1337  peptidase M20D, amidohydrolase  47.81 
 
 		 422 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2524  amidohydrolase  42.62 
 
 		 421 aa  318  9e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  0.871942 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5217  peptidase M20D, amidohydrolase  41.89 
 
 		 425 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1373  amidohydrolase  47.56 
 
 		 422 aa  315  8e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4743  amidohydrolase  45.24 
 
 		 421 aa  309  8e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  41.25 
 
 		 1270 aa  306  6e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1971  amidohydrolase  45.71 
 
 		 420 aa  306  6e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.281082 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3715  amidohydrolase  48.26 
 
 		 437 aa  303  5.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1139  amidohydrolase  44.7 
 
 		 450 aa  300  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0023  amidohydrolase  44.15 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.69346  normal  0.453416 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07529  zinc metallopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09600)  42.79 
 
 		 439 aa  296  7e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.175058 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2056  peptidase M20D, amidohydrolase  43.61 
 
 		 443 aa  293  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04320  amidohydrolase  46.53 
 
 		 405 aa  293  4e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3669  amidohydrolase  43.54 
 
 		 416 aa  293  6e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0543  amidohydrolase  46.67 
 
 		 427 aa  292  8e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272586 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0452  amidohydrolase  39.1 
 
 		 410 aa  290  5.0000000000000004e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.598311 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2928  amidohydrolase  40.92 
 
 		 441 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3443  peptidase M20D, amidohydrolase  43.06 
 
 		 367 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3605  amidohydrolase  38.08 
 
 		 446 aa  281  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202541  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2778  amidohydrolase  39.52 
 
 		 471 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2374  amidohydrolase  39.13 
 
 		 470 aa  279  6e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.949854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2228  amidohydrolase  43.26 
 
 		 430 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0617571  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1597  peptidase M20D, amidohydrolase  41.69 
 
 		 437 aa  277  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3374  amidohydrolase  40.1 
 
 		 446 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.658502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0854  amidohydrolase family protein  38.94 
 
 		 438 aa  273  5.000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2688  amidohydrolase  39.52 
 
 		 445 aa  271  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.101321 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1999  amidohydrolase  43.06 
 
 		 430 aa  270  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38809e-26 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0940  peptidase M20D, amidohydrolase  40.53 
 
 		 438 aa  265  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2787  amidohydrolase  38.8 
 
 		 444 aa  263  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362917  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1822  amidohydrolase  38.96 
 
 		 453 aa  249  6e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.678575  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2730  amidohydrolase  39.95 
 
 		 419 aa  249  6e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.407872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2532  amidohydrolase  35.61 
 
 		 447 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167108  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3434  amidohydrolase  40.87 
 
 		 428 aa  236  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  37.39 
 
 		 401 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  35.77 
 
 		 439 aa  189  7e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.07 
 
 		 438 aa  188  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  37.09 
 
 		 401 aa  188  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  36.04 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  34.49 
 
 		 402 aa  187  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  39.45 
 
 		 406 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  35.01 
 
 		 404 aa  186  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  36.01 
 
 		 403 aa  186  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  39.27 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5073  amidohydrolase  39.17 
 
 		 387 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  30.28 
 
 		 431 aa  184  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  39.95 
 
 		 389 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  33.71 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  34.37 
 
 		 397 aa  182  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0220  amidohydrolase  30.73 
 
 		 389 aa  182  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  35.35 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  36.73 
 
 		 458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  34.52 
 
 		 398 aa  180  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1211  amidohydrolase  36.72 
 
 		 384 aa  180  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.108173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  33.66 
 
 		 438 aa  180  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  44.03 
 
 		 389 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  38.08 
 
 		 405 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  38.01 
 
 		 390 aa  179  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  37.86 
 
 		 399 aa  179  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  40.61 
 
 		 388 aa  179  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  38.63 
 
 		 391 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  32.92 
 
 		 480 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  34.53 
 
 		 388 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  36.97 
 
 		 402 aa  178  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  39.38 
 
 		 400 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  38.9 
 
 		 391 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  32.2 
 
 		 432 aa  177  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  35.2 
 
 		 449 aa  177  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  36.57 
 
 		 412 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  39.13 
 
 		 393 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  39.27 
 
 		 391 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  29.93 
 
 		 400 aa  176  8e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  41.11 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  33.42 
 
 		 401 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  37.07 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4873  amidohydrolase  36.01 
 
 		 389 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.458115 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  36.89 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  35.81 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  33.02 
 
 		 459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  37.04 
 
 		 387 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  36.99 
 
 		 393 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  37.04 
 
 		 387 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  44.15 
 
 		 389 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  36.78 
 
 		 388 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  35.57 
 
 		 379 aa  172  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  32.5 
 
 		 397 aa  172  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  30.05 
 
 		 449 aa  172  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  36.36 
 
 		 387 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>