More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2058 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  87.02 
 
 		 474 aa  752    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2058  major facilitator transporter  100 
 
 		 471 aa  887    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.844529 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0420  major facilitator superfamily MFS_1  61.3 
 
 		 460 aa  451  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1176  major facilitator superfamily MFS_1  36.66 
 
 		 450 aa  259  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1857  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 566 aa  233  5e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.906774  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.53 
 
 		 590 aa  230  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1574  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 565 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000345614  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2800  major facilitator superfamily MFS_1  36.24 
 
 		 586 aa  214  3.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0579957  hitchhiker  0.00000851422 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.85 
 
 		 539 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.73 
 
 		 511 aa  168  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.15 
 
 		 538 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.91 
 
 		 697 aa  167  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.25 
 
 		 513 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.25 
 
 		 513 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  27.25 
 
 		 513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  27.25 
 
 		 513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.25 
 
 		 513 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.11 
 
 		 592 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.25 
 
 		 513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.63 
 
 		 685 aa  165  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13540  arabinose efflux permease family protein  29.35 
 
 		 463 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.82 
 
 		 505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.25 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.09 
 
 		 621 aa  164  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.27 
 
 		 541 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.83 
 
 		 513 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.29 
 
 		 522 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.07 
 
 		 513 aa  163  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.7 
 
 		 513 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1011  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.72 
 
 		 522 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5055  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.74 
 
 		 522 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.08 
 
 		 680 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.2 
 
 		 676 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.69 
 
 		 682 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.69 
 
 		 682 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.69 
 
 		 682 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  27.91 
 
 		 507 aa  159  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3948  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.63 
 
 		 524 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448257  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.76 
 
 		 685 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.57 
 
 		 528 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.68 
 
 		 615 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.49 
 
 		 562 aa  157  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.13 
 
 		 478 aa  157  5.0000000000000005e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.72 
 
 		 569 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  27.21 
 
 		 507 aa  157  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.17 
 
 		 535 aa  156  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0331  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.77 
 
 		 571 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  31.38 
 
 		 496 aa  155  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.4 
 
 		 505 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.25 
 
 		 480 aa  154  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.64 
 
 		 558 aa  153  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.770491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.32 
 
 		 641 aa  153  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.31 
 
 		 502 aa  153  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.86 
 
 		 538 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.91 
 
 		 504 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.26 
 
 		 678 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.4 
 
 		 509 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.83 
 
 		 504 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.28 
 
 		 555 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23370  arabinose efflux permease family protein  31.18 
 
 		 535 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.517259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.43 
 
 		 565 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.4 
 
 		 500 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1102  major facilitator superfamily MFS_1  33.11 
 
 		 512 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000316091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 448 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.97 
 
 		 512 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.28 
 
 		 485 aa  150  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.63 
 
 		 650 aa  150  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.86 
 
 		 530 aa  149  8e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.63 
 
 		 537 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.49 
 
 		 478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.49 
 
 		 478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.55 
 
 		 522 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  29.4 
 
 		 476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.55 
 
 		 504 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  29.34 
 
 		 467 aa  148  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  29.4 
 
 		 537 aa  148  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  27.49 
 
 		 478 aa  148  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  29.4 
 
 		 537 aa  148  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  27.49 
 
 		 478 aa  148  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  29.4 
 
 		 537 aa  148  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4396  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.57 
 
 		 526 aa  148  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.72 
 
 		 504 aa  148  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  29.4 
 
 		 537 aa  148  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.55 
 
 		 509 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.55 
 
 		 509 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.26 
 
 		 537 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.49 
 
 		 478 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.49 
 
 		 479 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
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NC_013165  Shel_23950  arabinose efflux permease family protein  29.4 
 
 		 456 aa  147  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.297919  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  31.8 
 
 		 1062 aa  147  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.49 
 
 		 479 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.51 
 
 		 534 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
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NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.38 
 
 		 482 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.61 
 
 		 498 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.25 
 
 		 505 aa  146  8.000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
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NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.4 
 
 		 476 aa  146  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.56 
 
 		 509 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
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CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.4 
 
 		 471 aa  145  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  28.7 
 
 		 537 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.57 
 
 		 567 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
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