More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2794 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3823  acyl-CoA synthetase, putative  58.49 
 
 		 680 aa  751    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2794  CoA-binding  100 
 
 		 679 aa  1365    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.319847 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6428  CoA-binding domain protein  54.49 
 
 		 684 aa  643    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.941122  normal  0.0804767 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4495  CoA-binding domain protein  53.76 
 
 		 684 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2176  CoA-binding domain-containing protein  54.17 
 
 		 687 aa  635    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3724  acyl-CoA synthetase, putative  40.89 
 
 		 705 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2182  acyl-CoA synthetase, putative  41.13 
 
 		 705 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2039  CoA-binding domain-containing protein  40.85 
 
 		 705 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5711  hypothetical protein  39.09 
 
 		 696 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65810  hypothetical protein  39.4 
 
 		 696 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  31.26 
 
 		 718 aa  258  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  30.66 
 
 		 712 aa  228  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0568  putative CoA ligase  28.15 
 
 		 708 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830442  normal  0.832734 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  30.67 
 
 		 704 aa  219  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  29.87 
 
 		 699 aa  217  4e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  30.23 
 
 		 698 aa  217  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  30.7 
 
 		 711 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  28.63 
 
 		 708 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  30.11 
 
 		 729 aa  213  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  29.44 
 
 		 705 aa  212  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  29.87 
 
 		 700 aa  211  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  31.31 
 
 		 741 aa  211  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  29.58 
 
 		 712 aa  209  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  28.49 
 
 		 669 aa  209  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  28.63 
 
 		 911 aa  204  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  30.8 
 
 		 703 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  30.19 
 
 		 710 aa  202  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5094  acyl-CoA synthetase domain-containing protein  28.03 
 
 		 718 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  30.48 
 
 		 715 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  29.75 
 
 		 700 aa  198  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  29.97 
 
 		 699 aa  197  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  30.2 
 
 		 703 aa  196  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  29.44 
 
 		 715 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  28.96 
 
 		 710 aa  195  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  28.01 
 
 		 700 aa  194  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  28.12 
 
 		 893 aa  189  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  28.53 
 
 		 695 aa  187  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  28 
 
 		 897 aa  186  9e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  28.25 
 
 		 695 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  27.55 
 
 		 697 aa  184  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  26.85 
 
 		 697 aa  183  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  26.92 
 
 		 696 aa  183  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1512  CoA-binding protein  26.61 
 
 		 703 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1535  CoA-binding domain-containing protein  26.61 
 
 		 703 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  28.79 
 
 		 702 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  30.97 
 
 		 898 aa  177  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  27.36 
 
 		 918 aa  177  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  27.7 
 
 		 929 aa  176  9e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  28.49 
 
 		 692 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  29.26 
 
 		 893 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  27.39 
 
 		 698 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1328  CoA ligase family protein  27.46 
 
 		 685 aa  174  5e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1399  CoA-binding domain-containing protein  26.56 
 
 		 660 aa  174  5e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.578078  hitchhiker  0.000299945 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  28.94 
 
 		 716 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  27.27 
 
 		 900 aa  173  9e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  28.65 
 
 		 697 aa  173  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  26.29 
 
 		 711 aa  173  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  25.64 
 
 		 660 aa  172  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1907  CoA-binding  28.47 
 
 		 699 aa  172  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805485  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  29.01 
 
 		 913 aa  172  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  25 
 
 		 696 aa  172  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  28.69 
 
 		 903 aa  171  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3421  CoA-binding domain protein  29.2 
 
 		 690 aa  170  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.678339  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  24.06 
 
 		 706 aa  171  6e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1004  GCN5-related N-acetyltransferase  28.21 
 
 		 883 aa  170  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  24.93 
 
 		 905 aa  170  9e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  24.5 
 
 		 698 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2035  CoA-binding domain protein  28.07 
 
 		 727 aa  168  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  24.79 
 
 		 702 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  26.81 
 
 		 892 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  25.53 
 
 		 706 aa  164  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  25.35 
 
 		 911 aa  163  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  25.63 
 
 		 915 aa  163  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  29.6 
 
 		 904 aa  162  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  25.21 
 
 		 921 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  26.54 
 
 		 895 aa  161  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  24.06 
 
 		 703 aa  160  9e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  26.94 
 
 		 903 aa  159  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1928  CoA-binding domain-containing protein  25.9 
 
 		 900 aa  158  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.517585  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1905  putative acyl-CoA synthetase  28.08 
 
 		 718 aa  158  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  25.14 
 
 		 728 aa  157  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  27.74 
 
 		 920 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  25.98 
 
 		 711 aa  156  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  23.43 
 
 		 702 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  25.63 
 
 		 707 aa  154  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  28.23 
 
 		 926 aa  154  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1097  CoA-binding domain-containing protein  29.51 
 
 		 702 aa  151  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5367  putative acyl-CoA synthetase  26.1 
 
 		 715 aa  150  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  27.79 
 
 		 897 aa  150  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1776  GCN5-related N-acetyltransferase  26.18 
 
 		 898 aa  150  8e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.634734 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  29.08 
 
 		 705 aa  150  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  28.47 
 
 		 727 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1934  CoA-binding  24.14 
 
 		 684 aa  148  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0454  CoA-binding domain protein  27.96 
 
 		 690 aa  147  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3321  CoA-binding domain-containing protein  27.7 
 
 		 703 aa  147  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776977  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1311  hypothetical protein  27.33 
 
 		 886 aa  144  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1585  CoA-binding domain-containing protein  27.85 
 
 		 697 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.27477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0505  CoA-binding domain protein  28.39 
 
 		 887 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3477  CoA-binding domain-containing protein  34.09 
 
 		 707 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025154  normal  0.742177 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2039  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 		 900 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583899  normal  0.0195221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>