211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0315 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0315  regulatory protein, IclR  100 
 
 		 279 aa  566  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3258  IclR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1596  regulatory proteins, IclR  32.05 
 
 		 241 aa  113  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134859 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1798  regulatory protein IclR  31.78 
 
 		 279 aa  106  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6484  regulatory protein, IclR  28.87 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476341  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5307  IclR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144609  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1566  IclR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.207708  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1557  transcriptional regulator, putative  30.98 
 
 		 264 aa  93.2  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149561  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5401  IclR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 260 aa  92.8  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1527  regulatory proteins, IclR  26.88 
 
 		 257 aa  89.7  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0605  regulatory proteins, IclR  28.39 
 
 		 243 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5040  transcriptional regulator, IclR family  26.84 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3872  regulatory protein, IclR  26.67 
 
 		 245 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.207868  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4517  regulatory protein, IclR  27.87 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530625  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4716  transcriptional regulator, IclR family  28.27 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0152  IclR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957112  normal  0.234996 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5506  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4766  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5355  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2600  IclR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.248836 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4394  IclR family transcriptional regulator family  26.67 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1572  IclR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0370671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3866  IclR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1811  regulatory proteins, IclR  26.12 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1587  IclR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236869  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1642  IclR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 247 aa  62  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1568  IclR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  26.15 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  25.47 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  24.59 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3621  regulatory protein, IclR  25.83 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  26.15 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1189  IclR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1669  IclR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4014  regulatory proteins, IclR  25 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4817  IclR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.384435 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  23.85 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  29.67 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  23.37 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  24.9 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  23.58 
 
 		 281 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2460  transcriptional regulator, IclR family  24.4 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  26.42 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  24.29 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  25.61 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  24.07 
 
 		 280 aa  53.1  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  24.07 
 
 		 280 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  24.07 
 
 		 280 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  27.75 
 
 		 251 aa  52.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2255  transcription regulator protein  23.73 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0349  IclR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000127041  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  24.32 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6149  IclR family transcriptional regulator  19.51 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.508102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  24.34 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5473  regulatory protein IclR  25.84 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  22.38 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  21.12 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3721  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  22.92 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1174  transcriptional regulator, IclR family  23.39 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4910  IclR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  26.27 
 
 		 251 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0417  IclR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0284942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  23.63 
 
 		 267 aa  50.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0233  transcriptional regulator PcaR  25.23 
 
 		 281 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  22.73 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  22.06 
 
 		 251 aa  49.7  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2967  IclR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 276 aa  49.7  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  23.22 
 
 		 277 aa  49.7  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  23.61 
 
 		 255 aa  49.7  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01930  transcriptional regulator PcaR  23.94 
 
 		 279 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.676687 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  25.88 
 
 		 262 aa  49.7  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5091  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  24.26 
 
 		 269 aa  49.3  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  25.81 
 
 		 254 aa  49.3  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  27.62 
 
 		 267 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0601  putative transcriptional regulator PcaR  22.73 
 
 		 256 aa  49.3  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  24.3 
 
 		 257 aa  49.3  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  26.63 
 
 		 287 aa  48.9  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 291 aa  48.9  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2267  IclR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 288 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  21.16 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6121  transcriptional regulator IclR family  20.6 
 
 		 268 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  20.6 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1042  IclR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 261 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00956933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1785  IclR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0314  transcriptional regulator IclR-like protein  23.83 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196437  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>