More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_15680 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_15680  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 307 aa  600  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5224  methionyl-tRNA formyltransferase  74.27 
 
 		 310 aa  448  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2825  methionyl-tRNA formyltransferase  68.3 
 
 		 309 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  67.97 
 
 		 309 aa  397  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0854  methionyl-tRNA formyltransferase  67.75 
 
 		 311 aa  398  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0108509  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  67 
 
 		 308 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  68 
 
 		 311 aa  391  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  65.36 
 
 		 308 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1862  methionyl-tRNA formyltransferase  64.5 
 
 		 308 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3190  methionyl-tRNA formyltransferase  60.44 
 
 		 337 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000305844  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  66.99 
 
 		 310 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2442  methionyl-tRNA formyltransferase  62.21 
 
 		 316 aa  367  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  59.5 
 
 		 324 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2575  methionyl-tRNA formyltransferase  61.62 
 
 		 308 aa  352  4e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0532653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3099  methionyl-tRNA formyltransferase  60.77 
 
 		 315 aa  350  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2567  methionyl-tRNA formyltransferase  65.79 
 
 		 311 aa  349  4e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296174  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2687  methionyl-tRNA formyltransferase  62.25 
 
 		 310 aa  349  4e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3730  methionyl-tRNA formyltransferase  63.61 
 
 		 310 aa  346  3e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.132882  normal  0.0191381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2424  methionyl-tRNA formyltransferase  65.78 
 
 		 308 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0902213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  65.78 
 
 		 308 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0196795  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2430  methionyl-tRNA formyltransferase  65.78 
 
 		 308 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4156  methionyl-tRNA formyltransferase  61.76 
 
 		 307 aa  341  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.413206  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3119  methionyl-tRNA formyltransferase  61.76 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  60.59 
 
 		 306 aa  339  4e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18090  methionyl-tRNA formyltransferase  62.01 
 
 		 315 aa  334  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  60.26 
 
 		 319 aa  330  2e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2350  methionyl-tRNA formyltransferase  58.25 
 
 		 313 aa  324  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11435  methionyl-tRNA formyltransferase  59.55 
 
 		 312 aa  322  7e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.406209 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1722  methionyl-tRNA formyltransferase  61.31 
 
 		 318 aa  317  2e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000240612  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12770  methionyl-tRNA formyltransferase  53.35 
 
 		 336 aa  308  6.999999999999999e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.348945  normal  0.0208178 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  54.79 
 
 		 306 aa  300  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  55.33 
 
 		 311 aa  296  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1671  methionyl-tRNA formyltransferase  57.43 
 
 		 306 aa  293  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563662  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  51.47 
 
 		 317 aa  286  4e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1313  methionyl-tRNA formyltransferase  54.19 
 
 		 311 aa  278  6e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.141722 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1966  methionyl-tRNA formyltransferase  45.37 
 
 		 328 aa  255  5e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.417449  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  47.3 
 
 		 327 aa  243  3e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  42.39 
 
 		 312 aa  229  6e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10800  methionyl-tRNA formyltransferase  46.89 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0126989  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  38.44 
 
 		 311 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 		 311 aa  211  9e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  42.95 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  47.52 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  41.37 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  42.52 
 
 		 308 aa  202  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  38.21 
 
 		 312 aa  202  5e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  37.54 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  42 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  41.67 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  40.33 
 
 		 319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1572  methionyl-tRNA formyltransferase  36.67 
 
 		 332 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0058  methionyl-tRNA formyltransferase  41.99 
 
 		 311 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.820848  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  36.88 
 
 		 314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  35.06 
 
 		 309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  37.66 
 
 		 312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  38.41 
 
 		 326 aa  199  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  40.91 
 
 		 312 aa  199  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  40.45 
 
 		 307 aa  198  7.999999999999999e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1548  methionyl-tRNA formyltransferase  36.97 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  40.33 
 
 		 310 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  38.11 
 
 		 311 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  44.19 
 
 		 310 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  40.33 
 
 		 310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  40.33 
 
 		 310 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  39.32 
 
 		 314 aa  195  8.000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  39.32 
 
 		 314 aa  195  8.000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0674  methionyl-tRNA formyltransferase  40.58 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0626  methionyl-tRNA formyltransferase  41.35 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  36.89 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  43.13 
 
 		 325 aa  192  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  40.71 
 
 		 311 aa  192  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0080  methionyl-tRNA formyltransferase  40.72 
 
 		 310 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  35.9 
 
 		 314 aa  191  9e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  40.33 
 
 		 310 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  41.04 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0164  methionyl-tRNA formyltransferase  40.72 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  41.04 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  41.12 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2040  methionyl-tRNA formyltransferase  42.29 
 
 		 369 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  36.48 
 
 		 317 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  36.27 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  42.9 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  42.42 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  39.67 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  39.67 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  40.98 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  38.76 
 
 		 317 aa  189  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  39.67 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  39.67 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  39.67 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  39.74 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  39.09 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  40.27 
 
 		 311 aa  189  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  39.33 
 
 		 315 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  37.63 
 
 		 321 aa  189  5.999999999999999e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  39.12 
 
 		 321 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  42.21 
 
 		 308 aa  189  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  40.97 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>