85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1789 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  100 
 
 		 474 aa  970    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  44.13 
 
 		 471 aa  377  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  37.95 
 
 		 475 aa  318  9e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  37.34 
 
 		 473 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  41.74 
 
 		 491 aa  237  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  41.01 
 
 		 492 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  39.33 
 
 		 458 aa  205  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  32.87 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  25.2 
 
 		 246 aa  89.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  29.22 
 
 		 251 aa  89.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  29.32 
 
 		 250 aa  87  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  26.37 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  30.93 
 
 		 356 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  29.9 
 
 		 246 aa  82  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  30.5 
 
 		 259 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  27.32 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  24.69 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  25.68 
 
 		 252 aa  79  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  28.9 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  27.7 
 
 		 257 aa  79  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  28.02 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  30 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  27.95 
 
 		 249 aa  76.6  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  27.48 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  33 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  24.88 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  25.53 
 
 		 248 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  32.39 
 
 		 235 aa  72  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  32.28 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  26.47 
 
 		 255 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  26.32 
 
 		 251 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  27.18 
 
 		 221 aa  68.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  29.73 
 
 		 234 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  28.31 
 
 		 242 aa  68.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  24.36 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  26.6 
 
 		 214 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  24.46 
 
 		 203 aa  62.8  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  24.26 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  27.61 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  25.45 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  23.58 
 
 		 252 aa  59.7  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  29.63 
 
 		 357 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  26.11 
 
 		 225 aa  59.3  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  30.11 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  24.88 
 
 		 256 aa  57  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  31.16 
 
 		 508 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  31.16 
 
 		 508 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  30.66 
 
 		 510 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  28.4 
 
 		 239 aa  56.2  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  28.85 
 
 		 244 aa  55.8  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  23.24 
 
 		 205 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  25.35 
 
 		 1514 aa  54.7  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  24.32 
 
 		 189 aa  54.7  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  31.62 
 
 		 363 aa  53.5  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  32.04 
 
 		 250 aa  53.5  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  24.47 
 
 		 202 aa  53.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  25.66 
 
 		 252 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  24.12 
 
 		 207 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.09 
 
 		 530 aa  50.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  26.87 
 
 		 259 aa  50.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  26.44 
 
 		 3002 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  50 
 
 		 229 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  23.89 
 
 		 205 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  27.6 
 
 		 236 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  28.97 
 
 		 510 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  28.47 
 
 		 523 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  28.69 
 
 		 217 aa  48.5  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  27.21 
 
 		 251 aa  48.5  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4206  nitroreductase  28.57 
 
 		 531 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  27.12 
 
 		 518 aa  47.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2589  hypothetical protein  27.45 
 
 		 537 aa  47.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0423242  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  25.29 
 
 		 354 aa  47.4  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5837  hypothetical protein  24.49 
 
 		 502 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  28.93 
 
 		 222 aa  47  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2434  hypothetical protein  28.39 
 
 		 538 aa  46.6  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210466  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  29.31 
 
 		 509 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  26.24 
 
 		 242 aa  46.6  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3691  hypothetical protein  28.97 
 
 		 551 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  27.42 
 
 		 228 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1310  hypothetical protein  26.67 
 
 		 513 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4034  hypothetical protein  26.62 
 
 		 513 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  26.43 
 
 		 341 aa  44.7  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0920  hypothetical protein  25 
 
 		 240 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  25.38 
 
 		 247 aa  43.5  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0807  SagB-type dehydrogenase domain protein  41.3 
 
 		 229 aa  43.1  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>