More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1857 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1857  major facilitator transporter  100 
 
 		 566 aa  1126    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.906774  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1574  major facilitator transporter  96.63 
 
 		 565 aa  1083    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000345614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.96 
 
 		 590 aa  547  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2800  major facilitator superfamily MFS_1  43.29 
 
 		 586 aa  492  9.999999999999999e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0579957  hitchhiker  0.00000851422 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13540  arabinose efflux permease family protein  37.12 
 
 		 463 aa  318  2e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23950  arabinose efflux permease family protein  38.21 
 
 		 456 aa  294  3e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.297919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2058  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 471 aa  189  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.844529 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0420  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  30.19 
 
 		 507 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  30.41 
 
 		 507 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.92 
 
 		 480 aa  177  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.28 
 
 		 478 aa  169  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.2 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.2 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.48 
 
 		 511 aa  169  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  28.32 
 
 		 1062 aa  169  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  29.28 
 
 		 478 aa  169  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.28 
 
 		 513 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  29.07 
 
 		 478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.28 
 
 		 513 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1176  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 450 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.52 
 
 		 511 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.28 
 
 		 479 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  30.28 
 
 		 513 aa  166  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.28 
 
 		 479 aa  166  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.28 
 
 		 513 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  30.28 
 
 		 513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.24 
 
 		 469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.63 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.89 
 
 		 511 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  30.97 
 
 		 511 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.84 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.89 
 
 		 511 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.63 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.89 
 
 		 511 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.84 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.23 
 
 		 511 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 513 aa  163  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  26.71 
 
 		 511 aa  163  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2928  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.33 
 
 		 511 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000585053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2894  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.59 
 
 		 511 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0578631  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.1 
 
 		 615 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.14 
 
 		 476 aa  158  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2351  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.83 
 
 		 504 aa  158  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500074  normal  0.144653 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.53 
 
 		 493 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.96 
 
 		 541 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3511  multidrug resistance protein B  29.09 
 
 		 582 aa  156  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.02 
 
 		 475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.2 
 
 		 545 aa  153  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.7 
 
 		 431 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1911  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.17 
 
 		 585 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1947  multidrug ABC transporter, permease  29.74 
 
 		 582 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.128457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.85 
 
 		 538 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1670  multidrug resistance protein B  29.43 
 
 		 582 aa  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11549  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.77 
 
 		 579 aa  151  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.02 
 
 		 539 aa  151  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1646  multidrug ABC transporter, permease  29.43 
 
 		 582 aa  151  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.87 
 
 		 512 aa  150  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.2 
 
 		 514 aa  150  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.37 
 
 		 565 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.29 
 
 		 500 aa  148  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1102  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 512 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000316091 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.72 
 
 		 523 aa  147  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.65 
 
 		 511 aa  147  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.88 
 
 		 538 aa  146  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  26.23 
 
 		 537 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.33 
 
 		 680 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3948  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.33 
 
 		 524 aa  146  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448257  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.94 
 
 		 609 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.35 
 
 		 509 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.97 
 
 		 491 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.34 
 
 		 555 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  29.49 
 
 		 462 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.11 
 
 		 697 aa  145  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  28 
 
 		 467 aa  144  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.71 
 
 		 508 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.06 
 
 		 685 aa  144  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  26.06 
 
 		 537 aa  144  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.15 
 
 		 505 aa  143  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.78 
 
 		 682 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.78 
 
 		 682 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.99 
 
 		 682 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.75 
 
 		 500 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.76 
 
 		 537 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.95 
 
 		 482 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.48 
 
 		 528 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.78 
 
 		 539 aa  141  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  25.58 
 
 		 537 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
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NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  32.56 
 
 		 487 aa  140  4.999999999999999e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
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NC_008528  OEOE_0759  major facilitator superfamily permease  27.83 
 
 		 554 aa  140  6e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000977825  n/a   
 
 
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NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.17 
 
 		 482 aa  140  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
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CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.91 
 
 		 471 aa  140  7.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.17 
 
 		 504 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.31 
 
 		 524 aa  139  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.07 
 
 		 539 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
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NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.88 
 
 		 678 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  25.63 
 
 		 537 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  25.63 
 
 		 537 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.83 
 
 		 478 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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