80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2393 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 
191 aa  381  1e-105  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  96.89 
 
 
193 aa  370  1e-102  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  91.67 
 
 
192 aa  353  5.999999999999999e-97  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  90.1 
 
 
192 aa  353  8.999999999999999e-97  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  88.54 
 
 
192 aa  346  1e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  88.02 
 
 
195 aa  340  7e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  89.64 
 
 
194 aa  338  2.9999999999999998e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  86.01 
 
 
193 aa  329  1e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  45.5 
 
 
229 aa  155  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  45.5 
 
 
229 aa  155  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  46 
 
 
229 aa  152  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  45.41 
 
 
215 aa  149  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  43.84 
 
 
213 aa  149  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  43.84 
 
 
213 aa  149  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  41.75 
 
 
222 aa  142  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  44.44 
 
 
197 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  43.15 
 
 
216 aa  135  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  45.99 
 
 
195 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  44.92 
 
 
195 aa  133  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  44.51 
 
 
202 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  42.13 
 
 
216 aa  132  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  42.64 
 
 
216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  42.64 
 
 
216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  41.12 
 
 
244 aa  131  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  44.39 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  41.62 
 
 
216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  41.12 
 
 
216 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  39.23 
 
 
195 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  37.57 
 
 
209 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  36 
 
 
219 aa  122  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  39.06 
 
 
216 aa  120  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  39.9 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  36.5 
 
 
219 aa  118  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  37.95 
 
 
207 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  35.48 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  37.76 
 
 
197 aa  111  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  37.17 
 
 
215 aa  108  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  37.17 
 
 
215 aa  108  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  33.68 
 
 
208 aa  101  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  41.61 
 
 
209 aa  101  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  31.18 
 
 
203 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  31.18 
 
 
203 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  37.37 
 
 
196 aa  99.4  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  32.35 
 
 
201 aa  98.2  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  32.64 
 
 
208 aa  97.1  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  36.67 
 
 
222 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  36.11 
 
 
222 aa  95.9  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  35.86 
 
 
201 aa  94.7  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  36.93 
 
 
219 aa  94.4  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  36.26 
 
 
222 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  36.61 
 
 
209 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  37.1 
 
 
195 aa  93.6  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  33.89 
 
 
196 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  31.77 
 
 
206 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  31.77 
 
 
206 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  38.35 
 
 
193 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  32.58 
 
 
190 aa  84.7  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  30.15 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  32.57 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  32.57 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  38.69 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  32.57 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  30.68 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  33.8 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  36.92 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  30.54 
 
 
182 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  33.1 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  29.29 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  32.82 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  34.17 
 
 
162 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  35.61 
 
 
148 aa  62  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  36.78 
 
 
116 aa  61.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  33.87 
 
 
295 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2288  site-specific integrase-resolvase-like protein  37.68 
 
 
69 aa  47.8  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  36.07 
 
 
74 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  36.07 
 
 
74 aa  46.2  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1426  site-specific integrase-resolvase-like protein  38.33 
 
 
81 aa  45.4  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.765769  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  33.33 
 
 
137 aa  45.1  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0196  putative site-specific integrase-resolvase, degenerate  39.34 
 
 
63 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000193839  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3461  regulatory protein, MerR  33.33 
 
 
128 aa  42  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>