More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2369 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00413  multidrug efflux system protein  39.59 
 
 		 1049 aa  711    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02361  aminoglycoside/multidrug efflux system  39.41 
 
 		 1037 aa  714    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03124  multidrug efflux system protein  39.98 
 
 		 1034 aa  702    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03362  multidrug transporter, RpoS-dependent  39.64 
 
 		 1037 aa  686    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0199  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  39.64 
 
 		 1037 aa  686    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0440  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  39.88 
 
 		 1034 aa  700    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1200  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  39.41 
 
 		 1037 aa  714    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3148  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  39.59 
 
 		 1049 aa  711    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2696  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.73 
 
 		 1052 aa  707    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2818  multidrug efflux RND transporter MexD  39.64 
 
 		 1042 aa  699    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1360  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.32 
 
 		 1054 aa  739    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103096  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0010  putative acriflavin resistance transmembrane protein  39.7 
 
 		 1049 aa  736    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.461171  normal  0.0539399 
 
 
-
 
NC_003296  RS01889  drug efflux transmembrane protein  38.44 
 
 		 1053 aa  686    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43508  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1355  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  39.5 
 
 		 1052 aa  704    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1537  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  40.36 
 
 		 1037 aa  773    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209864  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0415  RND efflux system, inner membrane transporter CmeB  38.91 
 
 		 1040 aa  703    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0292  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  39.92 
 
 		 1051 aa  716    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0334  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  38.84 
 
 		 1074 aa  694    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4692  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.67 
 
 		 1044 aa  726    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3100  multidrug efflux RND transporter MexF  39.4 
 
 		 1063 aa  703    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0635013  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4304  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.64 
 
 		 1044 aa  701    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0316  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  38.73 
 
 		 1066 aa  709    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.611401  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2130  hypothetical protein  37.84 
 
 		 1050 aa  694    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2104  hypothetical protein  37.81 
 
 		 1052 aa  690    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2282  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.9 
 
 		 1047 aa  699    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0161777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2968  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.79 
 
 		 1063 aa  704    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.599397  normal  0.253976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4008  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.43 
 
 		 1044 aa  702    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507214  normal  0.0226563 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1576  RND superfmily multidrug/dye/detergent efflux pump AcrB  37.23 
 
 		 1075 aa  704    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00327215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2161  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.17 
 
 		 1040 aa  705    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3062  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.24 
 
 		 1057 aa  726    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3441  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40 
 
 		 1051 aa  688    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.388058  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4089  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  37.82 
 
 		 1050 aa  690    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  50.91 
 
 		 1057 aa  1030    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1019  inner membrane protein  38.83 
 
 		 1066 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2058  multidrug efflux protein  37.19 
 
 		 1043 aa  685    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572121  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1130  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.79 
 
 		 1059 aa  701    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121687  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2658  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.58 
 
 		 1063 aa  701    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2757  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.33 
 
 		 1043 aa  704    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0156651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2894  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.06 
 
 		 1032 aa  703    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0114017  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3095  cation/multidrug efflux pump  42.08 
 
 		 1042 aa  769    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00680948  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6608  hydrophobe/amphiphile efflux-1 pump, HAE1  39.6 
 
 		 1063 aa  707    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4995  hydrophobe/amphiphile efflux-1 pump, HAE1  38.87 
 
 		 1053 aa  703    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5939  hydrophobe/amphiphile efflux-1 pump, HAE1  39.17 
 
 		 1066 aa  704    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.794955  normal  0.377291 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1993  RND family multidrug efflux transporter  41.4 
 
 		 1043 aa  697    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00306956  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0336  RND family multidrug efflux transporter  41.7 
 
 		 1036 aa  751    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00677984 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0810  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  37.9 
 
 		 1053 aa  699    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0578255 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1664  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.65 
 
 		 1044 aa  686    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186908  normal  0.57083 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0401  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.06 
 
 		 1055 aa  746    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.913827  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1532  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  37.84 
 
 		 1049 aa  704    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.075861  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0536  resistance-nodulation-cell division family transporter  39.65 
 
 		 1034 aa  732    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2369  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  100 
 
 		 1056 aa  2088    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.11897  normal  0.738324 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0688  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.17 
 
 		 1057 aa  739    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2051  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.59 
 
 		 1050 aa  689    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.625984  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0681  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  38.73 
 
 		 1066 aa  711    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.321186  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2444  multidrug efflux protein  37.36 
 
 		 1043 aa  688    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.678369  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2239  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.62 
 
 		 1048 aa  707    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2567  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.02 
 
 		 1047 aa  686    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.461697 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1219  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.94 
 
 		 1044 aa  695    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164773  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3585  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.72 
 
 		 1050 aa  702    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4635  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.58 
 
 		 1047 aa  742    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.518068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0373  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  36.28 
 
 		 1059 aa  685    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1592  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.35 
 
 		 1037 aa  689    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0951856  unclonable  0.000000469931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2036  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.02 
 
 		 1059 aa  712    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.602316  hitchhiker  0.00575958 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0709  RND efflux hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  40.44 
 
 		 1069 aa  733    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1743  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  38.69 
 
 		 1084 aa  692    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134866  normal  0.952788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2985  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  38.51 
 
 		 1068 aa  690    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.684616 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1230  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  40.09 
 
 		 1076 aa  759    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207904 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2310  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.5 
 
 		 1062 aa  697    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2681  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  37.97 
 
 		 1049 aa  690    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0839162  normal  0.444783 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0949  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.63 
 
 		 1066 aa  739    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0712  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.64 
 
 		 1057 aa  730    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1758  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  37.35 
 
 		 1100 aa  691    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.04251 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1702  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.19 
 
 		 1063 aa  735    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.710777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3589  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.85 
 
 		 1050 aa  695    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1068  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  45.85 
 
 		 1059 aa  902    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.186507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2817  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  47.18 
 
 		 1043 aa  884    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.702974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4071  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.91 
 
 		 1055 aa  758    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.702974  normal  0.202748 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1998  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.15 
 
 		 1066 aa  704    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5600  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.75 
 
 		 1065 aa  697    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.38 
 
 		 1063 aa  705    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347364  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6372  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.15 
 
 		 1059 aa  710    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3799  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.62 
 
 		 1053 aa  689    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0538  AcrB/AcrD family multidrug resistance protein  38.76 
 
 		 1048 aa  701    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199673  normal  0.872862 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0941  acriflavin resistance protein D  41.91 
 
 		 1056 aa  731    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.01 
 
 		 1068 aa  699    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3836  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.46 
 
 		 1044 aa  733    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3929  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.46 
 
 		 1044 aa  733    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1408  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.28 
 
 		 1058 aa  735    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.902436  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3862  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.42 
 
 		 1051 aa  709    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.395414  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2655  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.05 
 
 		 1066 aa  707    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665349  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05540  RND multidrug efflux transporter MexB  39.28 
 
 		 1046 aa  712    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.277681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1706  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.15 
 
 		 1059 aa  710    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2608  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.15 
 
 		 1066 aa  704    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728592  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5964  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.99 
 
 		 1065 aa  699    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6205  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.38 
 
 		 1063 aa  705    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956257  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1076  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.82 
 
 		 1063 aa  701    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.421657  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1457  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.82 
 
 		 1055 aa  786    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000798188 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3922  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.55 
 
 		 1052 aa  801    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.222699 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3161  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.19 
 
 		 1041 aa  713    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.362215  unclonable  0.00000213823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4045  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.17 
 
 		 1044 aa  724    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>