More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4606 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  74.58 
 
 		 436 aa  664    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  72.64 
 
 		 424 aa  649    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  72.53 
 
 		 429 aa  649    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  73.28 
 
 		 429 aa  649    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  73.28 
 
 		 429 aa  648    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  79.05 
 
 		 420 aa  707    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  73.28 
 
 		 429 aa  649    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  72.97 
 
 		 429 aa  645    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  100 
 
 		 420 aa  871    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  73.62 
 
 		 435 aa  658    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  74.1 
 
 		 435 aa  662    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  73.86 
 
 		 435 aa  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  71.32 
 
 		 422 aa  631  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  71.57 
 
 		 429 aa  629  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  70.52 
 
 		 424 aa  620  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  59.36 
 
 		 413 aa  492  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  58.62 
 
 		 414 aa  492  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  56.45 
 
 		 409 aa  475  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  57.04 
 
 		 415 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  57.28 
 
 		 415 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  54.15 
 
 		 416 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  57.78 
 
 		 410 aa  461  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  55.53 
 
 		 405 aa  457  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  51.82 
 
 		 419 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  51.82 
 
 		 419 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  53.25 
 
 		 414 aa  448  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  53.62 
 
 		 409 aa  448  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  53.7 
 
 		 414 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  53.2 
 
 		 409 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  50.24 
 
 		 415 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  50 
 
 		 415 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  52.09 
 
 		 419 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  51.84 
 
 		 416 aa  431  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  51.83 
 
 		 406 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  49.1 
 
 		 417 aa  394  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  44.07 
 
 		 413 aa  361  1e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  44.04 
 
 		 415 aa  350  4e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  40.2 
 
 		 415 aa  331  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  40.58 
 
 		 415 aa  323  3e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  38.96 
 
 		 417 aa  310  4e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  38.99 
 
 		 416 aa  287  2.9999999999999996e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  31.2 
 
 		 444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  28.72 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  29.3 
 
 		 441 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  31.73 
 
 		 461 aa  169  9e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  33.65 
 
 		 445 aa  166  8e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  28.86 
 
 		 455 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  31.22 
 
 		 444 aa  160  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  29 
 
 		 449 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  28.28 
 
 		 439 aa  157  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  28.28 
 
 		 439 aa  157  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  33.13 
 
 		 449 aa  157  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  32.09 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  33.03 
 
 		 507 aa  153  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  31.16 
 
 		 470 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  28.8 
 
 		 480 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  30.65 
 
 		 495 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  30.46 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  29.15 
 
 		 491 aa  132  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  30.54 
 
 		 647 aa  127  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 455 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  30.68 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  26.92 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  28.83 
 
 		 480 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  28.83 
 
 		 480 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  28.83 
 
 		 480 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  28.57 
 
 		 480 aa  120  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  26.05 
 
 		 506 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  28.69 
 
 		 587 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  27.89 
 
 		 584 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3552  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 		 563 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  28.53 
 
 		 540 aa  98.6  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0260  monooxygenase FAD-binding  27.22 
 
 		 568 aa  97.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.958147  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  28.09 
 
 		 401 aa  89  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5928  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 		 515 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00202441  hitchhiker  0.00883605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  23.74 
 
 		 606 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  26.97 
 
 		 618 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  25.15 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01623  conserved hypothetical protein  29.69 
 
 		 476 aa  76.6  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.282796 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  24.19 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  25.75 
 
 		 488 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  23.61 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6708  FAD dependent oxidoreductase  21.52 
 
 		 566 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5266  FAD dependent oxidoreductase  21.47 
 
 		 566 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4728  FAD dependent oxidoreductase  21.47 
 
 		 566 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  24.48 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  25.34 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0437  FAD dependent oxidoreductase  24.5 
 
 		 549 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  21.45 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  25.15 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  24.05 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0003  halogenase PrnC  24.07 
 
 		 552 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.567897  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1482  putative halogenase  24.07 
 
 		 552 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133442  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1397  putative halogenase  24.07 
 
 		 552 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666039  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  24.65 
 
 		 425 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  24.16 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6985  FAD dependent oxidoreductase  21.2 
 
 		 566 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176502  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  22.22 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  33.77 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  25.15 
 
 		 368 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>