More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1568 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  71.36 
 
 		 667 aa  929    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  63.87 
 
 		 667 aa  830    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.02 
 
 		 667 aa  874    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.413203  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3114  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.51 
 
 		 667 aa  1079    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3134  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.87 
 
 		 667 aa  870    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0135223  normal  0.80442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.22 
 
 		 667 aa  862    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.87 
 
 		 667 aa  870    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2345  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.76 
 
 		 666 aa  751    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60686 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1568  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 667 aa  1352    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2976  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.87 
 
 		 667 aa  872    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000241408  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.57 
 
 		 667 aa  886    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1243  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.37 
 
 		 667 aa  865    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2637  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.57 
 
 		 667 aa  865    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0295827  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.22 
 
 		 667 aa  862    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00146838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1146  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.74 
 
 		 668 aa  768    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.970933  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.83 
 
 		 683 aa  348  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002906  methyl-accepting chemotaxis protein  32.69 
 
 		 678 aa  340  4e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.816112  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0117  methyl-accepting chemotaxis protein  32.21 
 
 		 658 aa  292  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0071  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.71 
 
 		 658 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5515  chemotaxis sensory transducer  31.19 
 
 		 658 aa  287  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501051  normal  0.584272 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0210  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.81 
 
 		 632 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  normal  0.150257 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0792  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.41 
 
 		 651 aa  253  9.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.3 
 
 		 657 aa  251  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.068141  normal  0.373533 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  29.39 
 
 		 656 aa  251  3e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.24 
 
 		 646 aa  246  6.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00540264  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.59 
 
 		 672 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3136  putative methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  30.15 
 
 		 661 aa  244  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3594  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.03 
 
 		 646 aa  244  5e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3437  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.13 
 
 		 646 aa  243  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.143807  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.15 
 
 		 659 aa  243  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3066  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.18 
 
 		 662 aa  241  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.8 
 
 		 643 aa  238  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0151066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.63 
 
 		 662 aa  237  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.32 
 
 		 651 aa  233  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4315  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.43 
 
 		 656 aa  229  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.25 
 
 		 660 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.16 
 
 		 660 aa  228  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.229974 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.1 
 
 		 660 aa  227  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0520721  normal  0.510764 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.67 
 
 		 660 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01222  methyl-accepting chemotaxis protein  31.29 
 
 		 580 aa  226  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.566871  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.67 
 
 		 660 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.13 
 
 		 651 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.67 
 
 		 674 aa  221  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0033  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.92 
 
 		 651 aa  217  5e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250878  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0837  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  28.19 
 
 		 680 aa  213  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0272085 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1080  methyl-accepting chemotaxis protein  26.13 
 
 		 687 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.469209  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0994  methyl-accepting chemotaxis protein  27.94 
 
 		 678 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.799426  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.03 
 
 		 719 aa  209  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2308  methyl-accepting chemotaxis protein II  27.64 
 
 		 684 aa  209  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.06 
 
 		 677 aa  209  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.787316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1684  methyl-accepting chemotaxis protein I  26.11 
 
 		 676 aa  207  7e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  30.74 
 
 		 656 aa  206  1e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.51 
 
 		 680 aa  206  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.12793  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.24 
 
 		 630 aa  204  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.24 
 
 		 630 aa  204  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.24 
 
 		 630 aa  203  8e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.04 
 
 		 630 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  29.23 
 
 		 630 aa  201  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.31 
 
 		 630 aa  196  9e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4403  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.23 
 
 		 670 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.604884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.62 
 
 		 630 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.59 
 
 		 630 aa  192  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.8 
 
 		 630 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.35 
 
 		 773 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.19 
 
 		 626 aa  190  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.21 
 
 		 630 aa  190  9e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.19 
 
 		 622 aa  188  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.8 
 
 		 640 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  29.05 
 
 		 645 aa  187  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0140  putative methyl-accepting chemotaxis protein  28.52 
 
 		 684 aa  187  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0610174  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.73 
 
 		 626 aa  187  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  30.31 
 
 		 627 aa  187  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2448  methyl-accepting chemotaxis protein  31.25 
 
 		 646 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.718596  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2220  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  31.31 
 
 		 646 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.071358  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.35 
 
 		 639 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  33.11 
 
 		 623 aa  184  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3725  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.88 
 
 		 620 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0657  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  30.23 
 
 		 648 aa  183  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  31.11 
 
 		 627 aa  183  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1022  methyl-accepting chemotaxis protein  32.22 
 
 		 628 aa  182  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.771007  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.69 
 
 		 716 aa  182  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  35.08 
 
 		 713 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 		 632 aa  182  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  35.31 
 
 		 629 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  37.33 
 
 		 633 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.69 
 
 		 706 aa  180  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.942476 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.61 
 
 		 626 aa  180  8e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.45 
 
 		 645 aa  180  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3502  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.56 
 
 		 620 aa  179  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.666992  normal  0.2901 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1187  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.51 
 
 		 706 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  35.28 
 
 		 626 aa  178  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.1 
 
 		 564 aa  179  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.51 
 
 		 706 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1012  hypothetical protein  32.81 
 
 		 626 aa  179  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0026  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.84 
 
 		 686 aa  179  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.25 
 
 		 645 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.77 
 
 		 545 aa  178  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  hitchhiker  0.00000653474 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3864  methyl-accepting chemotaxis protein  35.41 
 
 		 568 aa  178  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3551  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.39 
 
 		 620 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183884 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.69 
 
 		 623 aa  177  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.438395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>