88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13769 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  100 
 
 
529 aa  1022    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  71.51 
 
 
529 aa  668    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  72.92 
 
 
531 aa  628  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  72.88 
 
 
531 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  72.92 
 
 
531 aa  628  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  69.79 
 
 
555 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0372  protein of unknown function DUF1212  42.92 
 
 
464 aa  265  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  36.36 
 
 
510 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  39.61 
 
 
474 aa  236  8e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  39.02 
 
 
466 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0990  protein of unknown function DUF1212  37.64 
 
 
465 aa  204  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0126983  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  35.11 
 
 
467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3700  hypothetical protein  35.92 
 
 
473 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296209  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19250  hypothetical protein  31.68 
 
 
509 aa  183  5.0000000000000004e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0275947  hitchhiker  0.00598211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  31.65 
 
 
461 aa  171  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0772  hypothetical protein  30.3 
 
 
498 aa  159  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.988975  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  30.74 
 
 
511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  28.92 
 
 
634 aa  140  4.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  30.98 
 
 
448 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  30.38 
 
 
475 aa  139  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  29.69 
 
 
468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24060  hypothetical protein  30.24 
 
 
497 aa  130  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.214274  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  33.33 
 
 
478 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  27.78 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  25.32 
 
 
250 aa  66.6  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  23.11 
 
 
256 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  24.26 
 
 
406 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  26.4 
 
 
247 aa  64.7  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  21.54 
 
 
410 aa  63.9  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  22.41 
 
 
253 aa  60.8  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  24.07 
 
 
415 aa  59.3  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  24.1 
 
 
260 aa  59.3  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  21.54 
 
 
253 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  20.69 
 
 
251 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  23.21 
 
 
253 aa  58.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  22.27 
 
 
253 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  21.54 
 
 
253 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  21.54 
 
 
253 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  23.15 
 
 
406 aa  58.2  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  22.76 
 
 
406 aa  57.4  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  20.5 
 
 
256 aa  57.4  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  24.51 
 
 
406 aa  57  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  24.51 
 
 
406 aa  57  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  24.51 
 
 
406 aa  57  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  23.6 
 
 
253 aa  56.2  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  25.16 
 
 
406 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  21.14 
 
 
253 aa  56.2  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  23.92 
 
 
406 aa  56.6  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  18.6 
 
 
250 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0301  hypothetical protein  22.22 
 
 
251 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.345177  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  23.51 
 
 
422 aa  55.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  25.73 
 
 
406 aa  55.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  21.65 
 
 
253 aa  56.2  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3691  hypothetical protein  30.16 
 
 
261 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  24.54 
 
 
267 aa  54.7  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  21.39 
 
 
423 aa  54.3  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  21.14 
 
 
253 aa  54.3  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  23.26 
 
 
262 aa  53.9  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  21.14 
 
 
253 aa  53.9  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3086  hypothetical protein  22.71 
 
 
252 aa  53.9  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  23.94 
 
 
406 aa  53.9  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  23.79 
 
 
268 aa  53.5  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  21.14 
 
 
253 aa  53.5  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  20.08 
 
 
256 aa  53.5  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  22.15 
 
 
411 aa  53.5  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  26.67 
 
 
253 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  26.67 
 
 
253 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  21.98 
 
 
406 aa  50.8  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  21.91 
 
 
289 aa  50.1  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  23.58 
 
 
259 aa  50.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  22.49 
 
 
266 aa  50.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  21.98 
 
 
406 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  21.98 
 
 
406 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  23.85 
 
 
258 aa  49.7  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  24.26 
 
 
411 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  21.95 
 
 
266 aa  48.5  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1824  phosphoglycerate kinase  23.05 
 
 
259 aa  48.5  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  25 
 
 
164 aa  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  25 
 
 
164 aa  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2924  hypothetical protein  22.73 
 
 
253 aa  47.4  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03000  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  23.97 
 
 
1078 aa  47  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  23.79 
 
 
262 aa  45.8  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0269225 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1613  hypothetical protein  21.83 
 
 
421 aa  44.7  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  21.74 
 
 
164 aa  44.7  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0674  protein of unknown function DUF1212  25.12 
 
 
436 aa  44.3  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  24.81 
 
 
426 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1617  hypothetical protein  27.74 
 
 
171 aa  43.5  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1709  hypothetical protein  23.53 
 
 
156 aa  43.5  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000820605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>