More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1965 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  100 
 
 		 388 aa  778    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0694  secretion protein HlyD  71.6 
 
 		 417 aa  449  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.459164  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  56.92 
 
 		 392 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  51.81 
 
 		 357 aa  359  4e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  50.69 
 
 		 357 aa  355  5.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12131  membrane fusion protein  48.9 
 
 		 356 aa  351  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.502636 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1235  secretion protein HlyD  42.66 
 
 		 353 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.681968  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13281  membrane fusion protein  42.37 
 
 		 353 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.403546  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13031  membrane fusion protein  41.81 
 
 		 353 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13141  membrane fusion protein  42.37 
 
 		 353 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.95 
 
 		 490 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.82 
 
 		 432 aa  206  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0553  secretion protein HlyD  44.21 
 
 		 450 aa  187  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.61 
 
 		 504 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  51.35 
 
 		 489 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.47 
 
 		 487 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1966  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.47 
 
 		 487 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  40.61 
 
 		 500 aa  168  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  26.96 
 
 		 517 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.25 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  25.76 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  30.84 
 
 		 404 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.32 
 
 		 404 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  28.25 
 
 		 393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.79 
 
 		 453 aa  119  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  29.55 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  26.97 
 
 		 509 aa  116  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  27.07 
 
 		 405 aa  115  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  27.63 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  28.61 
 
 		 402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  26.39 
 
 		 407 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.95 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.9 
 
 		 419 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  26.09 
 
 		 376 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.85 
 
 		 409 aa  109  8.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  26.67 
 
 		 408 aa  109  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  26.67 
 
 		 408 aa  109  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2865  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.36 
 
 		 478 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0716848 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2213  secretion protein HlyD  27.54 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  29.43 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  27.82 
 
 		 424 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  32.17 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.62 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  27.01 
 
 		 455 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384349  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  32.95 
 
 		 406 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  32.95 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2615  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.43 
 
 		 380 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1983  RND family efflux transporter MFP subunit  29.14 
 
 		 416 aa  106  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  27.22 
 
 		 366 aa  106  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  28.03 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1001  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.98 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336631 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.86 
 
 		 500 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  29.52 
 
 		 406 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  29.82 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140483  hitchhiker  0.000000766037 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  29.24 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  29.05 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1637  RND family efflux transporter MFP subunit  28.65 
 
 		 465 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.15 
 
 		 505 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4014  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.42 
 
 		 362 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181773  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1267  RND family efflux transporter MFP subunit  28.99 
 
 		 355 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  28.85 
 
 		 421 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.25 
 
 		 430 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0225  RND family efflux transporter MFP subunit  25.44 
 
 		 461 aa  103  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  28.66 
 
 		 429 aa  103  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4307  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.25 
 
 		 458 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.47 
 
 		 377 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.54 
 
 		 374 aa  102  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4285  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.25 
 
 		 458 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2151  RND family efflux transporter MFP subunit  27.98 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  27.97 
 
 		 472 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.34 
 
 		 428 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  27.58 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.86 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1144  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.11 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000342468  normal  0.524577 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.25 
 
 		 354 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  29.33 
 
 		 432 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  25.99 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.43 
 
 		 432 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  27.27 
 
 		 368 aa  101  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  27.45 
 
 		 414 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3403  HlyD family secretion protein  30.03 
 
 		 401 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00376035  normal  0.420161 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0987  secretion protein HlyD  25.85 
 
 		 419 aa  101  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0919  AcrA/AcrE family efflux protein  23.56 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  26.87 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  27.87 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5856  secretion protein HlyD  29.28 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249167  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0495  secretion protein HlyD  26.27 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3712  RND family efflux transporter MFP subunit  28.62 
 
 		 450 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.40893 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0927  macrolide efflux protein MacA  27.58 
 
 		 399 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2186  macrolide efflux protein MacA  27.51 
 
 		 428 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.91 
 
 		 397 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  26.37 
 
 		 372 aa  100  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6009  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.15 
 
 		 356 aa  99.8  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359632  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0836  macrolide efflux protein MacA  27.51 
 
 		 435 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1749  secretion protein HlyD  25.9 
 
 		 398 aa  99.8  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.89 
 
 		 349 aa  99.8  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0631  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.14 
 
 		 432 aa  99.4  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.137352 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  28.26 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1483  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.09 
 
 		 419 aa  99.4  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.377405 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.82 
 
 		 419 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>