More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6724 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6724  oxidoreductase protein  100 
 
 
380 aa  773    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.826358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  69.84 
 
 
386 aa  558  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4009  oxidoreductase domain protein  73.09 
 
 
381 aa  559  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  68.6 
 
 
384 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1086  oxidoreductase domain protein  71.97 
 
 
382 aa  532  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288482  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2017  oxidoreductase domain protein  68.6 
 
 
384 aa  533  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183817  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  67.39 
 
 
384 aa  523  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29090  predicted dehydrogenase  67.1 
 
 
387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252853  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3365  oxidoreductase domain protein  64.92 
 
 
387 aa  515  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.0569216 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2457  oxidoreductase domain-containing protein  63.16 
 
 
383 aa  507  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79412  normal  0.791445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2855  oxidoreductase domain-containing protein  63.16 
 
 
383 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3331  oxidoreductase domain-containing protein  62.6 
 
 
382 aa  491  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.782601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  62.01 
 
 
389 aa  491  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4759  oxidoreductase domain protein  62.6 
 
 
381 aa  489  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.0244054 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  61.21 
 
 
389 aa  485  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4013  oxidoreductase domain protein  60.96 
 
 
382 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4342  oxidoreductase domain protein  61.23 
 
 
382 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0507395  decreased coverage  0.00000099897 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  63.35 
 
 
387 aa  478  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0896  oxidoreductase domain protein  63.32 
 
 
388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106889  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2881  oxidoreductase domain-containing protein  60.58 
 
 
381 aa  456  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1105  oxidoreductase domain protein  57.48 
 
 
385 aa  448  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1858  oxidoreductase domain protein  57.85 
 
 
387 aa  431  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0616  oxidoreductase domain-containing protein  56.51 
 
 
387 aa  428  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  27.87 
 
 
396 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  31.71 
 
 
366 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  31.71 
 
 
366 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  31.15 
 
 
376 aa  94  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  29.91 
 
 
369 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  32.02 
 
 
388 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  26.34 
 
 
374 aa  87.8  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  29.6 
 
 
352 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  29.51 
 
 
371 aa  87  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  29.51 
 
 
371 aa  87  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  28.75 
 
 
377 aa  87  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 
366 aa  87  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  30.83 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  29.48 
 
 
378 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  30.31 
 
 
386 aa  84.3  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  30.8 
 
 
380 aa  84.7  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  30.52 
 
 
366 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  34.95 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  26.91 
 
 
379 aa  81.3  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  28.81 
 
 
399 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  29.39 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  28.15 
 
 
399 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  29.88 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  25.92 
 
 
390 aa  79  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  24.46 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  32.26 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  26.27 
 
 
386 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  26.16 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  30.89 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  26.15 
 
 
382 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  29.57 
 
 
369 aa  77.4  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  28.51 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  30.48 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  30.05 
 
 
363 aa  76.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1601  oxidoreductase domain protein  29.52 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  27.57 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  29.06 
 
 
370 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  28.29 
 
 
386 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  29.75 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  26.24 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  28.34 
 
 
375 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  28.27 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  28.51 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  29.02 
 
 
390 aa  73.2  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 
327 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0411  oxidoreductase-like  29.69 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3988  putative dehydrogenase/oxidoreductase  29.03 
 
 
365 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  29.73 
 
 
371 aa  72  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  26.1 
 
 
343 aa  72  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  31.87 
 
 
372 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  29.86 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  26.36 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  25.61 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  26.7 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  25.8 
 
 
357 aa  70.1  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  27.27 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  30.51 
 
 
360 aa  69.3  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  31.28 
 
 
378 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20460  predicted dehydrogenase  25.88 
 
 
371 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.95226 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 
388 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  36.43 
 
 
398 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  23.53 
 
 
368 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  29.89 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  26.04 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  27.66 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  24.65 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>