143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3161 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  100 
 
 		 281 aa  556  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  82.56 
 
 		 276 aa  397  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  40.46 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  41.99 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  36.9 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  37.04 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  36.92 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  41.18 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  36.89 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  36.32 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  32.31 
 
 		 282 aa  115  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  32.49 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  34.93 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  36.17 
 
 		 311 aa  112  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  37.99 
 
 		 222 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  33.71 
 
 		 302 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  35.93 
 
 		 283 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  31.06 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0516  lipase class 2  34.86 
 
 		 289 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  31.63 
 
 		 342 aa  92.8  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  30.37 
 
 		 206 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4818  lipase class 2  35.29 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2701  lipase, class 2  32.57 
 
 		 573 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4601  hypothetical protein  28.29 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32995  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  31.52 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  29.95 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  29.67 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3012  lipase class 2  29.86 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08500  conserved hypothetical protein  30.93 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.992333  normal  0.426408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1553  lipase class 2  39.62 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0129405  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  28.1 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  28 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  27.62 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  33.17 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  30.56 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  35.76 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0929  lipase family protein  30.69 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0582  lipase class 2  29.82 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  30.22 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1028  lipase family protein  31.58 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.508866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  25 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10581  lipase family protein  27.49 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.565491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  28.16 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  28.16 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  29.41 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  33.73 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  24.21 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  33.73 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  33.13 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  23.76 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  30.05 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  30.05 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0661  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  30.65 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  24.29 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  34.68 
 
 		 364 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18471  lipase family protein  31.25 
 
 		 206 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.812999 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  34.68 
 
 		 341 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  34.68 
 
 		 360 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  34.68 
 
 		 360 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  30.77 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.69 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  34.68 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  30.77 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  28.66 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  32.84 
 
 		 364 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  32.24 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0840  PGAP1 family protein  30.33 
 
 		 414 aa  55.5  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00684645  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  33.33 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1781  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold  39.58 
 
 		 403 aa  53.9  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.101415  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  33.33 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  26.63 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  36.79 
 
 		 191 aa  53.5  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  27.68 
 
 		 194 aa  53.1  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  35.16 
 
 		 2169 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  33.33 
 
 		 364 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  33.33 
 
 		 364 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  30.37 
 
 		 364 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  33.33 
 
 		 364 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  39.77 
 
 		 367 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  30.43 
 
 		 367 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  33.33 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  39.77 
 
 		 367 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  39.77 
 
 		 367 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  39.77 
 
 		 367 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  33.33 
 
 		 364 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  30.65 
 
 		 332 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  39.77 
 
 		 367 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  30.52 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  31.9 
 
 		 377 aa  50.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  31 
 
 		 430 aa  50.4  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  39.77 
 
 		 367 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  39.77 
 
 		 367 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4244  putative lipase transmembrane protein  28.44 
 
 		 327 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1839  hypothetical protein  35.29 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.028666 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  30.22 
 
 		 255 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1154  hypothetical protein  34.21 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  30.54 
 
 		 357 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  30.95 
 
 		 309 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  24.68 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>