More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11716 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  100 
 
 
311 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  88.85 
 
 
318 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  88.52 
 
 
318 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  88.85 
 
 
318 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  85.9 
 
 
317 aa  522  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  85.57 
 
 
314 aa  517  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  71.24 
 
 
324 aa  411  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  66.12 
 
 
311 aa  375  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  66.24 
 
 
318 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  66.77 
 
 
313 aa  365  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  66.88 
 
 
313 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  65.36 
 
 
315 aa  363  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  64.13 
 
 
321 aa  353  2e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  63.02 
 
 
310 aa  352  5e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  61.02 
 
 
311 aa  347  2e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  63.4 
 
 
308 aa  343  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  60.71 
 
 
346 aa  342  4e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  61.24 
 
 
362 aa  341  8e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  66.23 
 
 
299 aa  340  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  63.69 
 
 
345 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  60.56 
 
 
331 aa  329  4e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4062  tyrosine recombinase XerD  61.72 
 
 
353 aa  323  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.159612  normal  0.47475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  56.86 
 
 
306 aa  323  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  58.63 
 
 
317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  58.99 
 
 
321 aa  311  1e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  62.46 
 
 
325 aa  299  4e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0971  integrase family protein  58.26 
 
 
328 aa  298  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  52.96 
 
 
301 aa  293  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15290  tyrosine recombinase XerD subunit  59.29 
 
 
332 aa  292  4e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  56.35 
 
 
310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2159  tyrosine recombinase XerD  58.58 
 
 
311 aa  280  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  57.14 
 
 
443 aa  280  3e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  59.8 
 
 
344 aa  279  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2834  integrase family protein  56.91 
 
 
314 aa  275  6e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.061361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1758  integrase family protein  59.55 
 
 
383 aa  272  5.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488752  hitchhiker  0.0032662 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  47.23 
 
 
308 aa  264  1e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  46.45 
 
 
319 aa  261  6.999999999999999e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.37 
 
 
299 aa  245  6e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.69 
 
 
298 aa  242  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  44.08 
 
 
295 aa  238  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  37.87 
 
 
295 aa  237  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  45.36 
 
 
295 aa  236  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  37.46 
 
 
296 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  42.3 
 
 
307 aa  233  5e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  47.27 
 
 
298 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  45.03 
 
 
302 aa  232  6e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  47.27 
 
 
314 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  39.6 
 
 
295 aa  231  9e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  41.31 
 
 
307 aa  229  4e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.67 
 
 
296 aa  229  5e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.33 
 
 
296 aa  229  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  44.44 
 
 
302 aa  229  6e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  41.31 
 
 
307 aa  228  7e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  45 
 
 
295 aa  228  9e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15230  site-specific tyrosine recombinase XerD  51.3 
 
 
316 aa  228  1e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0614301  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  40 
 
 
296 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  39.93 
 
 
296 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  43.61 
 
 
294 aa  227  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  40 
 
 
296 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.67 
 
 
296 aa  226  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.67 
 
 
296 aa  226  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.67 
 
 
296 aa  226  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  43.56 
 
 
297 aa  226  4e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.67 
 
 
296 aa  226  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.67 
 
 
296 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.67 
 
 
296 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.67 
 
 
296 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  44.82 
 
 
295 aa  225  8e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  46.95 
 
 
298 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  44 
 
 
292 aa  223  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  38.94 
 
 
295 aa  222  6e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  38.94 
 
 
295 aa  222  6e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  43.33 
 
 
292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  42.72 
 
 
317 aa  219  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  44.37 
 
 
309 aa  219  3e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  40 
 
 
304 aa  220  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  39.4 
 
 
305 aa  219  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  39.81 
 
 
322 aa  219  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  39.6 
 
 
306 aa  218  7.999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  39.93 
 
 
304 aa  218  8.999999999999998e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.71 
 
 
300 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  43.71 
 
 
295 aa  216  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.8 
 
 
301 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  44.69 
 
 
304 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  40 
 
 
302 aa  215  8e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  40.2 
 
 
295 aa  215  9e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  35 
 
 
296 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  41.53 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  38.89 
 
 
296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.14 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.14 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.14 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  42.26 
 
 
332 aa  212  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.82 
 
 
299 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.14 
 
 
299 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.82 
 
 
299 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.82 
 
 
299 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.54 
 
 
299 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  40.4 
 
 
304 aa  211  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  38.39 
 
 
297 aa  211  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>