More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2234 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  517  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  96.08 
 
 		 255 aa  483  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  76.99 
 
 		 256 aa  387  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  69.71 
 
 		 455 aa  349  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  69.92 
 
 		 266 aa  347  8e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  72.08 
 
 		 256 aa  347  8e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  69.83 
 
 		 264 aa  346  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  71.73 
 
 		 247 aa  343  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  68.07 
 
 		 250 aa  342  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  76.11 
 
 		 257 aa  340  1e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  71.81 
 
 		 445 aa  334  7e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  67.08 
 
 		 262 aa  332  3e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  66.11 
 
 		 277 aa  331  7.000000000000001e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  64.03 
 
 		 277 aa  326  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  64.44 
 
 		 255 aa  326  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  64.63 
 
 		 253 aa  323  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  63.71 
 
 		 291 aa  321  8e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  63.93 
 
 		 258 aa  319  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  66.96 
 
 		 268 aa  317  1e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  67.25 
 
 		 255 aa  315  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  62.71 
 
 		 258 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  62.04 
 
 		 271 aa  312  3.9999999999999997e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  62.98 
 
 		 280 aa  311  4.999999999999999e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  59.69 
 
 		 274 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  67.09 
 
 		 258 aa  308  5e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  61.11 
 
 		 258 aa  307  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  60.85 
 
 		 263 aa  306  3e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  64.47 
 
 		 253 aa  305  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  62.65 
 
 		 258 aa  304  9.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  61.92 
 
 		 259 aa  304  1.0000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  62.01 
 
 		 279 aa  301  5.000000000000001e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  63.2 
 
 		 252 aa  300  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  62.61 
 
 		 247 aa  299  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  63.48 
 
 		 264 aa  297  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  62.28 
 
 		 261 aa  296  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  59.66 
 
 		 288 aa  291  5e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  61.97 
 
 		 302 aa  291  8e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  61.83 
 
 		 312 aa  287  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  59.58 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  63.39 
 
 		 244 aa  283  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  59.11 
 
 		 279 aa  281  6.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  62.55 
 
 		 255 aa  278  8e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  59.21 
 
 		 256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  61.75 
 
 		 250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  56.28 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  54.96 
 
 		 255 aa  268  7e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  54.43 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  54.62 
 
 		 243 aa  265  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  58.62 
 
 		 293 aa  264  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  59.35 
 
 		 245 aa  263  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  54.85 
 
 		 245 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  55.84 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  55.84 
 
 		 266 aa  256  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  55 
 
 		 249 aa  250  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  52.59 
 
 		 243 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  49.54 
 
 		 230 aa  244  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  52.1 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  58.01 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  57.58 
 
 		 241 aa  241  9e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  56.9 
 
 		 249 aa  241  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  53.91 
 
 		 244 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  50.64 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  51.28 
 
 		 279 aa  234  7e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  55.07 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  50.88 
 
 		 240 aa  231  9e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  53.95 
 
 		 224 aa  229  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  46.79 
 
 		 228 aa  229  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  59.57 
 
 		 249 aa  227  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.74 
 
 		 269 aa  228  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  51.21 
 
 		 247 aa  226  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  53.02 
 
 		 248 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  50 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  47.17 
 
 		 229 aa  215  5.9999999999999996e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  47.56 
 
 		 227 aa  214  8e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  47.09 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  46.79 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  47.25 
 
 		 227 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  52.86 
 
 		 247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  46.05 
 
 		 225 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  50.93 
 
 		 238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  46.33 
 
 		 234 aa  211  7e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  49.05 
 
 		 225 aa  211  7.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2319  ABC transporter related  51.16 
 
 		 245 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  46.79 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  48.05 
 
 		 241 aa  210  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  49.12 
 
 		 657 aa  209  4e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  48.64 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  44.7 
 
 		 286 aa  209  5e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  45.62 
 
 		 319 aa  207  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  48.25 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  44.89 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  45.58 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  52.63 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3418  ABC transporter-related protein  43.43 
 
 		 266 aa  206  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0483067  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  49.76 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  46.52 
 
 		 658 aa  206  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.33 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  47.27 
 
 		 231 aa  206  4e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  48.6 
 
 		 222 aa  206  4e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  46.54 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>