106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1845 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1845  signal-transduction protein  100 
 
 
145 aa  288  1e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1807  signal-transduction protein  80.69 
 
 
145 aa  247  4e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0324  putative signal transduction protein with CBS domains  34.04 
 
 
147 aa  84.7  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  28.57 
 
 
152 aa  61.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  32.89 
 
 
210 aa  57  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  27.46 
 
 
427 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  26.03 
 
 
423 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  28.77 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  28.99 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  28.99 
 
 
147 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  26 
 
 
152 aa  53.9  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  26.28 
 
 
141 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  29.53 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  29.01 
 
 
149 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  26.88 
 
 
161 aa  50.8  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  31.96 
 
 
280 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4046  CBS domain-containing protein  25.44 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  28.78 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1350  CBS domain containing membrane protein  25.44 
 
 
168 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  22.07 
 
 
427 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
431 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  26.85 
 
 
153 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  30.99 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  26.73 
 
 
281 aa  47  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2230  signal transduction protein  26.61 
 
 
249 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  31.65 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  30.13 
 
 
380 aa  45.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  27.72 
 
 
282 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  31.88 
 
 
483 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4840  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  30.39 
 
 
222 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1879  CBS  33.33 
 
 
157 aa  45.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1370  CBS domain-containing protein  23.97 
 
 
171 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4720  CBS domain containing membrane protein  26 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236602  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  28.39 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  26.77 
 
 
426 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  25.93 
 
 
166 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  32.62 
 
 
210 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  32.03 
 
 
214 aa  44.7  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  32.58 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  27.59 
 
 
233 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  31.17 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0774  CBS  33.33 
 
 
157 aa  43.9  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  34 
 
 
154 aa  43.9  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  29.2 
 
 
223 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  25.33 
 
 
227 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  27.01 
 
 
261 aa  43.5  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1450  CBS domain-containing protein  28.26 
 
 
144 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463338  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1650  putative CBS domain-containing signal transduction protein  28.05 
 
 
218 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0992945  normal  0.691102 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  26.47 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0833  CBS domain-containing protein  26.03 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0363  KpsF/GutQ family protein  25.68 
 
 
344 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103679  normal  0.93857 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0979  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.71 
 
 
482 aa  43.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  24.16 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0276  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.25 
 
 
482 aa  43.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  25.49 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  29.37 
 
 
221 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  40.38 
 
 
230 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  27.89 
 
 
417 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0963  putative signal transduction protein with CBS domains  27.5 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000158107  normal  0.526521 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  43.33 
 
 
211 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1632  CBS domain-containing protein  27.88 
 
 
211 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  24.84 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  27.38 
 
 
185 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  26.73 
 
 
280 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  36.17 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  25.74 
 
 
280 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1659  signal transduction protein  27.36 
 
 
660 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  30.67 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4212  KpsF/GutQ family protein  28.57 
 
 
348 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  28.47 
 
 
216 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  25.64 
 
 
598 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1201  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.88 
 
 
485 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.795344  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  23.68 
 
 
228 aa  41.6  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  28.47 
 
 
222 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  26 
 
 
150 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2757  CBS domain-containing protein  29.27 
 
 
151 aa  41.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212289  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1078  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.88 
 
 
485 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.472537  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0664  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.88 
 
 
485 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.116725  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3070  chloride channel core  26.03 
 
 
590 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal  0.0360231 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  37.21 
 
 
230 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13833  predicted protein  28.07 
 
 
443 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0243831  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  24.62 
 
 
502 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_820  CBS domain protein  26.76 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  24.62 
 
 
688 aa  40.8  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1304  signal-transduction protein  43.14 
 
 
200 aa  41.2  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  26.05 
 
 
162 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  30 
 
 
636 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  28.23 
 
 
688 aa  41.2  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  28.89 
 
 
688 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0098  CBS domain-containing protein  25.87 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.55 
 
 
482 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.55 
 
 
482 aa  40.8  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  28.68 
 
 
216 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1700  acetoin utilization protein AcuB, putative  25.89 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0154068 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17501  IMP dehydrogenase-like protein  30.91 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  35.21 
 
 
286 aa  40.8  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  36.54 
 
 
231 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4187  KpsF/GutQ family protein  27.86 
 
 
348 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1465  CBS domain-containing protein  32.89 
 
 
202 aa  40.4  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.969653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  27.87 
 
 
428 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>