More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0521 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0521  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 275 aa  564  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  41.09 
 
 		 274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  41.3 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  40 
 
 		 274 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  39.78 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  42.24 
 
 		 275 aa  196  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  40.45 
 
 		 282 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  39.08 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  40.51 
 
 		 296 aa  193  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  40.51 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  39.85 
 
 		 278 aa  191  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  39.18 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  37.97 
 
 		 274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  37.22 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  36.82 
 
 		 274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  36.8 
 
 		 265 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  38.49 
 
 		 272 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  39.7 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  36 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  37.69 
 
 		 269 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 266 aa  159  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  34.83 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  37.69 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  34.41 
 
 		 273 aa  152  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  34.1 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  33.81 
 
 		 278 aa  149  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  37.69 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3538  transglutaminase domain-containing protein  32.06 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.802983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  34.05 
 
 		 270 aa  139  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  36.13 
 
 		 263 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  30.11 
 
 		 265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  31.48 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  32.09 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  32.48 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  31.2 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  34.53 
 
 		 292 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  32.97 
 
 		 266 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0677  hypothetical protein  30.12 
 
 		 318 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1779  hypothetical protein  30.12 
 
 		 318 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.605837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2054  transglutaminase-like superfamily protein  30.12 
 
 		 318 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  28.17 
 
 		 308 aa  122  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0771  hypothetical protein  30.12 
 
 		 318 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.807842  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2039  hypothetical protein  30.12 
 
 		 318 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.254849  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1064  hypothetical protein  30.12 
 
 		 318 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  30.83 
 
 		 259 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0768  hypothetical protein  30.12 
 
 		 318 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  33.09 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  31.14 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  32.48 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  31.09 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  32.48 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1920  transglutaminase-like domain-containing protein  29.38 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  30.71 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  32.17 
 
 		 281 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  31.11 
 
 		 273 aa  115  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  30.36 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  31.54 
 
 		 268 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  30.83 
 
 		 259 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  28.62 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  27.3 
 
 		 304 aa  109  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  28.88 
 
 		 273 aa  109  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  27.92 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  28.52 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  29.45 
 
 		 272 aa  106  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  30.82 
 
 		 293 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  31.45 
 
 		 288 aa  105  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  26.44 
 
 		 291 aa  105  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  29.71 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  28.67 
 
 		 323 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  30.39 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  29.47 
 
 		 316 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  32.87 
 
 		 291 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  24.92 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  29.7 
 
 		 259 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  26.21 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0045  transglutaminase-like protein  32.4 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  29.29 
 
 		 273 aa  100  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2249  transglutaminase domain protein  27.3 
 
 		 300 aa  98.6  9e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  24.83 
 
 		 293 aa  98.6  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2469  transglutaminase domain-containing protein  27.8 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.451679 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2361  transglutaminase domain-containing protein  28.26 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2322  transglutaminase-like protein  28.62 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65050  hypothetical protein  27.89 
 
 		 311 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00894338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2369  transglutaminase domain-containing protein  28.62 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  31.12 
 
 		 294 aa  96.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  28.52 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  28.28 
 
 		 293 aa  96.3  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  28.42 
 
 		 654 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12589  hypothetical protein  28.32 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  28.93 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3097  hypothetical protein  28.18 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4004  transglutaminase domain-containing protein  27.94 
 
 		 334 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.218888  normal  0.154625 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1220  transglutaminase domain-containing protein  27.13 
 
 		 307 aa  94  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.826592  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5652  hypothetical protein  29.29 
 
 		 311 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  26.26 
 
 		 308 aa  93.6  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  25.36 
 
 		 296 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  27.24 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  25.36 
 
 		 297 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  28.19 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3031  transglutaminase domain-containing protein  25.42 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>