More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2370 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2370  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 474 aa  918    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  66.09 
 
 		 470 aa  630  1e-179  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 491 aa  296  7e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.632276 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  34.49 
 
 		 487 aa  287  2e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 502 aa  267  2.9999999999999995e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 471 aa  263  3e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 473 aa  262  1e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 		 475 aa  236  6e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 		 472 aa  228  2e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  28.63 
 
 		 477 aa  218  2e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 477 aa  216  9e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 473 aa  189  8e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 		 494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 523 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  25.17 
 
 		 485 aa  141  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 503 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  22.85 
 
 		 506 aa  136  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0464  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 450 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 643 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  28.04 
 
 		 643 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 643 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  22.03 
 
 		 499 aa  130  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 457 aa  129  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 482 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 491 aa  124  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 		 494 aa  121  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 488 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  23.37 
 
 		 678 aa  120  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 474 aa  120  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  21.59 
 
 		 482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.4 
 
 		 561 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 		 484 aa  116  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  22.36 
 
 		 487 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.99 
 
 		 579 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.49 
 
 		 522 aa  114  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  24.62 
 
 		 492 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.72 
 
 		 534 aa  113  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.02 
 
 		 449 aa  113  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.26 
 
 		 496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 504 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 517 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 492 aa  111  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.33 
 
 		 514 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2662  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 531 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2771  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 531 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.17 
 
 		 524 aa  109  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0714  antibiotic resistance (efflux) protein, conjectural  40.68 
 
 		 140 aa  108  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.311349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2133  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 531 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518616  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2745  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 531 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.31 
 
 		 484 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6073  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 531 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.31 
 
 		 478 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.02 
 
 		 541 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.06 
 
 		 478 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.44 
 
 		 528 aa  107  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  23.23 
 
 		 512 aa  106  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.81 
 
 		 515 aa  106  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.38 
 
 		 538 aa  106  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 462 aa  106  9e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1574  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 565 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000345614  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  22.75 
 
 		 650 aa  106  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.9 
 
 		 680 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1911  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.44 
 
 		 585 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.89 
 
 		 565 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1670  multidrug resistance protein B  27.83 
 
 		 582 aa  105  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1646  multidrug ABC transporter, permease  27.36 
 
 		 582 aa  105  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2304  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  25.66 
 
 		 549 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.8 
 
 		 539 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 474 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2775  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  25.54 
 
 		 531 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.847673  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0173  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.54 
 
 		 531 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.66 
 
 		 549 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2384  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  25.54 
 
 		 531 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5749  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.55 
 
 		 607 aa  104  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2795  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 531 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0653  putative multidrug transporter  25.54 
 
 		 531 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.433513  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0669  putative multidrug transporter  25.54 
 
 		 531 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.11 
 
 		 510 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1947  multidrug ABC transporter, permease  28.13 
 
 		 582 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.128457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3511  multidrug resistance protein B  27.91 
 
 		 582 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.69 
 
 		 520 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.55 
 
 		 520 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  25.57 
 
 		 497 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0541  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.46 
 
 		 549 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.69 
 
 		 520 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.69 
 
 		 520 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1857  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 566 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.906774  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.87 
 
 		 520 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.87 
 
 		 520 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.69 
 
 		 520 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.38 
 
 		 521 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.32 
 
 		 513 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.69 
 
 		 520 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2303  major facilitator superfamily MFS_1  22.01 
 
 		 463 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.32 
 
 		 513 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.57 
 
 		 537 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.69 
 
 		 520 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1059  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.25 
 
 		 513 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186181  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0637  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.75 
 
 		 531 aa  101  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.57 
 
 		 519 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>