More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0208 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  533  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  89.82 
 
 		 402 aa  409  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  41.61 
 
 		 432 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  41.7 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  39.22 
 
 		 421 aa  161  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  37.72 
 
 		 416 aa  155  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  41.85 
 
 		 415 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  36.65 
 
 		 414 aa  143  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  41.01 
 
 		 420 aa  143  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  41.91 
 
 		 435 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  44.71 
 
 		 432 aa  139  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  42.63 
 
 		 425 aa  138  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 456 aa  137  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  36.76 
 
 		 451 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  37.23 
 
 		 429 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  37.54 
 
 		 426 aa  135  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  43.31 
 
 		 408 aa  135  9e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 434 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  38.52 
 
 		 411 aa  132  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 		 439 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  40.15 
 
 		 442 aa  126  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  35.98 
 
 		 416 aa  125  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  37.69 
 
 		 418 aa  125  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  37.59 
 
 		 411 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  40.16 
 
 		 427 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  37.32 
 
 		 406 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  40.96 
 
 		 467 aa  105  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  31.89 
 
 		 418 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  31.89 
 
 		 418 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  31.89 
 
 		 417 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  31.89 
 
 		 417 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  31.89 
 
 		 418 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 397 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  31.89 
 
 		 397 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 		 461 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1968  major facilitator superfamily MFS_1  38.95 
 
 		 405 aa  99.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000336752  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 410 aa  98.6  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 420 aa  95.9  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 		 420 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 405 aa  92.8  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 405 aa  92.8  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 447 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 426 aa  85.9  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  29.86 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  31.82 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 432 aa  82.4  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 417 aa  75.9  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  21.28 
 
 		 421 aa  72.8  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 414 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  30 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 442 aa  70.1  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 401 aa  69.3  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 436 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  23.66 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  32.01 
 
 		 450 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  28.52 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 416 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 416 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  23.19 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 		 433 aa  66.6  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 431 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2483  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  23.3 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 		 416 aa  66.2  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 441 aa  65.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  28.18 
 
 		 530 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5468  protein of unknown function DUF894 DitE  30.15 
 
 		 535 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  27.78 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 		 423 aa  62.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  21.27 
 
 		 410 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 416 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  21.43 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  25.09 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  31.58 
 
 		 526 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  21.01 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  22.1 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0189  hypothetical protein  33.1 
 
 		 539 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  30.51 
 
 		 549 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>