217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2534 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  100 
 
 		 417 aa  774    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2714  major facilitator transporter  88.12 
 
 		 404 aa  548  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.773773  hitchhiker  0.00188089 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  80.73 
 
 		 404 aa  532  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  51.92 
 
 		 388 aa  327  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  46.06 
 
 		 427 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  46.55 
 
 		 413 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3179  major facilitator superfamily MFS_1  49.62 
 
 		 413 aa  274  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  47.62 
 
 		 400 aa  270  5e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3025  major facilitator transporter  45.98 
 
 		 433 aa  261  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3917  major facilitator superfamily MFS_1  46.65 
 
 		 397 aa  252  7e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  46.54 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  50.82 
 
 		 409 aa  249  9e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2737  major facilitator superfamily MFS_1  47.54 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  41.65 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  41.62 
 
 		 464 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1875  hypothetical protein  34.96 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3079  major facilitator transporter  35.23 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284057  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  38.03 
 
 		 402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  38.3 
 
 		 402 aa  220  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  38.03 
 
 		 402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  38.03 
 
 		 402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  38.03 
 
 		 402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  38.03 
 
 		 402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 404 aa  220  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  38.03 
 
 		 402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2689  major facilitator superfamily MFS_1  47.36 
 
 		 433 aa  220  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  44.39 
 
 		 433 aa  219  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 402 aa  219  7e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  39.53 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  37.93 
 
 		 403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  37.93 
 
 		 403 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3376  hypothetical protein  33.16 
 
 		 397 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3180  major facilitator superfamily MFS_1  42.3 
 
 		 446 aa  213  4.9999999999999996e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  38.3 
 
 		 403 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  38.3 
 
 		 403 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 375 aa  213  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  38.3 
 
 		 403 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3154  hypothetical protein  33.25 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000811574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3401  hypothetical protein  33.25 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0773641  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0049  major facilitator superfamily MFS_1  37.59 
 
 		 480 aa  208  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200181  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  38.17 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3874  major facilitator superfamily MFS_1  49.42 
 
 		 397 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.369996  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  38.84 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0565  major facilitator superfamily MFS_1  36.76 
 
 		 443 aa  196  5.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07710  Major Facilitator Superfamily transporter  33.91 
 
 		 502 aa  195  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.18857  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18420  fucose permease  37.53 
 
 		 414 aa  194  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.29199 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  36.69 
 
 		 390 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3724  major facilitator superfamily MFS_1  39.68 
 
 		 391 aa  182  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.830199  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  31.66 
 
 		 398 aa  179  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  31.66 
 
 		 401 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0704  integral membrane protein  39.62 
 
 		 282 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.64582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  32.28 
 
 		 384 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  36.34 
 
 		 398 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 		 385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 		 381 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 388 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 		 465 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3048  sugar (and other) transporter, C-terminal region  39.02 
 
 		 182 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00412524  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 388 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  32.46 
 
 		 394 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  30.41 
 
 		 432 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  27.94 
 
 		 397 aa  126  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 387 aa  126  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 394 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  34.92 
 
 		 391 aa  123  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 386 aa  123  7e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  37.06 
 
 		 470 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 396 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  31.79 
 
 		 417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 		 379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  33.06 
 
 		 383 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  32.22 
 
 		 383 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 397 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  30.81 
 
 		 447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  34.7 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 408 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 		 392 aa  113  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 403 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 		 402 aa  112  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  29.67 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 411 aa  111  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>