More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11435 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11435  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 312 aa  610  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.406209 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2424  methionyl-tRNA formyltransferase  75.24 
 
 		 308 aa  431  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0902213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  75.24 
 
 		 308 aa  431  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0196795  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2430  methionyl-tRNA formyltransferase  75.24 
 
 		 308 aa  431  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2687  methionyl-tRNA formyltransferase  72.88 
 
 		 310 aa  421  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3730  methionyl-tRNA formyltransferase  71.06 
 
 		 310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.132882  normal  0.0191381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  59.67 
 
 		 309 aa  341  7e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15680  methionyl-tRNA formyltransferase  59.55 
 
 		 307 aa  339  2.9999999999999998e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2825  methionyl-tRNA formyltransferase  59.93 
 
 		 309 aa  338  8e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2350  methionyl-tRNA formyltransferase  61.56 
 
 		 313 aa  334  9e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  59.34 
 
 		 311 aa  334  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3190  methionyl-tRNA formyltransferase  57.55 
 
 		 337 aa  331  9e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000305844  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  58.51 
 
 		 324 aa  331  1e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5224  methionyl-tRNA formyltransferase  58.5 
 
 		 310 aa  329  4e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2442  methionyl-tRNA formyltransferase  57.88 
 
 		 316 aa  328  9e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  60 
 
 		 310 aa  326  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  57.7 
 
 		 308 aa  324  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2567  methionyl-tRNA formyltransferase  57.84 
 
 		 311 aa  318  1e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296174  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2575  methionyl-tRNA formyltransferase  55.78 
 
 		 308 aa  311  9e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0532653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3099  methionyl-tRNA formyltransferase  55.13 
 
 		 315 aa  310  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0854  methionyl-tRNA formyltransferase  55.08 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0108509  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  56.07 
 
 		 308 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  56.07 
 
 		 311 aa  307  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3119  methionyl-tRNA formyltransferase  57.81 
 
 		 309 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4156  methionyl-tRNA formyltransferase  56.25 
 
 		 307 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.413206  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1862  methionyl-tRNA formyltransferase  55.41 
 
 		 308 aa  306  3e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  54.66 
 
 		 319 aa  300  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18090  methionyl-tRNA formyltransferase  55.45 
 
 		 315 aa  294  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12770  methionyl-tRNA formyltransferase  50.61 
 
 		 336 aa  288  7e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.348945  normal  0.0208178 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  54.61 
 
 		 306 aa  288  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1722  methionyl-tRNA formyltransferase  54.66 
 
 		 318 aa  280  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000240612  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1313  methionyl-tRNA formyltransferase  52.61 
 
 		 311 aa  279  4e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.141722 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  51.16 
 
 		 306 aa  278  7e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1671  methionyl-tRNA formyltransferase  53.47 
 
 		 306 aa  269  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563662  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  49.18 
 
 		 317 aa  264  1e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1966  methionyl-tRNA formyltransferase  44.38 
 
 		 328 aa  244  9.999999999999999e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.417449  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  46.56 
 
 		 327 aa  235  9e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  39.48 
 
 		 312 aa  209  7e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10800  methionyl-tRNA formyltransferase  43.81 
 
 		 366 aa  204  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0126989  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  42.48 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  43.13 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  43 
 
 		 308 aa  197  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  43.55 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  39.02 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  41.4 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  39.55 
 
 		 302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  36.72 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  39.23 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  38.46 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  41.94 
 
 		 310 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  39.94 
 
 		 318 aa  186  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  40.45 
 
 		 307 aa  185  8e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  36.39 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  37.05 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  36.16 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  37.9 
 
 		 320 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0021  methionyl-tRNA formyltransferase  41.31 
 
 		 313 aa  178  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.223082 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  41.31 
 
 		 313 aa  178  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  35.5 
 
 		 314 aa  178  9e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  36.16 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1490  methionyl-tRNA formyltransferase  36.69 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  37.92 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_002620  TC0817  methionyl-tRNA formyltransferase  36.07 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  38.26 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  38.26 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  38.26 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  38.67 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09618  methionyl-tRNA formyltransferase  35.06 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315311  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  38.26 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  37.05 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  38.13 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  38.67 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  34.56 
 
 		 321 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  38.33 
 
 		 315 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  37.42 
 
 		 312 aa  176  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  38.14 
 
 		 310 aa  176  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  37.92 
 
 		 315 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  38.33 
 
 		 315 aa  175  8e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  38.33 
 
 		 315 aa  175  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  38.33 
 
 		 315 aa  175  8e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  38.33 
 
 		 315 aa  175  8e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  38.33 
 
 		 315 aa  175  8e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  37.46 
 
 		 315 aa  175  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  40.65 
 
 		 299 aa  175  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  33.12 
 
 		 314 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  38.36 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  33.99 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  35.53 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  37.74 
 
 		 320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  35.53 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  35.53 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  38.71 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  32.58 
 
 		 312 aa  172  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  39.16 
 
 		 314 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1921  hypothetical protein  37.38 
 
 		 297 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  34.97 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  36.39 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2040  methionyl-tRNA formyltransferase  41.92 
 
 		 369 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>