More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1252 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
227 aa  462  1e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  91.15 
 
 
264 aa  424  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  90.87 
 
 
221 aa  414  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  90.28 
 
 
221 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  82.38 
 
 
247 aa  392  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  81.36 
 
 
234 aa  374  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  81.36 
 
 
234 aa  374  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  77.19 
 
 
235 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  77.19 
 
 
235 aa  363  1e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  77.63 
 
 
235 aa  363  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  78.9 
 
 
236 aa  359  2e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  75.77 
 
 
238 aa  358  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  69.91 
 
 
265 aa  320  9.000000000000001e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  60.55 
 
 
224 aa  279  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.19 
 
 
221 aa  279  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.81 
 
 
214 aa  279  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.19 
 
 
221 aa  279  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  62.1 
 
 
220 aa  278  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.33 
 
 
214 aa  278  6e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.86 
 
 
214 aa  277  7e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.86 
 
 
214 aa  277  7e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.86 
 
 
214 aa  277  7e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.86 
 
 
214 aa  277  7e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.86 
 
 
214 aa  277  7e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.86 
 
 
214 aa  277  7e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.86 
 
 
214 aa  277  9e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.38 
 
 
214 aa  275  4e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.63 
 
 
221 aa  275  6e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.9 
 
 
214 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  61.79 
 
 
220 aa  270  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.79 
 
 
220 aa  270  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  61.47 
 
 
224 aa  268  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  61.47 
 
 
224 aa  268  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.6 
 
 
218 aa  266  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  63.98 
 
 
221 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.35 
 
 
230 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.19 
 
 
221 aa  263  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.87 
 
 
221 aa  263  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  62.1 
 
 
221 aa  262  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.75 
 
 
218 aa  261  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.64 
 
 
221 aa  260  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2590  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.49 
 
 
234 aa  259  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0691249  normal  0.0209735 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.41 
 
 
219 aa  255  4e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0022  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.09 
 
 
223 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.8 
 
 
221 aa  253  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.2 
 
 
223 aa  250  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2620  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.4 
 
 
233 aa  249  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.64 
 
 
227 aa  249  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  54.34 
 
 
224 aa  249  3e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2051  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.26 
 
 
224 aa  249  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.623176  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.24 
 
 
221 aa  249  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  54.63 
 
 
224 aa  248  7e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5429  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.82 
 
 
227 aa  247  9e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.38 
 
 
232 aa  247  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.34 
 
 
222 aa  246  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  54.17 
 
 
220 aa  245  4e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.42 
 
 
216 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2925  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.87 
 
 
219 aa  244  6.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.51 
 
 
219 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.35 
 
 
219 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  55.61 
 
 
224 aa  241  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4056  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.27 
 
 
225 aa  240  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00103124  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1777  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.22 
 
 
230 aa  240  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151739  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.52 
 
 
231 aa  240  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3879  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.27 
 
 
225 aa  239  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2907  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.63 
 
 
243 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.19 
 
 
217 aa  238  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2484  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.61 
 
 
220 aa  238  5e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2786  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  56.81 
 
 
234 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0508  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.21 
 
 
228 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471552  normal  0.840535 
 
 
-
 
NC_002950  PG1595  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.4 
 
 
218 aa  237  9e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1024  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.65 
 
 
225 aa  237  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3689  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.91 
 
 
232 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0465  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.21 
 
 
228 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710301  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0441  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.21 
 
 
228 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3962  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.8 
 
 
225 aa  236  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0524071  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3021  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.73 
 
 
233 aa  236  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515085  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3723  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.8 
 
 
225 aa  236  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616256  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2858  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.21 
 
 
228 aa  236  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0229  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.8 
 
 
225 aa  236  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0846712  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0714  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.11 
 
 
222 aa  236  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.23803  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3623  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.74 
 
 
228 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2696  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.7 
 
 
227 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2218  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.11 
 
 
233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3176  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.82 
 
 
266 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0163  Ribulose-phosphate 3-epimerase  54.67 
 
 
241 aa  235  5.0000000000000005e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.468376  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  48.64 
 
 
221 aa  234  6e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0346  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.85 
 
 
224 aa  234  8e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2756  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.46 
 
 
241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.18 
 
 
225 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.21 
 
 
225 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3573  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.63 
 
 
243 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.715981  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1957  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.17 
 
 
225 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.163102 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3494  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.21 
 
 
238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00334689  hitchhiker  0.000085645 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0175  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.83 
 
 
228 aa  233  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0938  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.63 
 
 
231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00024  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.09 
 
 
223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3581  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.63 
 
 
228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5332  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  60.98 
 
 
233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137752  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3121  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.46 
 
 
241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.798582  normal  0.13274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>